Сотрудники ИКВС УрО РАН на Радио России Оренбург

Заведующий лабораторией водной микробиологии ИКВС УрО РАН ,  д.м.н. ,  профессор  Немцева Наталия Вячеславовна и   ученый секретарь ИКВС УрО РАН,  к.м.н., доцент  Селиванова Елена Александровна приняли участие в программе  «Экологический навигатор» от 22 октября 2017 ( Радио России Оренбург). 

Запись эфира доступна по ссылке.

Три разработки ИКВС УрО РАН получили награды на выставке Биоиндустрия-2017

Три разработки Института клеточного и внутриклеточного симбиоза, выполняемые в лаборатории биомониторинга и молекулярно-генетических исследований при поддержке Фонда содействия инновациям (программа «УМНИК») и представленные на международную выставку-конкурс Биоиндустрия-2017 (http://bio.expoforum.ru/), прошедшую 11-13 октября, получили две золотые и одну серебряную медаль.
Разработки находятся на этапе прототипов и подготавливаются к массовому тестированию.

На заседании президиума УрО РАН (21 сентября 2017 г.) первым в повестке был научный доклад директора ИКВС УрО РАН члена-корреспондента С.В. Черкасова «Колонизационная резистентность организма как функция ассоциативного симбиоза»

Открывая заседание президиума УрО РАН 21 сентября, председатель Отделения академик В.Н. Чарушин напомнил, что это заседание — последнее в нынешнем составе, после предстоящих выборов произойдут перемены, и тепло поблагодарил коллег за работу. Первым в повестке был научный доклад директора Института клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН (г. Оренбург) члена-корреспондента С.В. Черкасова (на снимке слева) «Колонизационная резистентность организма как функция ассоциативного симбиоза». Высокий уровень оренбургской научной школы, основанной академиком О.В. Бухариным, хорошо известен, и наша газета неоднократно писала о ее достижениях. В докладе Сергей Викторович сосредоточился на ассоциативном симбиозе репродуктивного тракта женщин, включающего как факторы иммунитета хозяина, взаимодействующие с микроорганизмами, так доминантные лактобациллы и ассоциативные с ними микроорганизмы, имеющие существенное значение в норме и при инфекционной патологии. Оренбургские ученые показали, что нарушение биоценоза бактерий значительно влияет на течение заболеваний и на частоту рецедивов и длительность ремиссии при хронической форме. Более того, выявлено влияние бактериального биоценоза и на функции организма: по его состоянию можно с высокой долей вероятности предсказывать успех наступления беременности при экстракорпоральном оплодотворении.

Перед собравшимися выступил кандидат на должность президента РАН академик Р.И. Нигматулин (на фото слева), рассказавший о своем видении будущего Академии, роли науки в нашем обществе и задачах, которые предстоит решить сообществу.
Заместитель министра промышленности и науки Свердловской области И.Ф. Зеленкин совместно с врио директора ИЭ УрО РАН доктором экономических наук Ю.Г. Лавриковой представили проект «Стратегия промышленного и инновационного развития Свердловской области до 2035 года». Эта концепция подготовлена при активном участии Института экономики и учитывает результаты широкого обсуждения. Докладчики обратились к членам президиума как к экспертам, пообещав вынести уточненный вариант Стратегии на одно из последующих заседаний.
В числе других президиум рассмотрел вопрос о подготовке к Уральскому научному форуму, посвященному 30-летию Уральского отделения РАН и 85-летию академической науки Урала (17–20 октября, Екатеринбург). Вниманию собравшихся была представлена предварительная программа, уточнявшаяся в ходе обсуждения.
Оригинал статьи: http://uran.ru/node/5084

Третья всероссийская молодёжная научная школа-конференция с международным участием «Микробные симбиозы в природных и экспериментальных экосистемах»

