Публикации и патенты

Статьи в журналах, публикации сотрудников, монографии

Публикации сотрудников

2023

Статьи в отечественных научных журналах, входящих в перечень ВАК

 

  1. Пашинина О.А., Карташова О.Л., Пашкова Т.М., Гриценко В.А. sIgA-протеазная активность микроорганизмов, выделенных из секрета предстательной железы. // Российский иммунологический журнал. 2023. Т. 26. № 4. С. 471-476. doi: 10.46235/1028-7221-13776-SPA.
  2. Пашинина О.А., Карташова О.Л., Пашкова Т.М., Гриценко В.А.  Влияние синтетического аналога активного центра ГМ-КСФ – пептида ZP2 на антилизоцимную активность грибов рода Candida. // Российский иммунологический журнал. 2023. Т. 26. № 3. С. 373-376. doi: 10.46235/1028-7221-9645-EOS.
  3. Пашкова Т.М., Пашинина О.А., Кузьмин М.Д., Карташова О.Л. Влияние препарата Фитофрон® на персистентные свойства условно-патогенных микроорганизмов, выделенных из мочи пациентов с инфекциями мочевыделительной системы. // Урология. 2023. № 4. С. 53-57.  DOI:  10.18565/urology.2023.4.53-57.
  4. Пашинина О.А., Карташова О.Л., Пашкова Т.М., Кузьмин  М.Д. Влияние препарата ПростаНорм® на персистентный потенциал микроорганизмов, выделенных при хроническом бактериальном простатите. // Урология. 2023. № 4. С. 69-74. DOI: 10.18565/urology.2023.4.69-74.
  5. Карташова О.Л., Пашкова Т.М., Пашинина О.А., Коваленко А.Л. Влияние циклоферона in vitro  на рост и образование биопленок клиническими изолятами микроорганизмов.  // Экспериментальная и клиническая фармакология. 2023. Т. 86. № 4. С. 29-33. DOI: 10.30906/0869-2092-2023-86-4-29-33.
  6. Пашинина О.А., Сычева М.В., Марисова Е.В. Эффект влияния бактериоцинсодержащей культуральной жидкости  Enterococcus faecium EF 79OSAU  на способность  к биопленкообразованию Candida albicans // Проблемы медицинской микологии. 2023. Т. 25. № 2. С. 158.
  7. Карташова О.Л., Пашинина О.Л., Сычева М.В., Кочкина Е.Е., Пашкова Т.М., Дымова В.В. Характеристика патогенного потенциала E. coli, выделенных от кошек с заболеваниями мочевыделительной системы. //Вестник КрасГАУ. 2023. № 3. С. 140-146. DOI: 10.36718/1819-4036-2023-3-140-146.
  8. Карташова О.Л., Пашинина О.А., Пашкова Т.М., Гриценко В.А., Михайленко С.В. Биопрофили стафилококков разных видов, выделенных из секрета предстательной железы у мужчин с хроническим бактериальным простатитом. // Тихоокеанский медицинский журнал. 2023. № 1. С. 70-74. doi: 10.34215/1609-1175-2023-1-70-74.
  9. Пашинина О.А., Пашкова Т.М., Карташова О.Л., Морозова Н.В. Антицитокиновая активность грибов рода Candida и их способность к продукции цитокиноподобных веществ. // Российский иммунологический журнал. 2023. Т. 26. № 1. С. 57-62.  doi: 10.46235/1028-7221-1150-AAO.
  10. Черкасов С.В., Плотников А.О., Селиванова Е.А., Щуплова Е.А. Итоги X Российской научной конференции с международным участием «Персистенция и симбиоз микроорганизмов» // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2023. Т. 100. №6. С. 511-512.
  11. Игнатенко М.Е., Яценко-Степанова Т.Н. Стоматоцисты золотистых водорослей (Сhrysophyta) водоемов национального парка “Бузулукский бор” (юго-восток Европейской части России) // Ботанический журнал. 2023. Т. 108(7). С. 617-627. https://doi.org/10.31857/S0006813623070025
  12. Коткова В. М., Чернядьева И. В., Давыдов Е. А., Дорошина Г. Я., Ефимов Д. Ю., Ефимова Л. А., Фролов И. В., Габигер Я. И., Глущенко М. Ю., Горбунова И. А., Гимельбрант Д. Е., Игнатенко М. Е., Калинина Л. Б., Курбатова Л. Е., Кушневская Е. В., Лащинский Н. Н., Лотиев К. Ю., Мороз Е. Л., Нотов А. А., Новожилов Ю. К., Отмахов Ю. С., Пликина Н. В., Попова Н. Н., Потемкин А. Д., Путилина В. А., Рыжкова П. Ю., Самбыла Ч. Н., Смирнова Е. В., Степанчикова И. С., Стороженко Ю. В., Троева Е. И., Цуриков А. Г., Вишняков В. С., Власенко А. В., Власенко В. А., Волкова Е. А., Волоснова Л. Ф., Яковченко Л. С., Яценко-Степанова Т. Н., Жуйков К. А., Зуева А. С. Новые находки водорослей, грибов, лишайников и мохообразных // Новости систематики низших растений. 2023. Т. 57(1). С. 155–204. https://doi.org/10.31111/nsnr/2023.57.1.155
  13. Иванова Е.В., Чайникова И.Н., Бекпергенова А.В., Бондаренко Т.А., Челпаченко О.Е., Здвижкова И.А., Перунова Н.Б., Бухарин О.В. Эффект совместного влияния метотрексата и метаболитов бифидобактерий на продукцию TNFα и IFN-γ мононуклеарами периферической крови человека // Российский иммунологический журнал. 2023. Т. 26 (3). С. 279-284. https://doi.org/10.46235/1028-7221-9839-CEO
  14. Матчин А.А., Сетко Н.П., Дорошина Н.Б., Нефедова Е.С., Чайникова И.Н. Особенности распространенности кариеса и микробиоценоза ротовой полости у лиц, проживающих на территориях с различным уровнем антропогенной нагрузки // Оренбургский медицинский вестник. 2023. Т. ХI. № 2(42). С.  61–66.
  15. Бухарин О.В., Андрющенко С.В., Иванова Е.В., Перунова Н.Б., Чайникова И.Н., Челпаченко О.Е., Здвижкова И.А., Бекпергенова А.В., Бондаренко Т.А. Практические рекомендации по экспресс-выявлению ДНК бифидобактерий, кутибактерий и бактероидов в фекалия //Лабораторная служба. 2023. Т. 12 (1). С. 21-26. https://doi.org/10.17116/labs20231201121
  16. Данилова Е.И., ФисенкоА.П., Стадников А.А., Перунова Н.Б., Иванова Е.В., Чайникова И.Н., Челпаченко О.Е. Модель клебсиеллёзно — кандидозного артрита  на крысах линии Wistar //   Морфология. 2022. Т. 160 (1). С. 5-10.  https://doi.org/10.17816/morph.110871
  17. Челпаченко О.Е., ФисенкоА.П., Данилова Е.И., Стадников А.А., Иванова Е.В., Перунова Н.Б. Экспериментальное обоснование эффективности препарата для местного лечения воспалительных заболеваний суставов на модели клебсиеллёзно-кандидозного артрита // Медицинский вестник Северного Кавказа. 2022. Т. 17(4). С. 402-407. https://doi.org/10.14300/mnnc.2022.17096
  18. Бухарин О.В., Иванова Е.В., Перунова Н.Б., Здвижкова И.А. Анализ антибиотикорезистентности клинических изолятов Esсherichia coli с генетическими детерминантами clbBN и iucBC  //  Клиническая лабораторная диагностика. 2023. Т. 67 (9). С. 525-529. https://doi.org/10.51620/0869-2084-2023-68-8-489-45)
  19. Иванова Е.В., Данилова Е.И., , Чайникова И.Н., Челпаченко О.Е., Фадеев С.Б., Бондаренко Т.А., Бекпергенова А.В. Микробиологическое обоснование целесообразности применения эфирных масел лекарственных растений в лечении воспалительных заболеваний верхних дыхательных путей // Медицинский Совет. 2023. №12. С.55-61. https://doi.org/10.21518/ms2023-184
  20. Хавкин А.И., Бухарин О.В., Перунова Н.Б., Иванова Е.В., Ситкин С.И. Биологические свойства и симбиотические взаимоотношения бифидобактерий человека // Вопросы практической педиатрии. 2023. Т. 18(2). С. 54–64.  https://doi.org/10.20953/1817-7646-2023-2-54-64
  21. Бухарин О.В, Иванова Е.В., Чайникова И.Н., Перунова Н.Б., Никифоров И.А., Челпаченко О.Е., Бондаренко Т.А., Бекпергенова А.В. Влияние кишечных микросимбионтов на продукцию цитокинов в системе in vitro //Медицинская иммунология. 2023. Т. 25(6). С. 1359-1376. https://doi.org/10.15789/1563-0625-IVE-2622
  22. Bukharin O.V., Perunova N.B., Nikolaev Yu.A., Ivanova E.V., Oleskin A.V., and El’-Registan G.I. Secondary Metabolites of Bifido- and Lactobacteria Fulfilling Signal Functions. Microbiology. 2023. V. 92(6). P. 875–880. https://doi.org/10.1134/S0026261723601549
  23. Lavrentyeva E., Banzaraktsaeva T., Dambaev V., Buyantueva L., Valova E., Ivanov V., Plotnikov A. Taxonomic diversity and functional potential of microbial communities in salt lakes Gudzhirganskoe and Nukhe-Nur (Barguzin depression, Baikal rift zone) // Biological Communications. 2023. Т. 68. № 2. С. 86-96. https://doi.org/10.21638/spbu03.2023.203
  24. Бухарин О.В, Иванова Е.В. Особенности персистенции индигенных штаммов бифидобактерий кишечника человека // Вестник РАН. 2023. Т. 93. № 6. C. 548-555. (https://doi.org/10.31857/S0869587323060051 )
  25. O.V. Bukharin, E.V. Ivanova. Persistence Features of Indigenous Strains of the Human Intestine Bifidobacteria. Herald of the Russian Academy of Sciences. 2023. V. 93(6). P. 548–555. https://doi.org/10.1134/S1019331623030073
  26. Борисов С.Д., Каримов И.Ф., Плотников А.О., Инчагова К.С., Паньков А.С., Даньшин Д.П. Клинический случай посттравматического остеомиелита, вызванного ассоциацией Kytococcus schroeteri и Enterococcus faecalis // Инфекция и иммунитет. 2023. Т. 13. №5. C. 985-994. https://doi.org/10.15789/2220-7619-ACC-15623
  27. Инчагова К.С., Русакова Е.А. Исследование регуляторных эффектов малых молекул растительного происхождения в отношении бактериальных биосенсоров с различными системами «quorum sensing» LuxI/LuxR-типа // Вопросы биологической, медицинской и фармацевтической химии. 2023. Т. 11. С. 40-46. https://doi.org/10.29296/25877313-2023-11-07
  28. Рыжманова Я.В., Трубицын В.Э., Ривкина Е.М., Сузина Н.Е., Плотников А.О., Катаев В.Я., Молчанов М.В., Молочков Н.В., Щербакова B.А. Новые психроактивные бактерии криопэгов полуострова Ямал // Криосфера Земли. 2023. T. XXVII. № 6. C. 51–58.
  29. Карташова О.Л., Пашинина О.А, Пашкова Т.М., Пономарёва И.С. Антицитокиновая активность микроорганизмов, выделенных при заболеваниях мочевыделительной системы кошек // Известия Оренбургского государственного аграрного университета. 2023. № 6 (104). С. 268–271. https:// doi.org/10.37670/2073-0853-2023-104-6-268-271.
  30. Бухарин О.В, Иванова Е.В., Перунова Н.Б. Коренные штаммы бифидобактерий кишечника человека: индигенность через призму персистенции. // Вестник РАН. 2023. Т. 93(11): 1071-1080. (https://doi.org/10.31857/S0869587323110026)

 

Публикации в зарубежных изданиях, включенных в систему цитирования Web of Science, иных системах цитирования

 

