В 2014 г. в Институте организован Центр коллективного пользования «Персистенция микроорганизмов» для проведения исследований геномов и транскриптомов с использованием технологии Next Generation Sequencing. Основными направлениями деятельности ЦКП являются: обеспечение на имеющемся оборудовании проведения исследований, а также оказание услуг исследователям и научным коллективам как базовой организации, так и иным заинтересованным пользователям.
Зарегистрирован на сайте «Современная исследовательская инфраструктура Российской Федерации» http://www.ckp-rf.ru/ckp/351815/
Основные методы исследования, реализуемые на базе ЦКП:
- выделение ДНК и РНК из биологических объектов (растения, животные, грибы, бактерии) с применением химического лизиса и механической гомогенизации;
- клеточное и молекулярное клонирование;
- электрофорез нуклеиновых кислот и белков в геле;
- количественная оценка концентрации нуклеиновых кислот и белков методом флюориметрии;
- полимеразная цепная реакция, в том числе мультиплексная ПЦР и ПЦР в режиме реального времени;
- приготовление ДНК-библиотек для NGS секвенирования;
- NGS секвенирование на приборе MiSeq (Illumina) с целью оценки метагенома, транскриптома, полногеномного секвенирования, таргетного секвенирования ампликонов и др.;
- жидкостная препаративная высокоэффективная хроматография органических соединений;
- лиофильное высушивание биологических образцов, включая бактериальные культуры.
Приборная база ЦКП:
- система для автоматического секвенирования MiSeq (Illumina, США);
- лиофильная сушка LL 1500 (Thermo Fisher Scientific, Чехия);
- градиентная высокоэффективная жидкостная хроматографическая система с многоволновым спектрофотометрическим детектором Smartline (Knauer, Германия);
- центрифуга с охлаждением Universal 320 R (Andreas Hettich GmbH & Co, Германия);
- система для ПЦР в реальном времени MiniOpticon (BIO-RAD, Франция);
- система документирования гелей INFINITI-3026, WL/LC/26МХ Х-Press (Vilber Lourmat, Франция);
- а также дополнительное оборудование, находящееся на балансе Института.
Положение о Центре коллективного пользования «Персистенция микроорганизмов » ИКВС УрО РАН
Перечень научного оборудования центра коллективного пользования «Персистенция микроорганизмов»
Порядок расчета нестандартных услуг
Заявка на проведение исследований и оказание услуг в ЦКП ИКВС УрО РАН
Контактная информация
Заведующий ЦКП:к.м.н., доцент Андрей Олегович Плотников
460000, г. Оренбург,ул. Пионерская, д. 11
Тел./Факс:+7(3532) 77-54-17
e-mail: protoz@mail.ru
Страница на сайте «Научно-технологическая инфраструктура Российской Федерации»: http://www.ckp-rf.ru/ckp/351815/