В г. Оренбурге 2-6 октября 2017 года состоялась Третья всероссийская молодёжная научная школа-конференция с международным участием «Микробные симбиозы в природных и экспериментальных экосистемах», организаторами которой выступили Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН и Оренбургский научный центр УрО РАН, при финансовой поддержке Российского фонда фундаментальных исследований и ФАНО России. В работе конференции приняли участие 137 человек из 10 городов России, а также Италии и Франции.  Заслушано и обсуждено 27 устных докладов молодых ученых. В рамках конференции были прочитаны 6 лекций ведущими учеными, специалистами в области микробиологии, симбиологии, биохимии и молекулярнрй биологии из Москвы, Казани, Иркутска, Санкт-Петербурга и Оренбурга. В ходе конференции рассмотрен широкий круг общих и частных вопросов микробиологии, относящихся к проблеме микробных симбиозов, в рамках нижеследующих основных тематических разделов:

  1. Генетические и метаболические механизмы взаимодействий микроорганизмов с симбионтами.
  2. Взаимоотношения микроорганизмов с симбионтами в природных и искусственных экосистемах.
  3. Медицинские и агробиотехнологические аспекты микробных симбиозов.

Центральное место в повестке конференции заняло обсуждение фундаментальных вопросов по изучению структуры,  механизмов взаимодействия и их генетической регуляции в микробных симбиозах, оценке свойств микроорганизмов – симбионтов, созданию искусственных симбиотических систем, а также разработке новых подходов к изучению симбиозов.  Были затронуты вопросы практического использования микроводорослей, поиска новых продуцентов антибиотиков и пробиотических штаммов. Рассмотрены различные системы, где в качестве макроорганизма, участвующего в симбиотических взаимодействиях с бактериями, рассматривается человек, приматы, птицы, личинки жуков, почвенные нематоды, дикие и сельскохозяйственные растения, гетеротрофные простейшие, микроводоросли. Разнообразие симбиотических систем позволило обсудить общие закономерности формирования микробных симбиозов в природе, а также специфику, связанную с разной таксономической принадлежностью симбионтов и их хозяев.

Участники конференции активно обсуждали пленарные и секционные доклады, которые продемонстрировали разнообразие и новые примеры симбиотических систем, а также рассмотрели актуальную проблему по поиску среди множества участников симбиотической системы ключевых, обуславливающих сохранение здоровья или развитие заболевания. В рамках круглого стола как прогрессивные изменения по сравнению с предыдущей конференцией, отмечены современный уровень методических подходов, использование методов молекулярной генетики. В то же время подчеркнута роль грамотного планирования эксперимента с применением NGS. В частности, для получения достоверных результатов исследования необходимо наличие четко сформулированной задачи, в соответствии с которой должна быть подготовлена модель сбора материала и разработан дизайн эксперимента, использованы  несколько контролей (как отрицательных, так и положительных).  Были высказаны пожелания к молодым ученым осваивать основы молекулярно-генетических методов и биоинформатического анализа данных,  тщательно изучать характеристики объекта исследования и при использовании современных методик не забывать общие правила экспериментальной работы. Выступающие единодушно отметили, что симбиотические  системы надо изучать с использованием комплексного подхода с привлечением различных методов, начиная с микроскопии и заканчивая функциональной геномикой, с привлечением специалистов разного профиля, не забывая о пространственной и временной гетерогенности микробной популяции. Раскрытие закономерностей функционирования на уровне симбиотической системы с применением комплекса современных методов на сегодняшний день является актуальной и пока не решенной задачей.

После научно-презентационной части конференции для молодых ученых проведена школа «Метагеномное секвенирование микробных ассоциаций и методы биоинформатического анализа данных», включающая мастер-классы и тренинги. Материалы конференции были опубликованы в виде тезисов в сборнике. В расширенном виде материалы докладов молодых ученых будут опубликованы в Вестнике Оренбургского государственного университета, входящем в список ВАК.