  1. Golin A., Tinkov A.A., Ascher M., Farina M., Da Rocha J.B.T. Relashionship between selenium status, selenoproteins and COVID-19 and other inflammatory diseases: A critical review. Journal of Trace  Elements in Medicine and Biology. 2023. V. 75. P. 127099. DOI: 10.1016/j.jtemb.2022.127099.
  2. Aschner M., Skalny A.V., Gritsenko V.A., Kartashova O.L., Santamaria A., Rocha J. B.T., Spandidos D.A., Zaitseva I. P., Tsatsakis A.  Tinkov A. A. Role of gut microbiota in the modulation of the health effects of advanced glycation end‑products (Review). International Journal of Molecular Medicine. 2023. V. 51:44. DOI: 10.3892/ijmm.2023.5247
  3. Ke T., Rajoo A., Tinkov A.A., Skalny A.V., Tizabi Y.,  Rocha J.B.T.,  Bowman A.B., Aschner M. Intestinal microbiota protects against methylmercury-induced neurotoxicity. // Biometals. 2023. V. 16 November: 00554-1.  https://doi.org/10.1007/s10534-023-00554-1
  4. Mindolina Yu.V., Selivanova E.A., Ignatenko M.E., Krasnova E.D., Voronov D.A., Plotnikov A.O. Taxonomic Composition of Protist Communities in the Coastal Stratified Lake Kislo-Sladkoe (Kandalaksha Bay, White Sea) Revealed by Microscopy // Diversity. 2023. V.15: 44. https://doi.org/10.3390/d15010044
  5. Gerasimova, E.A., Mindolina, Y.V., Tikhonenkov, D.V., Kataev, V.Y., Balkin, A.S., Mikhailov, K.V. et al. Unexpected ubiquity of heart-shaped scale morphotype in Centroplasthelida (Haptista): Ancestral trait or multiple acquisitions. // Journal of Eukaryotic Microbiology. 2023. V. 00: e12992. https://doi.org/10.1111/jeu.12992
  6. Gerasimova E.A., Balkin A.S., Filonchikova E.S., Mindolina Y.V., Zagumyonnyi D.G., Tikhonenkov D.V. Taxonomic Structure of Planktonic Protist Communities in Saline and Hypersaline Continental Waters Revealed by Metabarcoding. // Water. 2023. V.15: 2008. https://doi.org/10.3390/w15112008
  7. Gladysheva I.V., Cherkasov S.V. Antibiofilm activity of cell-free supernatants of vaginal isolates of Corynebacterium amycolatum against Pseudomonas aeruginosa and Klebsiella pneumoniae // Archives of Microbiology. 2023. V. 205. P. 158. https://doi.org/10.1007/s00203-023-03498-9.
  8. Malygina A., Balkin A., Polyakova E., Stefanov S., Potekhin A., Gogoleva N. Taxonomic Diversity of the Microbial Biofilms Collected along the Thermal Streams on Kunashir Island // Ecologies. 2023. V. 4. P. 106-123. https://doi.org/10.3390/ecologies4010009
  9. Gogoleva, N., Chervyatsova, O., Balkin, A. et al. Microbial tapestry of the Shulgan-Tash cave (Southern Ural, Russia): influences of environmental factors on the taxonomic composition of the cave biofilms // Environmental Microbiome. 2023. V.18:82. https://doi.org/10.1186/s40793-023-00538-1
  10. Kapustin D., Ignatenko M., Yatsenko-Stepanova T. On stomatocysts of Paraphysomonas caelifrica (Stramenopiles, Paraphysomonadida) // Journal of Eukaryotic Microbiology. 2023. V. 70(5): e12979. https://doi.org/10.1111/jeu.12979
  11. Ignatenko M., Yatsenko-Stepanova T. Coccolithophores in the algal flora from South Urals (Russia) with the description of a new Hymenomonas species // Phytotaxa. 2023. V. 609(1). P. 055–064. https://doi.org/10.11646/phytotaxa.609.1.5
  12. Ignatenko M., Gusev E., Yatsenko-Stepanova T. Diversity of Silica-Scaled Chrysophytes in the Steppe Zone of the Southern Urals with a Description of a New Species from the Genus Mallomonas // Life. 2023. V.13: 2214. https://doi.org/10.3390/life13112214
  13. Dubashynskaya NV, Petrova VA, Sgibnev AV, Elokhovskiy VY, Cherkasova YI, Skorik YA. Carrageenan/Chitin Nanowhiskers Cryogels for Vaginal Delivery of Metronidazole. Polymers. 2023. V. 15(10): 2362. https://doi.org/10.3390/polym15102362
  14. La Cono, V., Messina, E., Reva, O., Smedile, F., La Spada, G., Crisafi, F. et al. (2023) Nanohaloarchaea as beneficiaries of xylan degradation by haloarchaea. // Microbial Biotechnology. 2023. V.16. P. 1803–822.  https://doi.org/10.1111/1751-7915.14272
  15. Reva O., Messina E., La Cono V., Crisafi F., Smedile F., La Spada G., Marturano L., Selivanova E.A., Rohde M., Krupovic M., Yakimov M.M. (2023) Functional diversity of nanohaloarchaea within xylan-degrading consortia. // Frontiers in Microbiology. 2023. V.14:1182464. DOI: 10.3389/fmicb.2023.1182464
  16. Valyshev A.V. Virulence Factors of Plant Growth-Promoting Bacteria: Analysis of Pseudomonas protegens Genomes // E3S Web of Conferences. 2023. V.411: 02037. https://doi.org/10.1051/e3sconf/202341102037
  17. Titova V., Zhurlov O. Interaction of bacteria with graphene oxide particles reduces their ability to biofilm formation on PVC Microplates. E3S Web of Conferences. 2023. V.389: 07007.
    https://doi.org/10.1051/e3sconf/202338907007
  18. Zhurlov O. Succession of the Microbial Communities in the Surface Soil Layer Under the Manure Cake of Large Phytophages.
    Lecture Notes in Networks and Systems. 2023. V. 575 LNNS. P. 2409-2415. https://doi.org/10.1007/978-3-031-21219-2_270
  19. Zhurlov O. Characteristics of bacterial communities in the rhizosphere of plants collected on marginal lands. E3S Web of Conferences. 2023. V. 420:09008. https://doi.org/10.1051/e3sconf/202342009008

 

Статьи в прочих отечественных научных журналах

 

  1. Рищук С.В., Загарских Е.Ю., Гриценко В.А., Федорец В.Н. Овариальная дисфункция у женщин с воспалительными заболеваниями репродуктивной системы. Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. 2023. 1: 32 c. [Электр. ресурс] (URL: http:// elmag.uran.ru:9673/magazine/Numbers/2023-1/Articles/SVR-2023-1.pdf) DOI: 10.24411/2304-9081-2023-11005
  2. Курлаев П.П., Гриценко В.А., Белозерцева Ю.П. Прогнозирование инфекционных осложнений у больных с синдромом диабетической стопы. Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. 2023. 2. 10 с. [Электр. ресурс] (URL: http://elmag.uran.ru:9673/magazine/ Numbers/2023-2/Articles/KPP-2023-2.pdf). DOI: 10.24411/2304-9081-2023-12013
  3. Пашкова Т.М., Карташова О.Л. Влияние фитопрепаратов на факторы персистенции микроорганизмов, выделенных при заболеваниях мочеполовой системы человека. Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. 2023. 3. [Электр. ресурс] (URL: http://elmag.uran.ru:9673/magazine/Numbers/2023-3/Articles/TMP-2023-3.pdf). DOI: 10.24411/2304-9081-2023-13011
  4. Пашинина О.А., Карташова О.Л., Пашкова Т.М., Гриценко В.А. Антицитокиновая активность микроорганизмов и их способность продуцировать цитокиноподобные вещества. Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. 2023. 3. [Электр. ресурс] (URL: http://elmag.uran.ru:9673/magazine/Numbers/2023-3/Articles/PAO-2023-3.pdf). DOI: 10.24411/2304-9081-2023-13010
  5. Щуплова Е.А. Изменения конформации фосфолипидов мембраны эритроцитов под действием микроорганизмов. Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. 2023. 1: 8 c. [Электр. ресурс] (URL: http://elmag.uran.ru:9673/magazine/Numbers/2023-1/Articles/SEA-2023-1.pdf) DOI: 10.24411/2304-9081-2023-11006
  6. Немцева Н.В. Микробные сообщества и проблема качества природных и питьевых вод// Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. 2023. №3.  [Электр.ресурс] (URL:http://elmag.uran.ru:9673/magazine/Numbers/2023-3/Articles/NVN-2023-3.pdf) DOI:10.24411/2304-9081-2023-13005
  7. Игнатенко М.Е., Яценко-Степанова Т.Н. Стоматоцисты Сhrysococcus furcatus в водоемах Оренбургской области (Южный Урал, Россия). Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. 2023. 2. 6с. [Электр. ресурс] (URL: http://elmag.uran.ru:9673/magazine/ Numbers/2023-2/Articles/IME-2023-2.pdf). DOI: 10.24411/2304-9081-2023-12003
  8. Перунова Н.Б., Иванова Е.В., Бекпергенова А.В., Бондаренко Т.А., Здвижкова И.А., Тимохина Т.Х., Марков А.А. Видовой состав и антибиотикорезистентность энтеробактерий, изолированных из различных биотопов организма человека. Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. 2023. 1: 1-10. [Электр. ресурс] (https://doi.org/10.24411/2304-9081-2023-11007)
  9. Селиванова Е.А., Тынников О.А. Характеристика бактерий-ассоциантов из лабораторных культур галофильных микроводорослей. Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. 2023. 4. 10 с. [Электр. ресурс] (URL: http://elmag.uran.ru:9673/magazine/ Numbers/2023-4/Articles/SEA-2023-4.pdf). DOI: 10.24411/2304-9081-2023-14001
  10. Игнатенко М.Е., Яценко-Степанова Т.Н. Диатомовые водоросли озера Журманколь (государственный природный заповедник «Оренбургский») // Вопросы современной альгологии. Бюллетень. Спец. вып., 2023, С. 39-41.
  11. Селиванова Е.А., Тынников О.А. Характеристика нового штамма галотолерантной микроводоросли Asteromonas gracilis ICIS8, выделенного из гипергалинной реки Малая Саморода. Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. 2023. 3: 9 с. [Электр. ресурс] (URL: http://elmag.uran.ru:9673/magazine/Numbers/2023-3/Articles/EAS-2023-3.pdf). DOI: 10.24411/2304-9081-2023-13009
  12. Игнатенко М.Е., Яценко-Степанова Т.Н. Новые находки Gyromitus disomatus Skuja в водоемах Оренбургской области (Южный Урал, Россия). Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. 2022. 4. 8 с. [Электр. ресурс] (URL: http://elmag.uran.ru:9673/ magazine/Numbers/2023-4/Articles/IME-2023-4.pdf). DOI: 10.24411/2304-9081-2023-14006
  13. Насырова М.А. Анализ морфологии и ультраструктуры раковин амеб семейства Cyphoderiidae с помощью сканирующей электронной микроскопии. Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. 2023. 4. 7 с. [Электр. ресурс] (URL: http://elmag.uran.ru:9673/magazine/Numbers/2023-4/Articles/MAN-2023-4.pdf). DOI: 10.24411/2304-9081-2023-14004

 

Публикации в прочих зарубежных журналах

 

  1. Koptyug A.V., Sukhovei Yu.G., Gritsenko V.A. Possible Existence of the Relict Mechanism of Cell Protection During Division // Biomedical Journal of Scientific & Technical Research. 2023. V. 51(3). P. 42768-42772.  DOI: 10.26717/BJSTR.2023.51.008112
  2. Shchuplova E.A., Gogoleva O.A. The effect of cell-free nontuberculous Mycobacterium supernatants on antibiotic resistance and biofilm formation of opportunistic pathogens // Bacteria. 2023. V.2. P. 174–184. https://doi.org/10.3390/bacteria2040013
  3. Zhurlov O.S. Methods of microbial decontamination of insect surface. European Science Review. 2023. V. 5-6:3-7. https://doi.org/10.29013/ESR-23-5.6-3-7

 

Статьи в отечественных сборниках

 

