ЦКП

В 2014 г. в Институте организован Центр коллективного пользования «Персистенция микроорганизмов» для проведения исследований геномов и транскриптомов с использованием технологии Next Generation Sequencing. Основными направлениями деятельности ЦКП являются: обеспечение на имеющемся оборудовании проведения исследований, а также оказание услуг исследователям и научным коллективам как базовой организации, так и иным заинтересованным пользователям.

Зарегистрирован на сайте «Современная исследовательская инфраструктура Российской Федерации»  http://www.ckp-rf.ru/ckp/351815/

Основные методы исследования, реализуемые на базе ЦКП:

  • выделение ДНК и РНК из биологических объектов (растения, животные, грибы, бактерии) с применением химического лизиса и механической гомогенизации;
  •  клеточное и молекулярное клонирование;
  •  электрофорез нуклеиновых кислот и белков в геле;
  • количественная оценка концентрации нуклеиновых кислот и белков методом флюориметрии;
  • полимеразная цепная реакция, в том числе мультиплексная ПЦР и ПЦР в режиме реального времени;
  • приготовление ДНК-библиотек для NGS секвенирования;
  • NGS секвенирование на приборе MiSeq (Illumina) с целью оценки метагенома, транскриптома, полногеномного секвенирования, таргетного секвенирования ампликонов и др.;
  • жидкостная препаративная высокоэффективная хроматография органических соединений;
  • лиофильное высушивание биологических образцов, включая бактериальные культуры.

Приборная база ЦКП:

  • система для автоматического секвенирования MiSeq (Illumina, США);

  • лиофильная сушка LL 1500 (Thermo Fisher Scientific, Чехия);
  • градиентная высокоэффективная жидкостная хроматографическая система с многоволновым спектрофотометрическим детектором Smartline (Knauer, Германия);

  • центрифуга с охлаждением Universal 320 R  (Andreas Hettich GmbH & Co, Германия);
  • система для ПЦР в реальном времени MiniOpticon (BIO-RAD, Франция);

  • система документирования гелей INFINITI-3026, WL/LC/26МХ Х-Press (Vilber Lourmat, Франция);
  • а также дополнительное оборудование, находящееся на балансе Института.

Положение о Центре коллективного пользования «Персистенция микроорганизмов » ИКВС УрО РАН

Регламент предоставления услуг Центром коллективного пользования научным оборудованием «Персистенция микроорганизмов «

Перечень научного оборудования центра коллективного пользования «Персистенция микроорганизмов»

Перечень типовых услуг, оказываемых Центром коллективного пользования «Персистенция микроорганизмов » ИКВС УрО РАН, и их стоимость

Порядок расчета нестандартных услуг

Образец договора на проведение научно-исследовательских работ в ЦКП ИКВС УрО РАН для сторонних организаций

Заявка на проведение исследований и оказание услуг в ЦКП ИКВС УрО РАН