В ходе обсуждения итогов конференции организаторам конференции даны рекомендации, направленные на улучшение формата и качества проведения мероприятия, в частности: создать отдельную секцию по пластичности и гетерогенности популяций симбионтов; на этапе сбора заявок формировать тематику секций с учетом пожеланий модераторов; широко освещать конференцию на этапе подготовки и привлекать большее число участников. В целом, лекторы и молодые участники оценили проведенное научное мероприятие как успешное и рекомендовали провести следующую, IV школу-конференцию «Микробные симбиозы в природных и экспериментальных экосистемах» в Оренбурге в 2020 г.

Мифы ЗОЖ: как не потерять здоровье в погоне за долголетием (и наоборот)

Совет Молодых Ученых ИКВС УрО РАН регулярно проводит мероприятия по популяризации науки: ежегодные научно-просветительские лекции для посетителей Областной универсальной научной библиотеки им. Н.К.Крупской и экскурсии по лабораториям института для старшеклассников или студентов младших курсов образовательных учреждений  биологического профиля.

2 марта 2017 г. в рамках «Краеведческого лектория» к.м.н., с.н.с. лаборатории биомониторинга и молекулярно-генетических исследований С.В.Андрющенко прочитана публичная научно-популярная медико-просветительская лекция «Мифы ЗОЖ: как не потерять здоровье в погоне за долголетием (и наоборот)» с демонстрацией актуальных материалов Комиссии по борьбе с лженаукой при Российской Академии Наук и разбором тенденций в области диетологии и профилактики, имеющих сомнительную доказательную базу («опасность» пищевых добавок, прививок, генетически модифицированных продуктов, «полезность» различных биологически активных добавок, гомеопатических средств, полного исключения из рациона продуктов животного происхождения и другие вопросы).

II Всероссийская научно-практическая конференция с элементами научной школы для молодых ученых «Эндогенные бактериальные инфекции: микробиологические и иммунологические аспекты»

В г. Оренбурге 25-27 мая 2016 года состоялась II Всероссийская научно-практическая конференция с элементами научной школы для молодых ученых «Эндогенные бактериальные инфекции: микробиологические и иммунологические аспекты».

Организаторами конференции выступили ФГБУН Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН, ФГБУН Оренбургский научный центр УрО РАН, ФГБУН Институт иммунологии и физиологии УрО РАН, ГБОУ ВПО Оренбургский государственный медицинский университет Минздрава России, Отделение физиологических наук РАН, Уральское отделение РАН, Российский фонд фундаментальных исследований и Правительство Оренбургской области.

В работе конференции приняли участие ведущие ученые микробиологи, иммунологи, хирурги, акушеры-гинекологи, терапевты, педиатры, из Екатеринбурга, Казани, Курска, Москвы, Оренбурга, Перми, Ростова-на-Дону, Самара, Санкт-Петербурга, Уфы, Челябинска, Актобе (Казахстан), Луанды (Ангола), Парижа (Франция), а также практикующие врачи разных специально-стей из лечебно-профилактических учреждений Оренбуржья (в соответствии с Распоряжением Министерства здравоохранения Оренбургской области от 19.05.2016 № 1154), Башкортостана и Ростова-на-Дону, аспиранты, интерны и ординаторы ОрГМУ, бакалавры и магистры ОГУ и ОГАУ.

Общая численность зарегистрированных участников составила 286 человек. Всем участникам конференции были выданы соответствующие Сертификаты с начисленными зачетными единицами (кредитами).

На пяти заседаниях, в том числе двух сателлитных симпозиумах, с видеофиксацией материала для демонстрации в сети Интернет, заслушано 43 пленарных доклада, а в постерной сессии представлено 27 стендовых сообщений, ориентированных на реализацию положений Программы фундаментальных научных исследований государственных академий наук на 2013-2020 годы и Стратегии развития медицинской науки в Российской Федерации до 2025 года.

В рамках конференции проведен цикл семинаров и мастер-классов для молодых ученых и специалистов, где были рассмотрены сложные вопросы диагностики, лечения и профилактики заболеваний эндогенной природы и продемонстрированы возможности современных методов иммунологических исследований (проточная цитометрия, мультиплексный анализ) в клинике и эксперименте.