  1. Кочкина Е.Е., Морозова Н.В. Антибиотикорезистентность штаммов Escherichia coli, выделенных при заболеваниях мочевыделительной системы у кошек // Сборник материалов III международной научно-практической конференции студентов, аспирантов и молодых ученых  «Молодежная наука – развитию агропромышленному комплексу» (Курск 15 ноября, 2022 г., ч. I). 2023. С. 381-386.  ISBN 978-5-7369-0883-7.
  2. Миндолина Ю.В., Краснова Е.Д., Воронов Д.А., Плотников А.О. Таксономический состав сообществ протистов в стратифицированной прибрежной лагуне на Зеленом мысе (Кандалакшский залив, Белое море) // В сборнике: LXXVI Герценовские чтения. География: развитие науки и образования. Материалы Международной научно-практической конференции. 19-21 апреля 2023 г., Санкт-Петербург, Россия. В 2-х томах. Отв. редакторы Д. А. Субетто, А. Н. Паранина. Санкт-Петербург, 2023. С. 264-268.
  3. Селиванова Е.А., Хлопко Ю.А., Краснова Е.Д., Воронов Д.А., Плотников А.О., Миндолина Ю.В. Вертикальная структура сообществ прокариот меромиктического озера Кисло-Сладкое (Кандалакшский залив, Белое море) // В сборнике: LXXVI Герценовские чтения. География: развитие науки и образования. Материалы Международной научно-практической конференции. 19-21 апреля 2023 г., Санкт-Петербург, Россия. В 2-х томах. Отв. редакторы Д. А. Субетто, А. Н. Паранина. Санкт-Петербург, 2023. С. 289-293.
  4. Миндолина Ю.В., Краснова Е.Д., Воронов Д.А., Плотников А.О. Структура сообществ протистов стратифицированных водоемов побережья Белого моря // В книге: Экология и геохимическая деятельность микроорганизмов экстремальных местообитаний. Материалы III Всероссийской конференции с международным участием, посвященной 80-летию д.б.н., проф. Б.Б. Намсараева, 100-летию Республики Бурятия, 300-летию Российской академии наук. 3-7 июля 2023 г., Улан-Удэ – Байкальск, Россия. Новосибирск, 2023. С. 76-77.
  5. Насырова М.А., Балкин А.С., Гоголева Н.Е., Плотников А.О. Разнообразие сообществ протистов в водоемах карстовой пещеры Шульган-Таш (Республика Башкортостан, Россия) // В книге: Экология и геохимическая деятельность микроорганизмов экстремальных местообитаний. Материалы III Всероссийской конференции с международным участием, посвященной 80-летию д.б.н., проф. Б.Б. Намсараева, 100-летию Республики Бурятия, 300-летию Российской академии наук. Новосибирск, 2023. С. 80-81.
  6. Балкин А.С., Малыгина А.В., Полякова Е.Ю., Стефанов С.Ю., Потехин А.А., Гоголева Н.Е. Таксономическая структура и состав сообществ микробных биопленок термальных источников острова Кунашир // В книге: Экология и геохимическая деятельность микроорганизмов экстремальных местообитаний. Материалы III Всероссийской конференции с международным участием, посвященной 80-летию д.б.н., проф. Б.Б. Намсараева, 100-летию Республики Бурятия, 300-летию Российской академии наук. Новосибирск, 2023. С. 14-15.
  7. Плотников А.О., Селиванова Е.А., Хлопко Ю.А., Катаев В.Я., Балкин А.С. Разнообразие эукариотических микроорганизмов в соленых водоемах Крыма по данным ДНК-метабаркодинга // В книге: Экология и геохимическая деятельность микроорганизмов экстремальных местообитаний. Материалы III Всероссийской конференции с международным участием, посвященной 80-летию д.б.н., проф. Б.Б. Намсараева, 100-летию Республики Бурятия, 300-летию Российской академии наук. 3-7 июля 2023 г., Улан-Удэ – Байкальск, Россия. Новосибирск, 2023. С. 86-87.
  8. Катаев В.Я., Плотников А.О., Балкин А.С., Гоголев Ю.В., Черкасов С.В., Гоголева Н.Е. Молекулярные и клеточные механизмы ответа сальмонелл на олиготрофные условия // В книге: Экология и геохимическая деятельность микроорганизмов экстремальных местообитаний. Материалы III Всероссийской конференции с международным участием, посвященной 80-летию д.б.н., проф. Б.Б. Намсараева, 100-летию Республики Бурятия, 300-летию Российской академии наук. 3-7 июля 2023 г., Улан-Удэ – Байкальск, Россия. Новосибирск, 2023. С. 57-58.
  9. Селиванова Е.А., Катаев В.Я., Хлопко Ю.А., Плотников А.О. Изменения сообществ прокариот, ассоциированных с галофильными протистами, при переходе к лабораторному культивированию // В книге: Экология и геохимическая деятельность микроорганизмов экстремальных местообитаний. Материалы III Всероссийской конференции с международным участием, посвященной 80-летию д.б.н., проф. Б.Б. Намсараева, 100-летию Республики Бурятия, 300-летию Российской академии наук. 3-7 июля 2023 г., Улан-Удэ – Байкальск, Россия. Новосибирск, 2023. С. 96-97.
  10. Селиванова Е.А., Тынников О.А., Насырова М.А., Плотников А.О. Сравнительная характеристика новых штаммов галофильных микроводорослей рода Asteromonas // В книге: Экология и геохимическая деятельность микроорганизмов экстремальных местообитаний. Материалы III Всероссийской конференции с международным участием, посвященной 80-летию д.б.н., проф. Б.Б. Намсараева, 100-летию Республики Бурятия, 300-летию Российской академии наук. 3-7 июля 2023 г., Улан-Удэ – Байкальск, Россия. Новосибирск, 2023. С. 97-98.
  11. Селиванова Е.А., Катаев В.Я., Хлопко Ю.А., Плотников А.О. Сравнительная характеристика сообществ прокариот в ассоциациях с галофильными микроводорослями при переходе к лабораторному культивированию // Тезисы 4-го Российского Микробиологического Конгресса (г. Томск, 24-29 сентября 2023 г.). С.34.
  12. Игнатенко М.Е., Яценко-Степанова Т.Н. Альгофлора водоемов особо охраняемых природных территорий Оренбургской области. Актуальные проблемы особо охраняемых природных территорий-5: Труды Всероссийской научной конференции / Под ред. Г.С. Розенберга, Е.В. Быкова, А.Г. Бакиева, С.С. Саксонова. Тольятти: ИБЦ ИЭВБ РАН, 2023, 103-105. https://doi.org/10.24412/cl-34866-2023-29

 

Статьи в зарубежных сборниках

 

Gogoleva N., Balkin A., Nasyrova M., Malygina A., Polyakova E., Gogolev Yu., Shagimardanova E., Potekhin A., Plotnikov A. Diversity of protist communities in the extreme environments revealed by metabarcoding // IX European Congress of Protistology & Annual Congress of the International Society of Protistologists «The Century of Protists». Abstract booklet. 2023. P. 290. https://ecopisop2023.univie.ac.at/fileadmin/user_upload/k_ecop_isop2023/Abstract_Bookl_FINAL.pdf

 

 

Статьи в научно-популярных журналах и периодических изданиях

 

  1. Понизовкина Е. Здоровье мужское и женское: плодотворные подходы // Наука Урала. Январь 2023. № 1–2 (1263). С. 4-5.
  2. Соколова В. Сберечь здоровье в социальной сети // Южный Урал. 25 января 2023. №3 (25453). С. 19.
  3. Оренбургские ученые изучают возможности и свойства микроорганизмов // Репортаж на телеканале Оренбургского регионального телевидения. 7 февраля 2023. https://youtu.be/eg95t2l8lcA?si=QX2YvE3KN3gPIfBy
  4. Шилинцева О. Единственные в целом мире. Сегодня отмечается День российской науки // Аргументы и факты в Оренбуржье. 8 февраля 2023. №6 (225). С. 11.
  5. Сидельников А. Симбиоз из микромира // Южный Урал. 8 февраля 2023. № 5 (25455). С. 6.
  6. Алексеева В. Пробиотик попадает точно в цель// Южный Урал. 8 февраля 2023. № 5 (25455). С. 13.
  7. Сальников Н. Полезные – вредные сожители: микробиологи из Оренбурга обнаружили уникальные бактерии, способные защитить от коронавируса и стафилококка // Публикация на сайте издания «Комсомольская правда. Оренбург.» 28 апреля 2023 г. (https://www.orenburg.kp.ru/daily/27495/4755379/)
  8. Бактерии, несущие здоровье, принесли награды. Достижения наших земляков // Публикация на сайте издания «Аргументы и факты в Оренбуржье». 3 апреля 2023. (https://oren.aif.ru/society/bakterii_nesushchie_zdorove_prinesli_nagrady_dostizheniya_nashih_zemlyakov)
  9. Соколова В. Микробы против рака и постковида // Южный Урал. 4 октября 2023. № 39 (25489). С. 11.
  10. Мурзина А. Разрабатывая лекарства будущего. В Оренбурге прошла научная конференция // Аргументы и факты в Оренбуржье. 4 октября 2023. Специальный выпуск, № 5 (224). С. 2.
  11. Кузьмин М.Д. Хронический абактериальный простатит. Новый подход к пониманию патогенеза и лечения // Московский уролог. 2023. №1. С. 6.
  12. Гладышева И.В. Со знаком «плюс» // Наука Урала. Сентябрь 2023. № 18. С. 3
  13. Оренбургские ученые и химики создали образец мази, способную восстанавливать поврежденные ткани // Репортаж на телеканале Россия 1 (Оренбург). 26 октября 2023. https://vestirama.ru/vesti-orenburzhya/syuzhetyi/20231026-15.17.50.html
  14. Телепередача «Телевышка» с участием Плотникова А.О. на телеканале Россия 1 (Оренбург) (https://vestirama.ru/televizionnyie-peredachi/rossiya-24/televyshka/188629-televyshka-ot-29-noyabrya-2.html)
  15. Понизовкина Е. В центре внимания — микробиом // Наука Урала. Октябрь 2023. № 20. С. 5.

2022

Статьи в отечественных научных журналах, входящих в перечень ВАК

 

  1. Пашинина О.А., Карташова О.Л., Пашкова Т.М., Гриценко В.А. Влияние синтетического аналога активного центра ГМ-КСФ – пептида ZP2 на антицитокиновую активность бактерий рода Enterococcus spp. и их способность к продукции цитокиноподобных веществ. Российский иммунологический журнал. 2022. Т. 25. № 4. С. 477-484.
    DOI: 46235/1028-7221-1162-IOZ
  2. Фомина Л.О., Гриценко В.А., Файзуллина А.И. Сравнительный анализ определения цитокинов в супернатантах нейтрофилов, стимулированных супернатантами S. aureus, имеющими и не имеющими ген SPA. Вестник Уральской медицинской академической науки. 2022. Т. 19. № 3. С. 273-281. DOI: 22138/2500-0918-2022-19-3-273-281
  3. Бондаренко Т.А., Иванова Е.В., Бекпергенова А.В., Чайникова И.Н., Челпаченко О.Е., Никифоров И.А., Здвижкова И.А. Связь цитокинов и численности микросимбионтов при микроэкологических нарушениях кишечника человека. Российский иммунологический журнал. 2022. т. 25. № 2. с. 125-130. DOI: 46235/1028-7221-1112-RBC
  4. Костоломова Е.Г., Тимохина Т.Х., Перунова Н.Б., Полянских Е.Д., Сахаров Р.А., Комарова А.В. Оценка иммуномодулирующей активности Bifidobacterium bifidum 791 на модели клеток врожденного и адаптивного иммунитета в эксперименте in vitro. Российский иммунологический журнал. 2022. т. 25. № 2. С. 213-218. DOI: 46235/1028-7221-1133-IVE
  5. Фомина Л.О., Гриценко В.А., Файзуллина А.И. Сравнительная характеристика содержания цитокинов в супернатантах нейтрофилов после инкубации их с суточными культурами S. aureus, имеющих и не имеющих ген SPA. Российский иммунологический журнал. 2022. т. 25. № 3. С. 339-344.DOI: 46235/1028-7221-1140-CCO
  6. Сычева М.В., Пашкова Т.М., Пашинина О.А., Сорокин В.И., Морозова Н.В., Карташова О.Л. Таксономическая структура и биопрофиль микроорганизмов, выделенных из мочи кошек с заболеваниями мочевыделительной системы. Известия Оренбургского государственного аграрного университета. 2022, Т.6, №98, С.219-223. DOI: 10.37670/2073-0853-2022-98-6-219-223
  7. Никифоров И.А., Иванова Е.В. Метод картирования равнодействующих при решении задач медицинской микробиологии. Врач и информационные технологии. 2022, № 3, С. 14-23. doi: 10.25881/18110193_2022_3_1
  8. Пашинина О.А., Карташова О.Л., Пашкова Т.М., Гриценко В.А., Зурочка А.В. Влияние синтетического аналога активного центра ГМ-КСФ – пептида ZP2 на антицитокиновую активность грибов рода Candida и их способность к продукции цитокиноподобных веществ. Вестник уральской медицинской академической науки. 2022, Т. 19, №3, С.263-272. DOI: 10.22138/2500-0918-2022-19-3-263-272.
  9. Пашинина О.А., Кочкина Е.Е., Сычева М.В., Пашкова Т.М., Морозова Н.В., Карташова О.Л. Антибиотикорезистентность штаммов стафилококков, выделенных при заболеваниях мочевыделительной системы у кошек. Вестник Омского ГАУ. 2022, Т. 4, №48, С. 156-163. DOI: 10.48136/2222-0364_2022_4_156.
  10. Сизова Е.А., Яушева Е.В., Хлопко Ю.А., Лебедев С.В., Маршинская О.В., Казакова Т.В. Оценка влияния биоаккумуляции микроэлементов в шерсти и молоке коров на кишечный микробиом // Российская сельскохозяйственная наука, 2022, №4, с. 66-72 DOI: 10.31857/S2500262722040123 / Sizova, E.A., Yausheva, E.V., Khlopko, Y.A. et al. Assessing the Effect of Bioaccumulation of Trace Elements in the Hair and Milk of Cows on the Intestinal Microbiome. Russian Agricultural Sciences. 2022, № 48, Р. 413–421. DOI: 3103/S1068367422050093
  11. Бухарин О.В., Андрющенко С.В., Перунова Н.Б., Иванова Е.В. Экологическая детерминация индигенных бифидобактерий кишечника человека. Вестник Российской академии наук. 2022. Т.92. № 9. С. 869-876. DOI: 31857/S0869587322090055/ Bukharin O. V., Andryushchenko S. V., Perunova N. B., Ivanova E. V. Environmental Determination of Indigenous Bifidobacteria of the Human Intestine. Herald of the Russian Academy of Sciences, 2022, V. 92, N. 5, pp. 629–635 DOI: 10.1134/S1019331622050033

 

 Статьи в отечественных научных журналах, включенные в систему цитирования Webof Science/ Scopus

 

  1. Бухарин О.В., Андрющенко С.В., Перунова Н.Б., Иванова Е.В. Экологическая детерминация индигенных бифидобактерий кишечника человека. Вестник Российской академии наук. 2022. Т.92. № 9. С. 869-876. DOI: 10.31857/S0869587322090055/ Bukharin O. V., Andryushchenko S. V., Perunova N. B., Ivanova E. V. Environmental Determination of Indigenous Bifidobacteria of the Human Intestine.  Herald of the Russian Academy of Sciences, 2022, V. 92, N. 5, pp. 629–635 DOI: 10.1134/S1019331622050033
  2. Игнатенко М.Е., Яценко-Степанова Т.Н. Разнообразие стоматоцист хризофитовых водорослей (CHRYSOPHYCEAE) степной зоны Южного Урала. Ботанический журнал. 2022. Т.107. № 2. С. 149-158. DOI: 10.31857/S0006813622020053 / Ignatenko M.E., Yatsenko-Stepanova T.N. Diversity of Chrysophycean stomatocysts in the Steppe Zone of the South Urals // Doklady Biological Sciences. 2022, V.506, P. 184–190.  DOI: 10.1134/S0012496622050040
  3. Бухарин О.В., Кузьмин М.Д., Перунова Н.Б., Никифоров И.А., Чайникова И.Н., Иванова Е.В. Диагностический цитокиновый маркер бесплодия мужчин — интерлейкин 4. Клиническая лабораторная диагностика. 2022. Т.67. № 3. С.151-157. DOI: 10.51620/0869-2084-2022-67-3-151-157
  4. Челпаченко О.Е., Данилова Е.И., Перунова Н.Б., Иванова Е.В., Никифоров И.А., Чайникова И.Н., Бекпергенова А.В., Бондаренко Т.А. Количественный метод определения антибиотикорезистентных копроштаммов для ранней диагностики хронического артрита. Клиническая лабораторная диагностика. 2022. Т. 67. № 9. С. 525-529. DOI: 10.51620/0869-2084-2022-67-9-525-529
  5. Черкасова Ю.И., Кремлева Е.А., Щетинина Ю.С., Сгибнев А.В. Влияние местного применения раствора, содержащего ионы железа двухвалентного, на эффективность терапии рецидивирующего урогенитального трихомониаза у женщин. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2022. Т. 24, № 1. С. 77-82. DOI: 10.36488/cmac.2022.1.77-82
  6. Горбунов М.Ю., Хлопко Ю.А., Катаев В.Я., Уманская М.В. Разнообразие бактерий прикрепленных сообществ холодного высокосульфидного водоема европейской части России. Микробиология. 2022. Т 91. № 1. С. 86-101. DOI: 10.31857/S0026365622010049/ Gorbunov, M.Y., Khlopko, Y.A., Kataev, V.Y. et al. Bacterial Diversity in Attached Communities of a Cold High-Sulfide Water Body in European Russia. Microbiology. 2022, V. 91, 77–90.  DOI: 10.1134/S0026261722010040
  7. Коткова В.М., Афонина О.М., Андросова В.И., Арсланов С.Н., Беляков Е.А., Чернова А.М., Чернядьева И.В., Давыдов Е.А., Дорошина Г.Я., Ерохина О.В., Гарин Э.В., Горбунова И.А., Гришуткин О.Г., Гузиев Х.Ю., Игнатенко М.Е., Игнатов М.С., Ивченко Т.Г., Капитонов В.И., Харпухаева Т.М., Комарова А.С. Кузьмина Е.Ю., Ликсакова Н.С., Макарова М.А., Мелехин А.В., Филиппов Д.А., Потемкин А.Д., Романов Р. Е., Рыжкова П.Ю., Ширяева О.С., Сонина А.В., Стороженко Ю.В., Тарасова В. Н., Тимдал Е., Вишняков В.С., Яковченко Л.С., Яценко-Степанова Т.Н. Новые находки водорослей, грибов, лишайников и мохообразных. Новости систематики низших растений. 2022. Т. 56, №2, С. 479-517. DOI: 10.31111/nsnr/2022.56.2.477
  8. Челпаченко О.Е., Данилова Е.И., Чайникова И.Н., Суменко В.В., Иванова Е.В. Lactobacillus rhamnosus GG для предупреждения рецидивов реактивного артрита у детей. Медицинский совет. 2022, Т. 16, № 1, С. 196-204. DOI: 10.21518/2079-701X-2022-16-1-196-204
  9. Челпаченко О.Е., Данилова Е.И., Чайникова И.Н., Бекпергенова А.В., Бондаренко Т.А., Суменко В.В. Клинико-микробиологическое обоснование использования растительного препарата у детей с ринофарингитом. Медицинский совет. 2022, Т. 16, № 1, С. 65-75. DOI: 10.21518/2079-701X-2022-16-1-65-75
  10. Карташова О.Л., Пашинина О.А., Морозова Н.В., Пашкова Т.М., Кузьмин М.Д. Антибиотикорезистентность штаммов грамположительных кокков, выделенных из секрета предстательной железы у мужчин с хроническим бакте-риальным простатитом. Урология, 2022, № 6, С. 16-20. DOI: 10.18565/urology.2022.6.16-20.
  11. Кремлева Е.А., Джуламанова А.Б., Щетинина Ю.С., Сгибнев А.В. Влияние комбинации пробиотика и прогестерона на эффективность топической терапии генитоуринарного менопаузального синдрома эстриолом // Вопросы гинекологии, акушерства и перинатологии, 2022, Т. 21, №6, С. 65–72 DOI: 10.20953/1726-1678-2022-6-65-72
  12. Плотников А. О., Селиванова Е.А., Хлопко Ю.А., Воронов Д.А., Маторин Д.Н., Тодоренко Д.А., Краснова Е.Д. Структура и функционирование планктонных сообществ фототрофных и миксотрофных протистов в прибрежной лагуне “Озеро Кисло-Сладкое” (Белое море, Карельский берег) // Известия Российской академии наук. Серия географическая. 2022, Т. 86, №6, С. 985-1001. DOI: 10.31857/S2587556622060127
  13. Челпаченко О.Е., Данилова Е.И., Чайникова И.Н., Иванова Е.В., Перунова Н.Б. Эфирные масла лекарственных растений в коррекции микробиоценоза верхних дыхательных путей у детей с риносинуситом. Вопросы практической педиатрии. 2021, Т.16, №6, С.112–121. DOI: 10.20953/1817-7646-2021-6-112-121.  (Не учтена в 2021 году)
  14. Gerasimova E.A. Two new brackish-water species of centrohelid heliozoans (Haptista: Centroplasthelida), Choanocystis mylnikovi sp.n. and C. punctata sp.n., from Russia. Protistology. 2022, 16(1), pp.10-20 DOI: 10.21685/1680-0826-2022-16-1-2

 

Публикации в зарубежных изданиях, включенных в систему цитирования Web of Science

 

  1. Andryuschenko S.V., Ivanova E.V., Perunova N.B., Bukharin O.V., Zdvizhkova I.A. Genome sequence data and properties of Bifidobacterium bifidum strain ICIS-504 isolated from multispecies bifidobacterial community. Data in Brief. 2022, V.14, №45, Р.108672. DOI: 10.1016/j.dib.2022.108672.
  2. Ignatenko M., Yatsenko-Stepanova T.N., Kapustin D. Morphological variability of stomatocyst 131 Pang & Wang (Chrysophyceae) from a freshwater shallow lake in South Urals, Russia. Phytotaxa. 2022. V.542, №1, P.100-104. DOI: 10.11646/phytotaxa.542.1.10
  3. Ignatenko M., Yatsenko-Stepanova T.N., Kapustin D. Additions to chrysophycean  stomatocyst flora from South Urals shallow lake including descriptions of three new morphotypes. Phytotaxa 2022. V.561, №1, P.014-026. DOI: 10.11646/phytotaxa.561.1.2
  4. Bukharin O.V., Perunova N.B., Ivanova E.V., Chaynikova I.N., Bekpergenova A.V., Bondarenko T.A., Kuzmin M.D. Semen microbiota and cytokines of healthy and infertile men. Asian Journal of Andrology. 2022, V.24, №4, Р. 353-358. DOI: 10.4103/aja202169
  5. Gladysheva I.V., Chertkov K.L., Cherkasov S.V., Khlopko Y.A., Kataev V.Y., Valyshev A.V. Probiotic Potential, Safety Properties, and Antifungal Activities of Corynebacterium amycolatum ICIS 9 and Corynebacterium amycolatum ICIS 53 Strains. Probiotics Antimicrob. Proteins. 2021. Nov 22. DOI:  10.1007/s12602-021-09876-3. (Не учтена в 2021 году)
  6. Parfenova L.V., Galimshina Z.R., Gil’fanova G.U., Alibaeva E.I., Danilko K.V., Pashkova T.M., Kartashova O.L., Farrakhov R.G., Mukaeva V.R., Parfenov E.V., Valiev R.Z., Nagumothu B. Hyaluronic acid bisphosphonates as antifouling antimicrobial coatings for peo-modified titanium implants. Surfaces and Interfaces. 2022, V. 28. P. 101678. DOI: 10.1016/j.surfin.2021.101678
  7. Galimshina Z.R., Gil’Fanova G.U., Parfenova L.V., Alibaeva E.I., Pashkova T.M., Kartashova O.L. Synthesis of conjugates of  hyaluronic acid with amino acid bisphosphonates as antimicrobial organic coatings for peo-modified titanium implants. AIP Conrefence Proceeding. 2022. P. 020018. DOI: 10.1063/5.0069154
  8. Poshvina D.V., Efimenko T.A., Demiankova M.V., Glukhova A.A., Ivankova T.D., Efremenkova O.V., Sadykova V.S., Balkin A.S., Vasilchenko A.S. Complete Genome Sequences of Streptomyces albus Strain INA 01303. Microbiology Resource Announcements. 2022, e0099122. DOI: 10.1128/mra.00991-22
  9. Gladysheva I.V., Cherkasov S.V., Khlopko Y.A., Plotnikov A.O.  Genome Characterization and Probiotic Potential of Corynebacterium amycolatum Human Vaginal Isolates. Microorganisms. 2022, V.10, №2, Р.249. DOI: 10.3390/microorganisms10020249
  10. Gladysheva I.V., Khlopko Y.A, Cherkasov S.V, Kataev V.Ya. Genome sequence of Corynebacterium amycolatum ICIS 99 isolated from human vagina reveals safety and beneficial properties. Archives of Microbiology. 2022, V.204, №4, P.226. DOI: 10.1007/s00203-022-02852-7
  11. Kovaleva O.V., Podlesnaya P., Sorokin M., Mochalnikova V., Kataev V., Khlopko Y.A., Plotnikov A.O., Stilidi I.S., Kushlinskii N.E., Gratchev A. Macrophage Phenotype in Combination with Tumor Microbiome Composition Predicts RCC Patients’ Survival: A Pilot Study. Biomedicines. 2022, № 10, Р. 1516. DOI: 10.3390/biomedicines10071516
  12. Sizova E., Yausheva E., Marshinskaia O., Kazakova T., Khlopko Y., Lebedev S. Elemental composition of the hair and milk of black-spotted cows and its relationship with intestinal microbiome reorganization. Veterinary World. 2022. V.15, №11, P.2565–2574 DOI: 10.14202/vetworld.2022.2565-2574
  13. Gerasimova E.A., Radaykina L.V., Zagumyonnyi D.G., Tikhonenkov D.V., Drachko D., Zlatogursky V.V. Morphology and spicules elemental composition of Marophrys nikolaevi spec. nov. (Haptista: Centroplasthelida). European Journal of Protistology. 2022, V.84: 125888 DOI: 10.1016/j.ejop.2022.125888

 

Публикации в прочих журналах

 