В ходе работы конференции был рассмотрен широкий круг современных проблем медицинской микробиологии, иммунологии и соматической инфекционно-воспалительной патологии эндогенной природы в рамках нижеследующей тематики:

  1. Этиологические и патогенетические особенности эндогенных бактериальных инфекций; нарушения ассоциативного симбиоза и иммунодисфункции как факторы риска развития эндогенных бактериальных инфекций;
  2. Патогенный потенциал возбудителей эндогенных инфекций; молекулярно-генетические и клеточные механизмы развития эндогенных бактериальных инфекций; иммунный ответ макроорганизма на бактериальную агрессию эндомикрофлоры;
  3. Эндогенные инфекции в педиатрии: антибиотикотерапия, коррекция дисбиоза и иммунодисфункции; эдогенные инфекции урогенитального тракта и репродуктивное здоровье;
  4. Клинические и иммунологические аспекты эндогенных бактериальных инфекций; инновационные подходы к лабораторной диагностике, терапии и профилактике эндогенных бактериальных инфекций.

Центральное место в повестке конференции заняло обсуждение вопросов этиологии и патогенеза эндогенных бактериальных инфекций (ЭБИ).

В рамках конференции для молодых ученых и специалистов были проведены мастер-класс проф. А.В. Зурочки (Екатеринбург) на тему «Возможности мультиплексного анализа для оценки цитокино-продукции в системе «паразит – хозяин» при эндогенных инфекциях» и два семинара: «Современные возможности иммунологических исследований в клинике и эксперименте» и «Трансляционная биомедицина: возможности визуализирующей проточной цитометрии».

Кроме того на площадке конференции была организована экспозиция ведущих отечественных и зарубежных компаний, занимающихся обеспечением лабораторной диагностики, терапии и профилактики инфекционно-воспалительной патологии человека (Компании Beckman Coulter Life Sciences, LLC «Merck», ООО «ЛабТэк Лтд» и др.).

На Круглом столе с тематикой «Эндогенные инфекции как следствие нарушений симбиотических отношений бактерий и макроорганизма» были всесторонне обсуждены доклады и постерные сообщения, посвященные современному состоянию и перспективам решения наиболее актуальных проблем микробиологии, иммунологии и клиники эндогенных бактериальных инфекций.

В результате проведенных дискуссий, подводя итоги конференции, её участники констатировали нижеследующее.

Эндогенные бактериальные инфекции являются актуальной фундаментальной (междисциплинарной) проблемой не только медицины и ветеринарии, но и фитопатологии. У человека эндогенные бактериальные инфекции характеризуются широким распространением, хроническим (рецидивирующим) течением и разнообразием клинических форм (нозовариабельность), в связи с чем изучаются медицинскими специалистами разного профиля (терапевты, хирурги, акушеры-гинекологи, педиатры и др.), что затрудняет выявление универсальных механизмов их развития. Часто при эндогенных бактериальных инфекциях из очагов воспаления выделяются поливидовые ассоциации микроорганизмов, что затрудняет клиническую интерпретацию результатов бактериологических исследований. Недостаток знаний о причинах и механизмах развития эндогенных бактериальных инфекций тормозит разработку новых подходов к их диагностике и прогнозированию, что, в конечном итоге, обусловливает низкую эффективность терапии и профилактики данной патологии.

На основании результатов коллегиального рассмотрения современного состояния и перспектив решения различных аспектов проблемы эндогенных инфекций, участники конференции решили:

  1. Признать, что в настоящее время особую остроту и актуальность приобретает задача совершенствования научно-практического обеспечения диагностики и лечения социально-значимых заболеваний инфекционной природы, в том числе эндогенного характера.
  2. Согласиться с тем, что современное состояние эпидемиологической обстановки и мировые тенденции предотвращения биологических угроз требуют углубления и интенсификации фундаментальных и прикладных исследований по разработке подходов к мониторированию и прогнозированию эволюции возбудителей эндогенных инфекций.
  3. Считать целесообразным расширение научных исследований, направленных на решение нижеследующих актуальных комплексных медико-биологических проблем:
  • расшифровка особенностей этиологии и патогенеза эндогенных бактериальных инфекций; расшифровка триггерных факторов, способствующих формированию эндогенных бактериальных инфекций; изучение участия других небактериальных представителей микробиоты (грибы, простейшие, вирусы) различных биотопов в формировании эндогенных бактериальных инфекций;
  • получение новых данных об эпидемиологических аспектах эндогенных бактериальных инфекций с составлением реестров проблемных возбудителей ука-занных заболеваний и выделением приоритетных и «минорных» видов патогенов;
  • изучение молекулярных и генетических особенностей возбудителей эндогенных бактериальных инфекций, выявление у них наиболее типичных патогенных биопрофилей;
  • формирование банка данных о распространенности антибиотикорезистентных штаммов возбудителей эндогенных инфекций на территории Российской Федерации на основе клинико-микробиологического мониторирования; формирование национального, региональных и локальных регистров антибиотикорезистентности проблемных патогенов;
  • оценка роли межмикробных взаимодействий на молекулярном, клеточном и популяционном уровнях в развитии эндогенных бактериальных инфекций;
  • создание эффективных алгоритмов диагностики, лечения и профилактики конкретных нозологических форм данной патологии; внедрение разработок по указанному направлению в практическое здравоохранение и оценка их результативности;
  • внедрение научных результатов и практических разработок в образовательный процесс – в программы обучения студентов медицинских вузов и в циклы последипломного образования для врачей различных специальностей.

 

4. Отметить значительный вклад учреждений Уральского отделения Российской академии наук, прежде всего — ИКВС УрО РАН и ИИФ УрО РАН, в разработку иммунологических стандартов, создание алгоритмов лабораторной диагностики, терапии и профилактики инфекционных заболеваний эндогенной природы.

5. В связи с принятием Федерального закона «О Российской академии наук, реорганизации государственных академий наук и внесении изменений в отдельные законодательные акта РФ» рекомендовать Институту клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН совместно с Оренбургским государственным медицинским университетом Минздрава России и Правительством Оренбургской области (Министерство здравоохранения) начать разработку пилотной региональной целевой программы по борьбе с эндогенными бактериальными инфекциями, назначив основным ее разработчиком и координатором ИКВС УрО РАН, предусмотрев возможность бюджетного финансирования реализации такой программы, в том числе за счет областных грантов Министерства образования Оренбургской области.

6. Рекомендовать Федеральному агентству научных организаций Российской Федерации совместно с Уральским отделением РАН и Правительством Оренбургской области решить вопрос о создании на базе Института клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН Российской референс-лаборатории с коллекцией уникальных культур микроорганизмов, в том числе возбудителей эндогенных бактериальных инфекций.

7. Считать необходимым периодическое проведение на базе Института клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН и других заинтересованных учреждений Всероссийских научно-практических конференций (не реже одного раза в 3 года) и рабочих совещаний, симпозиумов, семинаров по проблеме эндогенных бактериальных инфекций и различным ее аспектам, в том числе в режиме on-line.

Материалы конференции опубликованы в специальном номере №2 за 2016 г. электронного научного журнала «Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН» (см. Приложение), входящего в Научную электронную библиотеку – РИНЦ (сайт Журнала – http://elmag.uran.ru) и Научную электронную библиотеку «КиберЛенинка» (http://cyberleninka.ru), поддерживаемую Российской государственной библиотекой (http://rsl.ru) и Государственной публичной научно-технической библиотекой России (http://gpntb.ru).

Кроме того Оргкомитет конференции рекомендовал часть представленных на конференции материалов опубликовать в Российском иммунологическом журнале (РИЖ), для чего Главному редактору Журнала, академику РАН В.А. Черешневу подготовлено и направлено сопроводительное письмо.

Программа конференции доступна по ссылке.