  1. Немцева Н.В. Паразитизм как форма симбиотических отношений. Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. 2022, №4, 24с. [Электр. ресурс] (URL: http://elmag.uran.ru:9673/magazine/Numbers/2022-4/Articles/NVN-2022-4.pdf). DOI: 10.24411/2304-9081-2022-14001
  2. А.В. Валышев Антагонистические взаимоотношения Pseudomonas aeruginosa с другими микроорганизмами. Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. 2022. 4: 9с.[Электр. ресурс] DOI: 10.24411/2304-9081-2022-14002
  3. Миндолина Ю.В. Применение сканирующей электронной микроскопии для исследования протистов меромиктических водоемов Арктики. Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. 2022. 4: 9с. [Электр. ресурс] (URL: http://elmag.uran.ru:9673/ magazine/Numbers/2022-4/Articles/MYV-2022-4.pdf). DOI: 10.24411/2304-9081-2022-14003
  4. Катаев В.Я. Оптимальный метод пробоподготовки клеток грамотрицательных бактерий для сканирующей электронной микроскопии. Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. 2022. 3: 9 с. [Электр. ресурс] (URL: http://elmag.uran.ru:9673/magazine/Numbers/ 2022-3/Articles/VYK-2022-3.pdf). DOI: 10.24411/2304-9081-2022-13003
  5. Черкасова Ю.И., Мячина Ю.Л., Крайникова Д.А. Современные представления о возбудителе урогенитального трихомониаза. Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. 2022. 3: 22с. [Электр. ресурс] (URL: http://elmag.uran.ru:9673/magazine/Numbers/2022-3/ Articles/CYI-2022-3.pdf). DOI: 10.24411/2304-9081-2022-13004
  6. Игнатенко М.Е. Методы подготовки водорослей к исследованию с использованием сканирующей электронной микроскопии. . Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. 2022. 4. 8с. [Электр. ресурс] (URL: http://elmag.uran.ru:9673/magazine/Numbers/ 2022-2/Articles/IME-2022-2.pdf). DOI: 10.24411/2304-9081-2022-12003
  7. Инчагова К.С. Комбинирование малых молекул растительного происхождения приводит к усилению QS-ингибирующего действия в отношении системы «quorum sensing» Chromobacterium substsugae. Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН 2022. 1: 6c. [Электр. ресурс] (URL: http://elmag.uran.ru:9673/magazine/Numbers/2022-1/Articles/ IKS-2022-1.pdf) DOI: 10.24411/2304-9081-2022-11003.

2021

Статьи в отечественных научных журналах, входящих в перечень ВАК

 

  1. Карташова О.Л., Пашкова Т.М., Пашинина О.А., Морозова Н.В. Антицитокиновая активность и способность к продукции цитокиноподобных веществ стафилококков, выделенных из секрета предстательной железы у мужчин с симптомами урогенитальной инфекции. Российский иммунологический журнал. 2021. Т. 24. 2: 257-260. (https://doi.org/10.46235/1028-7221-995-AAA)
  2. Гриценко В.А., Тяпаева Я.В., Зурочка А.В., Добрынина М.А. Сравнительный анализ бактерицидных свойств синтетического пептида активного центра ГМ-КСФ – ZP2 в отношении грамотрицательных бактерий разной таксономической принадлежности. Российский иммунологический журнал. 2021. Т. 24, №2: 221-228. DOI: 46235/1028-7221-1016-CAO
  3. Кочкина Е.Е., Карташова О.Л., Сычева М.В. Антииммуноглобулиновая активность бактерий рода Enterococcus, выделенных от животных. Достижения науки и техники АПК. 2021. 35. 1: 43-47. (DOI: 24411/0235-2451-2021-10108).
  4. Бекпергенова А.В., Бондаренко Т.А., Перунова Н.Б., Челпаченко О.Е., Никифоров И.А. Связь показателей спермограммы мужчин с хроническим бактериальным простатитом с уровнем локальных антимикробных факторов. Российский иммунологический журнал. 2021, 24(2). С. 291-296. https://doi.org/10.46235/1028-7221-1029-RBS

  

Статьи в отечественных научных журналах, включенные в систему цитирования Web of Science/ Scopus.

 

  1. Семенов А.В. Пептидогликан клеточных стенок бактерий влияет на конкурентные свойства микроорганизмов //Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. – 2021. – Т. 172. – №. 8. – С. 193-197. DOI: 10.47056/0365-9615-2021-172-8-193-197
  2. Олейник В.В., Кремлева Е.А., Семёнов А.В., Сгибнев А.В. Интравагинальная пробиотическая терапия как способ управления ВПЧ-инфекцией женских гениталий. Вопросы гинекологии, акушерства и перинатологии. – 2021. Т. 20. — №3.  С.37–41. DOI: 10.20953/1726-1678-2021-3-37-41
  3. Пашкова Т.М., Морозова Н.В., Кузьмин М.Д., Карташова О.Л., Попова Л.П. Характеристика патогенного потенциала Escherichia coli, выделенных у пациентов с калькулезным пиелонефритом. Урология.2021.4:19-24.DOI: https://dx.doi.org/10.18565/urology.2021.4.19-24
  4. Зурочка А.В., Зурочка В.А., Добрынина М.А., Гриценко В.А.  Иммунобиологические свойства гранулоцитарно-макрофагального колониестимулирующего фактора и синтетических пептидов его активного центра. Медицинская иммунология. 2021. Т. 23. 5: 1033-1056. (DOI: 10.15789/1563-0625-IPO-2216)
  5. Челпаченко О.Е., Фисенко А.П., Данилова Е.И., Никифоров И.А., Перунова Н.Б., Иванова Е.В., Чайникова И.Н. Прогнозирование развития реактивного артрита у детей с дисплазией соединительной ткани. Вопросы практической педиатрии. 2021. 16 (4): 54-61. DOI: 10.20953/1817-7646-2021-4-54-61
  6. Deryabin, DG , Galadzhieva, AA , Kosyan, DBDuskaev, GK. Plant-Derived Inhibitors of Density-Dependent Communication in Bacteria: Diversity of Structures, Bioactivity Mechanisms, and Sources of Origin. MICROBIOLOGY 90. 6: 702-720 DOI 10.1134/S0026261721060059
  7. Игнатенко М.Е., Яценко-Степанова Т.Н., Уржумов А.А. Новые находки видов рода Mallomonas (Chrysophyceae, Synurales) для Оренбургской области (Южный Урал, Россия) // Новости систематики низших растений. 2021. 55(2): 315–323. https://doi.org/10.31111/nsnr/2021.55.2.315.
  8. Gerasimova E.A. Morphology and species composition of centrohelid heliozoans (Centroplasthelida) from the continental lowland river with salinity gradient // Inland Water Biology. 2021. Vol. 14. P. 652-661. https://doi.org/10.1134/S1995082921060043
  9. Щуплова Е.А., Кузьмин М.Д. Оценка антибиотикочувствительности микроорганизмов, выделенных от больных с острым пиелонефритом в стадии гнойного воспаления, при их  внутриэритроцитарной локализации (эксперимент in vitro) // Урология, 2021, 6, стр. 25-29.
  10. Челпаченко О.Е., Данилова Е.И., Чайникова И.Н. Элиминационно-ирригационная терапия для поддержания гомеостаза носовой полости у детей раннего возраста. Медицинский совет. 2021;(1):50–58. doi: 10.21518/2079-701X-2021-1-50-58.
  11. Олейник В.В. , Кремлева Е.А., Сгибнев А.В. Влияние интравагинальной пробиотической терапии на течение папилломавирусной инфекции // Бюллетень сибирской медицины. 2021; 20 (4): 11–17; https://doi.org/10.20538/1682-0363-2021-4-11-17
  12. Бухарин О.В., Андрющенко С.В., Перунова Н.Б., Иванова Е.В. Механизмы персистенции индигенных бифидобактерий под действием ацетата в кишечном биотопе человека. Журнал микробиологии, эпидемиологи и иммунобиологии. 2021, 98(3). С. 276 – 282. DOI: https://doi.org/10.36233/0372-9311-86

 

Публикации в зарубежных изданиях, включенных в систему цитирования Web of Science, иных системах цитирования

 

  1. Sycheva M.V., Popova E.V., Khlopko Y.A., Pashkova T.M., Kartashova O.L., Kataev V.Y., Gerasimenko V.V., Vasilchenko A.V. Genome analysis of the probiotic strain Enterococcus faecium Ef79OSAU. Microbiology Resource Announcements. 2021. 10: e00691-21. https://doi.org/ 10.1128/MRA.00691-21.
  2. Tinkov A.A., Martins A.C., Avila D.S., Gritsenko V.A., Skalny A.V., Santamaria A., Lee E., Bowman A.B., Aschner M. Gut microbiota as a potential player in Mn-induced neurotoxicity. Biomolecules. 2021. 11: 1292. (https://doi.org/10.3390/biom11091292).
  3. Alekseenko S.I., Skalny A.V., Karpischenko S.A., Tinkov A.A. Serum, Whole Blood, Hair, and Mucosal Essential Trace Element and Mineral Levels in Children with Verified Chronic Rhinosinusitis Undergoing Functional Endoscopic Sinus Surgery. Biological Trace Element Research. 2021. 199(6): P.2112-2120. DOI: 10.1007/s12011-020-02333-2
  4. Skalny A.V., Aschner M., Lei X.G., Gritsenko V.A., Santamaria A., Alekseenko S.I., Prakash N.T., Chang J.-S., Sizova E.A., Chao J.C.J., Aaseth J., Tinkov A.A. Gut Microbiota as a Mediator of Essential and Toxic Effects of Zinc in the Intestines and Other Tissues. International Journal of Molecular Sciences. 2021. 22: 13074. https:// doi.org/10.3390/ijms222313074.
  5. Balkin A.S., Plotnikov A.O., Gogoleva N.E., Gogolev Y.V., Demchenko K.N., Cherkasov S.V. Cappable-Seq Reveals Specific Patterns of Metabolism and Virulence for Salmonella Typhimurium Intracellular Survival within Acanthamoeba castellanii. Int. J. Mol. Sci. 2021. V. 22. №16. P. 9077. https://doi.org/10.3390/ijms22169077
  6. Kovaleva, O., Podlesnaya, P., Rashidova, M., Samoilova, D., Petrenko, A., Mochalnikova, V., Kataev, V., Khlopko, Y., Plotnikov, A., & Gratchev, A. (2021). Prognostic significance of the microbiome and stromal cells phenotype in esophagus squamous cell carcinoma. Biomedicines, 9(7). https://doi.org/10.3390/biomedicines9070743
  7. Ferrer B, Prince, LM, Tinkov, AA., Santamaria A, Bowman AB, Aschner M (3) Chronic exposure to methylmercury disrupts ghrelin actions in C57BL/6J mice. FOOD AND CHEMICAL TOXICOLOGY, 2021 (JAN), 147, Номер статьи 111918 DOI 10.1016/j.fct.2020.111918
  8. Ignatenko M. E., Selivanova E. A., Khlopko Y. A.,  Yatsenko-Stepanova T. N. Algal and cyanobacterial diversity in saline rivers of the Elton Lake Basin (Russia) studied via light microscopy and next-generation sequencing // Biosystems Diversity. 2021. 29(1): 59–66. doi:10.15421/012108
  9. Ignatenko M.E., Yatsenko-Stepanova T.N., Kalmykova O.G. 2021. The first evidence about the algae flora of the reservoirs of the «Aschisayskaya Steppe» plot (State Nature Reserve «Orenburgsky») // В сборнике BIO Web of Conferences «Northern Asia plant diversity: current trends in research and conservation»: 38, 00042. DOI: https://doi.org/10.1051/bioconf/20213800042
  10. Filatov A.V., Perepelov A.V., Shashkov A.S., Burygin G.L., Gogoleva N.E., Khlopko Y.A., Grinev V.S. Structure and genetics of the O-antigen of Enterobacter cloacae K7 containing di-N-acetylpseudaminic acid. Carbohydrate Research. 2021. Vol. 508. P. 108392. https://doi.org/10.1016/j.carres.2021.108392.
  11. Orlova E.A., Ogarkov O.B., Suzdalnitskiy A.E., Khromova P.A., Sinkov V.V., Plotnikov A.O., Belkova N.L., Zhdanova S.N. Analysis of microbial diversity in the caseous necrosis of the tuberculosis foci. Molecular Genetics, Microbiology and Virology. 2021. Vol. 39(3). P. 18–24. https://doi.org/10.17116/molgen20213903118
  12. Zhurlov O.S. Monitoring of Microbial Communities of Surface Soil // “Fundamental and Applied Scientific Research in the Development of Agriculture in the Far East (AFE 2021)” Earth and Environmental Science (EES IOP).
  13. Zakharyuk, A, Valyshev, A, Plotnikov, A, Kopitsyn, D, Suzina, N, Shcherbakova, V. Trichococcus shcherbakoviae subsp. psychrophilus subsp. nov., a psychrotolerant facultative anaerobe isolated from a cold spring.  INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY, 2021, 71, 10, DOI 10.1099/ijsem.0.005068
  14. Aschner, M, Nguyen, TT, Sinitskii, AI, Santamaria, A, Bornhorst, J, Ajsuvakova, OP, Skalny, AV, Tinkov, AA (2). Isolevuglandins (isoLGs) as toxic lipid peroxidation byproducts and their pathogenetic role in human diseases. FREE  RADICAL BIOLOGY AND MEDICINE, 2021 (JAN), 162, P.266-273. DOI 10.1016/j.freeradbiomed.2020.10.024
  15. Ferrer B., Prince, LM, Tinkov, AA (3), Santamaria A, Farina, M, Rocha, JB, Bowman, AB, Aschner, M (2). Chronic exposure to methylmercury enhances the anorexigenic effects of leptin in C57BL/6J male mice. FOOD AND CHEMICAL TOXICOLOGY. 2021 (JAN), 147, 111924, DOI 10.1016/j.fct.2020.111924
  16. Amelia Faradina,  Sung-Hui TsengTe-Hsuan Tung,  Shih-Yi HuangYu-Chieh Lee,  Anatoly V. Skalny, Alexey A. Tinkov , Seu-Hwa ChenYung-Kun Chuangj  and  Jung-Su Chang. High-dose ferric citrate supplementation attenuates omega-3 polyunsaturated fatty acid biosynthesis via downregulating delta 5 and 6 desaturases in rats with high-fat diet-induced obesity // Food & Function, 2021,12, 11819-11828 DOI https://doi.org/10.1039/D1FO02680A 

 

Публикации в прочих журналах

 

  1. Валышев А.В., Валышева Н.А. Встречаемость Exophiala dermatitidis в образцах фекалий человека и животных. Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. 2021. 2: 6с. [Электронный ресурс]
  2. Bukharin O.V., Perunova N.B., Deep P.-T., Ivanova E.V. Covid And Oxytocin: Looking For Microbial Symbiosis. Morecambe Bay Medical Journal. 2021, 8 (10). p. 279 – 283. https://doi.org/10.48037/mbmj.v8i10.1312

 

2020

Публикации в отечественных научных изданиях, включенных в систему цитирования  Web of Science / Scopus

 

  1. Сгибнев А. В., Кремлева Е. А. Медиаторы воспаления как регуляторы устойчивости микробиоты к действию повреждающих факторов //Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. 2020. Т. 170. №. 7. С. 61-65.
  2. Олейник В.В., Кремлева Е.А., Сгибнев А.В. Влияние нормальной микрофлоры влагалища на течение папилломавирусной инфекции // Вопросы гинекологии, акушерства и перинатологии. 2020. Т. 19, №4, С. 63–69. DOI: 10.20953/1726-1678-2020-4-63-69.
  3. Бухарин О.В., Перунова Н.Б., Чайникова И.Н., Иванова Е.В., Андрющенко С.В. Ускоренный метод определения «свой-чужой» микроорганизмов в реакции агглютинации // Инфекция и иммунитет. 2020; Т. 10, № 4. С. 792–796. https://doi: 10.15789/2220-7619-AAM-1482.
  4. Бухарин О.В., Кузьмин М.Д., Перунова Н.Б., Иванова Е.В., Бекпергенова А.В., Бондаренко Т.А. Характеристика микробиоты и цитокинового профиля спермоплазмы у больных хроническим бактериальным простатитом. Урология. 2020;5:67-72 https://doi: 10.18565/urology.2020.5.67-72.
  5. Shayhutdinova A.A., Krivosheina M.G. 2020. Invertebrate animals of hyperhaline reservoirs of the Orenburg Region (Russia) // Russian Entomol. J. Vol.29. No.3. P.337–342. doi: 10.15298/rusentj.29.3.15.
  6. Дерябин Д.Г., Галаджиева А.А., Дускаев Г.К. Скринин гпроизводныхn-гексанамида и 2h-1,3-бензодиаксола как модуляторов «кворум сенсинга» у Сhomobacterium violaceum // Микробиология. – 2020. – т. 89. – № 6.  с. 728-736
  7. Зурочка В.А., Забков О.И., Добрынина М.А., Гриценко В.А., Давыдова Е.В., Чукичев А.В., Забокрицкий Н.А., Сарапульцев А.П., Зурочка А.В. Иммунологические критерии эффективности комплексной этиопатогенетической терапии у больных хронической вирусной инфекцией, ассоциированной с вирусом Эпштейна–Барр. Инфекция и иммунитет. 2020. Т.10. № 2. С. 338-346. (https://doi.org/10.15789/2220-7619-CDC-1141)

 

Публикации в зарубежных научных изданиях, включенных в систему цитирования Web of Science / Scopus

 

  1. Sgibnev A., Kremleva E. Probiotics in addition to metronidazole for treatment Trichomonas vaginalis in the presence of BV: a randomized, placebo-controlled, double-blind study // European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases. Vol. 39. №2. Р. 345-351. DOI: 10.1007/s10096-019-03731-8.
  2. Timokhina T.H, Perunova N.B., Malyugina O.A. Khamitova I., Maslova Important Aspects of Staging of Biofilm’s Formation and Justification of Time Intervals of Conduction of Prophylactics of Infectious Complications. Journal of Biomimetics, Biomaterials and Biomedical Engineering. 2020, 46. 17-24. 10.4028/www.scientific.net/JBBBE.46.17.
  3. Kashkak E.S., KataevV.Ya.,Khlopko Y.A., Budagaeva V.G., Danilova E.V., Oorzhak U.S., Dagurova O.P., Plotnikov A.O. Data on draft genome sequence of Stenotrophomonas sp. SAM-B isolated from a mineral cold spring located in Tyva, Southern Siberia // Data in Brief, 2020, DOI: 10.1016/j.dib.2020.106278.
  4. Kovaleva O., Podlesnaya P., Rashidova M., Samoilova D., Petrenko A., Zborovskaya I., Mochalnikova V., Kataev V., Khlopko Y., Plotnikov A., Gratchev A. Lung Microbiome Differentially Impacts Survival of Patients with Non-Small Cell Lung Cancer Depending on Tumor Stroma Phenotype // Biomedicines 2020, 8(9), 349. DOI:10.3390/biomedicines8090349.
  5. Ivanova E.V., Bekpergenova A.V., Perunova N.B., Andryuschenko S.V., Bondarenko T.A., Bukharin O.V. Genome sequence data of Lactobacillus ruminis ICIS-540, isolated from the intestine of a healthy woman. // Microbiology Resource Announcements 2020. 9:e00900-20. https://doi.org/10.1128/MRA.00900-20.
  6. Natalia E. Gogoleva, Tatiana A. Konnova, Timur T. Ismailov, Alexander S. Balkin, Andrey A. Belimov, Yuri V. Gogolev. Dataset for transcriptome analysis of abscisic acid degrading bacterium Novosphingobium sp. P6W // Data in Brief (2020). 28: 105001. https://doi.org/10.1016/j.dib.2019.105001.
  7. Natalia E. Gogoleva, Tatiana A. Konnova, Alexander S. Balkin, Andrey O. Plotnikov, Yuri V. Gogolev. Transcriptomic data of Salmonella enterica enterica serovar Typhimurium str. 14028S treated with novobiocin // Data in Brief (2020). 29: 105297. https://doi.org/10.1016/j.dib.2020.105297.
  8. Natalia E. Gogoleva, VladimirYa. Kataev, Alexander S. Balkin, Andrey O. Plotnikov, Elena I. Shagimardanova, Anastasia M. Subbot, Sergey V. Cherkasov, Yuri V. Gogolev. Dataset for transcriptome analysis of Salmonella enterica enterica serovar Typhimurium strain 14028S response to starvation // Data in Brief (2020) 31:106008. https://doi.org/10.1016/j.dib.2020.106008.
  9. Sinkov V.V., Ogarkov O.B., Plotnikov A.O., Gogoleva N.E.,Zhdanova S.N., Pervanchuk V.L., Belkova N.L., Koshcheev M.E., Thomas T.A., Liu J., Zorkaltseva E.Y., Heysell S.K. Metagenomic analysis of mycobacterial transrenal DNA in patients with HIV and tuberculosis coinfection // Infection, Genetics and Evolution. Vol. 77, Jan. 2020, 104057.
  10. Gogoleva O.A., Shchuplova E.A. The influence of non-tuberculous mycobacteria on the interaction of opportunistic microorganisms with erythrocytes // Folia Microbiologica Т.65, V.2, P 417-421, 2020, https://doi.org/10.1007/s12223-019-00748-6.
  11. Kataev V.Y.,Sleptsov I.I., Martynov A.A., Aduchiev B.K., Khlopko Y.A., Miroshnikov S.A., Cherkasov S.V., Plotnikov A.O. Data on rumen and feces microbiota profiles of Yakutian and Kalmyk cattle revealed with high-throughput sequencing of 16S rDNA amplicons and data analysis // Data in Brief, 2020
  12. Skalny A.V., Rink L., Ajsuvakova O.P., Aschner M., Gritsenko V.A., Alekseenko S.I., Svistunov A.A., Petrakis D., Spandidos D.A., Aaseth J., Tsatsakis A., Tinkov A.A. Zinc and respiratory infections: Perspectives for COVID-19 (Reveiw). //International Journal of Molecular Medicine. 2020. 46: 17-26. (https://doi.org/10.3892/ijmm.2020.4575).
  13. Ke T., Santamaria A., Tinkov A.A., Bornhorst J., Aschner M. Generating Bacterial Foods in Toxicology Studies with Caenorhabditis elegans. // Current Protocols in Toxicology. 2020. 84(1), e94. https://doi.org/10.1002/cptx.94.
  14. Noor Rohmah Mayasari, Dang Khanh Ngan Ho, David J. Lundy, Anatoly V. Skalny, Alexey A. Tinkov, I-Chun Teng, Meng-Chien Wu, Amelia Faradina, Afrah Zaki Mahdi Mohammed, Ji Min Park, Yi Jing Ngu, Sabrina Aline, Naila Maya Shofia, Jung-Su Chang. Impacts of the COVID-19 Pandemic on Food Security and Diet-Related Lifestyle Behaviors: An Analytical Study of Google Trends-Based Query Volumes. // Nutrient. 2020. 12; 3103 (https://doi.org/10.3390/nu12103103).
  15. Sycheva M.V., Popova L.P., Pashkova T.M., Khlopko Y.A., Kartashova O.L., Andreeva A.V., Poshvina D.V. Genomic seguence of the strain Enterococcus faecium ICIS 18. //Microbiology Resource Announcements. 2020. T.9. № 2. e 01349-19.
  16. Markov A.A, Timokhina T.H, Perunova N.B., Malyugina O.A. Production Technique of Bifidobacterium’s Exo-metabolites with High Antimicrobial Activity towards Staphylococcus aureus. //Systematic Review Pharmacy, 2020, 11(2): 273-277. doi:10.5530/srp.2020.2.42.
  17. Gerasimova E.A., Plotnikov A.O., Khlopko Y.A., Zlatogursky V.V. Multiple Euryhaline Lineages of Centrohelids (Haptista: Centroplasthelida) in Inland Saline Waters Revealed with Metabarcoding // Journal of Eukaryotic Microbiology (2020) 67: 223-231. https://doi.org/10.1111/jeu.12776.
  18. Ignatenko M.E., Yatsenko-Stepanova  T.N.,  Kalmykova O.G. Structural and functional characteristics of algae flora in water bodies of the natural monuments in Orenburg forest steppe Trans Volga region (Russia) // BIO Web of Conferences «Plant Diversity: Status, Trends, Conservation Concept», E.V. Banaev, M.A. Tomoshevich and Y.G. Zaytseva (Eds.). Vol. 24, 2020. C. 00027.DOI: https://org/10.1051/bioconf/20202400027.
  19. KochkinaЕ., TorshkovА., Kislinskaya L., Kartashova O., Sycheva M. The change in the energy metabolism of broiler chickens under the influence of Enterococcus faecium ICIS 96, Issue E3S Web Conf. Volume 210, 2020. Р.11. https://doi.org/10.1051/e3sconf/202021006008

Монографии

Запросы монографий и их электронных версий принимаются через форму обратной связи

Зурочка А.В., Гриценко В.А., Зурочка В.А., Добрынина М.А., Черешнев В.А. ; под общей редакцией А.В. Зурочки. Гранулоцитарно-макрофагальный колониестимулирующий фактор (ГМ-КСФ) и его синтетические аналоги: иммунобиологические эффекты и клиническое применение. / Екатеринбург, УрО РАН, 2021. – 288 с. ISBN 978-5-7691-2549-2

В монографии изложены современные представления о структуре, функциях и механизмах действия гранулоцитарно-макрофагальный колониестимулирующего фактора (ГМ-КСФ), отражены известные и недавно обнаруженные иммунобиологические эффекты данного цитокина, его рекомбинантных форм и синтетических аналогов его активного центра, а также рассмотрены возможные области их клинического применения. Охарактеризовано участие ГМ-КСФ в гемопоэзе и дифференцировке миелоидных клеток, влияние данного цитокина на функциональную активность иммунокомпетентных и тканевых клеток, развитие и течение инфекционно-воспалительных процессов. Представлены материалы по клиническому использованию ГМ-КСФ и его рекомбинантных форм в гематологии, онкологии, репродуктологии и лечении системных процессов и заболеваний инфекционной природы. Авторами обобщены недавно обнаруженные иммунобиологические свойства синтетических пептидов активного центра ГМ-КСФ, свидетельствующие о наличии у них не только иммунотропных эффектов, но и антимикробной активности и репарационного потенциала, не характерных для цельной молекулы ГМ-КСФ. Проанализированы опыт и перспективы клинического применения синтетического аналога ГМ-КСФ (пептид ZP2) и созданных на его основе косметических средств. Монография ориентирована на широкий круг специалистов медико-биологического профиля, работающих в области аллергологии и иммунологии, инфектологии и репарационной медицины.

А. А. Вялкова, С. А. Чеснокова, С. В. Плотникова, В. А. Гриценко, И. В. Зорин, Л. М. Гордиенко ; под общей редакцией А. А. Вялковой. Тубулоинтерстициальная болезнь и хроническая болезнь почек у детей в работе врача первичного звена здравоохранения. / Оренбург : Изд-во ОрГМУ, 2 0 2 1. – 2 5 6 с. : ил.

Монография посвящена проблеме тубулоинтерстициальной болезни и хронической болезни почек у детей. Особое внимание уделено ранней диагностике патологии в условиях первичного звена здравоохранения на основе выявления факторов риска, патогенетических механизмов формирования и прогрессирования тубулоинтерстициальной болезни и хронической болезни почек в детском возрасте. Представлены алгоритмы диагностики тубулоинтерстициальной болезни и хронической болезни почек, а также мониторинг нефрологического здоровья детей. Излагается концептуальная основа профилактики прогрессирования тубулоинтерстициальной болезни почек и формирования хронической болезни почек в детском возрасте. Книга предназначена для участковых врачей–педиатров, педиатров-нефрологов первичного звена здравоохранения.

О.В. Бухарин, А.А. Стадников, Н.Б. Перунова. Роль окситоцина и микробиоты в регуляции взаимодействий про- и эукариот при инфекции, Екатеринбург: УрО РАН, 2018. – 247 с.

В монографии представлены новые материалы по изучению биологической роли нонапептидного гормона – окситоцина в регуляции гомеостаза (здоровья) хозяина при инфекционной патологии. Рассмотрены вопросы гипоталамической нейросекреции и её роль в структурно-функциональном гомеостазе организма. Представлены данные по изучению роли этих нонапептидов при взаимодействии про- и эукариот, а также обсуждается феномен транслокации бактерий и реактивных изменений в гипоталамо-гипофизарной нейросекреторной системе. Приведены новые материалы авторов по изучению защитных механизмов действия окситоцина при инфекции. Описаны положительные эффекты использования окситоцина при инфекции на различных моделях: инфекционной патологии, стоматологии, хирургии, оториноларингологии, терапии и др. разделах медицины. Выявлено подавление окситоцином активности персистентного потенциала патогенов, что раскрывает один из важнейших механизмов усиления действия препарата в комплексном лечении различных нозоформ в комбинации с антибиотиками. Показана роль нормальной микрофлоры (бифидо- и лактофлора) в защите человека от инфекции и ее связь с окситоцином. Книга адресована микробиологам, биохимикам, физиологам, патофизиологам и читателям широкого клинического профиля.

Заболотная С.Г., Бухарин О.В. Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН: вчера, сегодня, завтра. Екатеринбург: УрО РАН, 2016. 367 с.

В книге, посвященной 20-летию Института, отражены основные этапы создания и формирования ИКВС УрО РАН. Представлена «платформа», на базе которой стала возможной организация Института. Этот «вчерашний день» позволяет понять, в каких условиях проходило становление научной организации. Итоги сегодняшнего дня представлены основным массивом научных материалов с 1997 по 2016 год. Материал основан на имеющихся данных пятилетних научных отчетов Института, фактура которых позволяет понять логику и динамику научных исследований – от истоков до решения сегодняшних проблем, включая новое направление: «инфекционную симбиологию». Вот почему после «переброски моста» от персистенции к симбиозу и, расширив генетический полигон исследований, был создан Центр коллективного пользования в Институте и коллектив с оптимизмом смотрит в будущее, в завтрашний день. Книга представляет интерес для историков науки и специалистов медико-биологического профиля.

Бухарин О.В., Тимохина Т.Х., Перунова Н.Б. Хронобиология микроорганизмов. - Екатеринбург: УрО РАН, 2015. – 212 с

В монографии представлены материалы по характеристике ритмометрических параметров микроорганизмов в норме и при инфекционной патологии. Выявлен спектральный состав ритмов бактерий и грибов, свидетельствующий о различных суточных периодах их активности, что отражает стратегию распределения ресурсов микробной популяции и представляются веским аргументом саморегуляции микробами продукции факторов патогенности. Не обойден вниманием и симбиотический аспект инфекционной патологии. При изучении ритмических процессов микросимбионтов было выявлено модулирующее влияние экзометаболитов ассоциативной и доминантной микробиоты на эти процессы, что открывает новые возможности для понимания механизмов формирования и функционирования микросимбиоценоза при ассоциативном симбиозе человека. Включен в книгу и раздел лекарственной регуляции биоритмов микроорганизмов, имеющий значение для врачебной практики. Использование хронобиологического подхода позволило выявить временные интервалы, когда возбудитель оказывается наиболее уязвим для антимикробной терапии, что открывает перед клиницистом новые возможности эффективного лечения. Книга адресована микробиологам, физиологам, биологам, специалистам клинического профиля и может быть полезна для преподавателей, аспирантов и студентов указанных специальностей.

Тарасенко В.С., Фадеев С.Б., Бухарин О.В. Хирургическая инфекция мягких тканей (клинико-микробиологический аспект). Екатеринбург: УрО РАН, 2015. 180 с.

В монографии систематизирован материал клинико-бактериологического профиля хирургической инфекции мягких тканей. На основе большого массива данных, полученных авторами, проведен анализ динамики видового состава и антибиотикочувствительности возбудителей хирургической инфекции мягких тканей за 20-летний период. Показана связь видового состава бактериальных патогенов, их биологических характеристик с особенностями клиники заболеваний. Представлена оценка характера межмикробных взаимоотношений в бактериальных ассоциациях очагов хирургической инфекции с позиций современной концепции микросимбиоценоза. Описанные клинико-бактериологические параллели дают возможность рассматривать персистентный потенциал микроорганизмов в качестве «биомишени» для терапевтического воздействия в целях управления инфекционным процессом. Предложены подходы к повышению эффективности этиотропной терапии хирургической инфекции, основанные на снижении частоты смены видового состава микрофлоры гнойно-воспалительных очагов и подавлении персистентного потенциала бактериальных патогенов. Книга адресована хирургам и микробиологам, а также может быть полезна преподавателям, аспирантам и ординаторам указанных профилей.

Бухарин О.В., Перунова Н.Б. Микросимбиоценоз. Екатеринбург: УрО РАН, 2014. – 260 с.

В монографии в соответствии с концепцией ассоциативного симбиоза инфекция рассмотрена как трехвекторная система. Основное внимание уделено наименее изученному вектору - микросимбиоценозу. Дано определение термина микросимбиоценоз, включающее его структуру и физиологические функции при формировании гомеостаза хозяина. Представлен системообразующий фактор микросимбиоценоза и оценена роль персистентного потенциала микроорганизмов в реализации их биокоммуникативной активности. Представлены материалы по вопросу лекарственной регуляции микросимбиоценоза, где систематизированы оригинальные данные по влиянию антибиотиков, про- и пребиотиков, иммуномодуляторов, гормонов, фитопрепаратов на персистентный потенциал микросимбионтов. Особое место в книге уделено феномену межмикробного распознавания «свой – чужой», опережающему «иммунологическое распознавание» «чужеродного» материала иммунной системой хозяина. Определены универсальные показатели физиологических функций микросимбионтов и описан алгоритм реализации феномена по оппозитному эффекту изучаемых параметров в условиях взаимодействий пары «доминант – ассоциант». Книга адресована микробиологам, экологам, биологам и специалистам клинического профиля, может быть полезна для преподавателей, аспирантов и студентов указанных профилей.

Бухарин О.В., Перунова Н.Б., Иванова Е.В. Бифидофлора при ассоциативном симбиозе человека. Екатеринбург: УрО РАН, 2014. 212 с.

В монографии представлены материалы, отражающие общую характеристику бифидофлоры, включая генотипирование, морфологию и физиологию микроорганизмов. Особое место в книге занимают вопросы взаимодействия бифидофлоры с микросимбионтами с учетом динамики универсальных физиологических функций ассоциантов: репродуктивной и адаптивной (персистентной). Систематизированы фундаментальные и прикладные аспекты использования бифидобактерий с учетом накопленных данных на сегодняшний день. Отражена фундаментальная роль бифидофлоры в качестве регулятора гомеостаза хозяина. Рассмотрен круг возможного использования бифидобактерий для прикладных целей – это и критерии для отбора новых эффективных пробиотиков, создание новых симбиотиков (синбиотиков) и получение эффективных лечебных биопрепаратов. Книга адресована микробиологам, физиологам, экологам, биологам, специалистам клинического профиля и может быть полезна для преподавателей, аспирантов и студентов указанных направлений.

Бухарин О.В., Валышев А.В. Биология и экология энтерококков. Екатеринбург: УрО РАН, 2012. 227с.

Монография посвящена биологии и экологии одной из наиболее значимых групп грамположительных бактерий – энтерококков. Дана общая характеристика энтерококков, представлены современные сведения по таксономии и номенклатуре энтерококков, их экологии. Охарактеризованы факторы вирулентности и персистенции энтерококков. Рассмотрены методические подходы к прогнозированию инфекционных процессов энтерококковой этиологии. Описаны механизмы природной и приобретенной устойчивости бактерий данной группы к антимикробным препаратам. Монография адресована микробиологам, экологам, эпидемиологам, инфекционистам, специалистам лабораторной службы, клиницистам различных специальностей.

Бухарин О.В., Лобакова Е.С., Перунова Н.Б., Усвяцов Б.Я., Черкасов С.В. Симбиоз и его роль в инфекции. Екатеринбург: УрО РАН, 2011. 231с.

В монографии рассмотрен симбиоз в качестве биологической основы инфекции. Обосновано понятие ассоциативного симбиоза, инфекция рассматривается в качестве его модельной системы. С позиций симбиологии описаны и оценены перспективы теоретического и прикладного аспектов изучения симбиоза. Особое внимание уделено микросимбиоценозу, определяющему взаимодействие в системе «про-прокариот». Приведены новые материалы о биорегуляции симбионтов как основе функционирования микросимбиоценозов; об ауторегуляторных механизмах динамики популяции микроорганизмов; о биопленкообразовании микросимбионтов как форме их персистенции в организме хозяина. На модели женского репродуктивного тракта с позиций ассоциативного симбиоза описаны: взаимодействия хозяина и ассоциативных микроорганизмов, нормофлоры в поддержании колонизационной резистентности хозяина, основные типы изменений ассоциативного симбиоза при инфекционной патологии и клиническое значение этих нарушений. В книгу включены также материалы немедицинского характера об инфекционной активности природных комплексов микросимбионтов в отношении несимбиотрофных растений. Монография адресована микробиологам, экологам и представителям клинических специальностей, может быть полезна для преподавателей, аспирантов и студентов указанных профилей.

Бухарин О.В., Немцева Н.В. Микробиология биоценозов природных водоемов. Екатеринбург: УрО РАН, 2008.156 с.

Представлены материалы по изучению взаимоотношений симбионтов в гидробиоценозах природных водоемах. Описаны особенности симбиотических взаимоотношений в различных структурных компонентах микробиоценозов, включая известные связки: «простейшие–бактерии», простейшие–водоросли», «водоросли-водоросли», «водоросли–бактерии», «бактерии–водоросли». Раскрыто значение персистентного потенциала микросимбионтов при контракте с хозяином на примере различных модельных систем: «лизоцим-антилизоцим», «гистон-антигистон», «каталаза-перекись водорода». Приведены новые данные по регуляции межмикробных отношений симбионтов. Особое внимание уделено прикладному аспекту феномена ассоциативного симбиоза, где микробные биоценозы рассмотрены в качестве информативной компоненты биоты и могут быть использованы для проведения мониторинга качества водной среды в санитарно-гигиенических и экологических целях и для решения ряда других вопросов лабораторной практики. Книга адресована микробиологам, гидробиологам, эпидемиологам, экологам, а также врачам системы послевузовского профессионального образования медико-профилактического и экологического профилей.

Биоиндикация экологического состояния равнинных рек / под ред. О.В. Бухарина, Г.С. Розенберга; Ин-т экологии Волж. бассейна РАН; Ин-т биологии развития им. Н.К. Колокольцова РАН; Ин-т клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН. М.: Наука, 2007. 403 с.

В книге представлены работы, отражающие современные проблемы экологии лотических систем. Обобщены результаты многолетних полевых и экспериментальных исследований современного экологического состояния одной из самых загрязненных рек Нижнего Поволжья – равнинной р. Чапаевка (приток Саратовского водохранилища). Особое внимание уделено биоиндикационному анализу, изучению изменения структуры и функционирования сообществ в условиях эвтрофирования и токсификации реки, реакции экосистемы реки на изменение антропогенной нагрузки. Предложены методические подходы к интегральной биологической оценке состояния экосистемы реки, мониторинговым исследованиям равнинных рек. Определены пути дальнейших исследований в области биоиндикационных области биоиндикационных исследований функционирования логических экосистем. Для экологов, гидробиологов, работников рыбного хозяйства, специалистов по использованию и охране водных ресурсов.

Бухарин О.В., Лобакова Е.С., Немцева Н.В., Черкасов С.В. Ассоциативный симбиоз. Ассоциативный симбиоз. Екатеринбург: УрО РАН, 2007. 265 с.

Симбиоз хозяина и микроорганизмов рассмотрен как многокомпонентная система, где кроме хозяина и доминантного микросимбионта участвуют ассоциативные симбионты, выполняющие значительную роль в формировании и обеспечении стабильности и продуктивности симбиоза в целом. Предпринята попытка через призму взаимодействия хозяина и микроорганизмов оценить функциональную нагрузку микросимбионтов в формировании симбиозов на конкретных примерах, включая ассоциативные отношения микроорганизмов с растениями, взаимоотношения симбионтов в гидробиоценозах и представителей микрофлоры с репродуктивным биотопом человека. Описанные иллюстрации позволили по-новому взглянуть на ассоциативный симбиоз и выявить универсальный характер взаимодействий ассоциативных микросимбионтов и хозяина, не предрешая результата этих взаимодействий. Книга адресована микробиологам, экологам, ботаникам и медикам, а также полезна для преподавателей, аспирантов и студентов высших учебных заведений медико-биологического и экологического профилей.

Бухарин О.В., Валышев А.В., Гильмутдинова Ф.Г., Гриценко В.А., Карташова О.Л., Кузьмин М.Д., Усвяцов Б.Я., Черкасов С.В. Экология микроорганизмов человека. Екатеринбург: УрО РАН, 2006. 480 с.

В монографии рассмотрены вопросы микробной экологии человека. Представлена таксономия микробиоценозов индигенной микрофлоры различных биотопов организма, включая кожу и слизистые оболочки, верхние дыхательные пути, пищеварительный тракт, репродуктивную систему. Описаны основные гомеостатические функции нормальной микрофлоры хозяина: ее участие в метаболических процессах, создание и поддержание колонизационной резистентности биотопов, иммуномодулирующее действие и др. Приведены новые материалы о роли микроорганизмов в развитии патологических процессов инфекционной и неинфекционной природы. Рассмотрены популяционно-коммуникативный подход и его перспективы в изучении микробной экологии человека. Особое внимание уделено оценке роли персистентных характеристик микроорганизмов в диагностике микроэкологических нарушений и вопросам этиологической и патогенетической коррекции дисбиотических состояний и ассоциированных с ними инфекционно-воспалительных заболеваний. Книга адресована микробиологам, эпидемиологам, экологам и представителям клинических специальностей, может быть полезна для преподавателей, аспирантов и студентов медико-биологического и экологического профилей.

Бухарин О.В., Гинцбург А.Л., Романова Ю.М. Механизмы выживания бактерий. Москва: Медицина, 2005. 367 с.

В монографии рассмотрены механизмы выживания бактерий, находящихся в различных экологических нишах. Показано состояние покоя как способ адаптации сапрофитных бактерий к изменяющимся условиям внешней среды. Обсуждены вопросы ауторегуляции образования покоящихся форм бактерий, механизмы анабиоза и ультраструктурная организация этих клеток. Описаны феномен некультивируемого состояния бактерий в качестве адаптивной стратегии выживания патогенных микроорганизмов, их свойства и генетический контроль процесса их образования. Внимание уделено механизмам выживания патогенов в условиях инфекционной патологии. Персистенция патогенных бактерий рассматривается как стратегия выживания вида. Систематизированы материалы по изучению механизмов выживания бактериальных патогенов при инфекции и описаны прикладные аспекты микробной персистенции. Обсуждены новые данные по регуляции апоптоза микробными патогенами, как процесса выживания возбудителя при инфекции. Монография адресована микробиологам, эпидемиологам, гигиенистам и экологам, а также преподавателям, аспирантам и студентам медико-биологического и экологического профилей.

Бухарин О.В., Валышев А.В. Анаэробная микрофлора человека. Екатеринбург: УрО РАН, 2004. 264 с.
Анаэробная микрофлора человека

Представлена первая сводка анаэробных микроорганизмов, составляющих нормальную микрофлору различных биотипов человека, а также выделенных из клинических образцов. Обобщены сведения по таксономии и номенклатуре анаэробных бактерий с указанием источников литературы. Даны характеристики родов и списки видов микроорганизмов, сведения о базонимах и синонимах таксонов, типовых штаммах и коллекциях культур, в которых они депонированы. Особое внимание уделено вопросам экологии микроорганизмов, значению последних в возникновении инфекционных и неинфекционных заболеваний. Монография адресована микробиологам, специалистам клинической медицины, а также слушателям факультетов последипломной подготовки и аспирантам медицинских и биологических вузов.

О.В. Бухарин, Б.Я. Усвяцов, О.Л. Карташова. Биология патогенных кокков. Екатеринбург: УрО РАН, 2002. 282 с.

Систематизированы материалы по биологии патогенных кокков, Представлена современная их классификация и схемы идентификации коков-возбудителей болезней человека. Обсуждена роль факторов патогенности этих микроорганизмов экологии и инфекционной патологии. Оценено участие саморегулирующихся систем бактериальной клетки в функционировании микробной популяции. Рассмотрена биология малоизученных кокков-возбудителей оппортунистических инфекций. На основе новых данных о биологии патогенных и условно-патогенных кокков представлены принципиальные подходы в этиологической диагностике, терапии и профилактике кокковых инфекций. Монография адресована микробиологам, эпидемиологам, инфекционистам, а также слушателям факультетов последипломной подготовки и студентам медицинских вузов.

Долгушин И.И., Бухарин О.В. Нейтрофилы и гомеостаз. Екатеринбург: УрО РАН, 2001
Нейтрофилы и гомеостаз

Анализируются биологические свойства нейтрофилов, связанные не только с их способностью к фагоцитозу, но и продукцией биологически активных веществ. Рассмотрены кинетика, продукция нейтрофилов, регуляция нейтрофилопоэза, проявление реактивности этих клеток, их мобилизационные и эффекторные реакции. Описаны процессы, лежащие в основе рецепции, движения, респираторного взрыва, адгезии, фагоцитоза и киллинга. Основное внимание в книге уделено биологии нейтрофилов. Проанализированы биологически активные продукты этих клеток, содержащиеся в гранулах и участвующие при респираторном «взрыве», в процессе метаболизма арахидоновой кислоты. Рассмотрено регуляторное влияние нейтрофилов и их медиаторов на систему мононуклеарных фагоцитов, иммунный, воспалительно–репаративный ответы, эритропоэз, антимикробную и противоопухолевую устойчивость. Сформулирована концепция о важной роли нейтрофилов и их продуктов в регуляции различных звеньев гомеостаза организма. Важное место в монографии уделено практическому использованию методов исследования секреторной (регуляторной) функции нейтрофилов для диагностики дефектов этих клеток. Приведены материалы, демонстрирующие типы нарушения секреторной функции нейтрофилов при травме и инфекции. Книга может быть полезна для иммунологов, микробиологов, патофизиологов, гематологов, а также для преподавателей, аспирантов и студентов медицинских и биологических вузов.

Бухарин О.В. Персистенция патогенных бактерий. Екатеринбург: УрО РАН, 1999. 367 с.

В монографии рассмотрены теоретические основы и прикладные аспекты персистенции бактериальных патогенов. Микробная персистенция, как один из базовых феноменов инфектологии, проанализирована с позиций симбиотических отношений системы «паразит-хозяин». Обсуждена ключевая функция пептидогликана прокариотов в их выживании в организме хозяина. Рассмотрены варианты выживания паразитирующих патогенов, и дана классификация механизмов персистенции бактерий. Описаны методические приемы определения секретируемых персистентных характеристик микроорганизмов. Оценена роль персистентного потенциала бактерий во внутриклеточном паразитировании и феномене бактерионосительства. Как следствие паразит-хозяин отношений представлена модельная система «лизоцим - антилизоцим» в медико-биологических исследованиях. Сформулирован принцип экологической детерминированности факторов персистенции бактериальных патогенов. Особое внимание уделено практическому использованию персистентных характеристик микроорганизмов для создания новых диагностических, прогностических и терапевтических технологий, применяемых в инфекционной клинике. Приведены материал по реализации концепции микроэкологического мониторинга природных экосистем в медико-экологической и санитарно-гигиенической практике. Для микробиологов, эпидемиологам, гигиенистов и клиницистов различных специальностей. Книга может быть полезна для преподавателей, аспирантов, и студентов медико-биологического и экологического профилей.

Бухарин О.В., Литвин В.Ю. Патогенные бактерии в природных экосистемах. Екатеринбург: УрО РАН, 1997. 277 с.

В монографии представлены материалы по экологии патогенных микроорганизмов в окружающей среде, включая человека. Рассмотрены механизмы существования патогенных бактерий в почвенных и водных сообществах. Приведены данные по использованию патогенами растений в качестве возможного резервуара. На основе установления тесной связи между факторами патогенности и персистенции микроорганизмов, выделенных из разных источников среды, раскрыт смысл экологической детерминации персистентных характеристик бактерий и определены ее прикладные аспекты. Рассмотрены место и значение специфической функциональной связки «лизоцим-антилизоцим» в формировании клеточных симбиозов. Обсуждена техногенная очаговость инфекций и обоснованы подходы к использованию микробиологического мониторинга антропогенного загрязнения среды обитания людей. Рассмотрена проблема экологических механизмов энзоотий и эндемий природно-очаговых сапронозов. Монография предназначена для микробиологов, эпидемиологов, инфекционистов и экологов.

Бухарин О.В., Усвяцов Б.Я. Бактерионосительство (медико – экологический аспект). Екатеринбург: УрО РАН, 1996
Бактерионосительство (медико – экологический аспект)

С позиций бактериальной персистенции проанализирована проблема бактерионосительства. Систематизированы материалы по механизмам персистирования бактерий, описана группа новых бактерийных секретируемых факторов, супрессирующих защиту хозяина, рассмотрена роль «экранирующих» структур и бесклеточных форм персистенции. Обсуждены патогенетические особенности бактерионосительства, где персистенция патогена рассмотрена как самостоятельный этап в формировании этого явления. На основе изучения регуляции персистентных свойств патогена под воздействием физических, химических и биологических факторов представлены новые технические решения, повышающие качество диагностических, лечебных и прогностических мероприятий в борьбе с бактерионосительством. Освещены эпидемиологические особенности здорового и реконвалесцентного бактерионосительства. Рассмотрена концепция микробиологической оценки объектов внешней среды по уровню резидентного бактерионосительства в популяции людей, проживающих в условиях техногенного загрязнения среды обитания. Книга предназначена для микробиологов, эпидемиологов, инфекционистов, педиатров и экологов.

Учебные пособия

О.В. Бухарин, Б.Я. Усвяцов, В.И. Желтова, Р.И. Бигеева, И.Н. Чайникова, Е.А. Михайлова, И.Э. Ляшенко, А.В. Валышев. Частная медицинская микробиология: вопросы и ответы. Учебное пособие / Под редакцией член – корр. РАН и РАМН, профессора О.В. Бухарина. – Оренбург: ОГМА, ИКВС, 1999
Изучение частной медицинской микробиологии вооружает будущего врача профессиональными знаниями. Пособие может быть использовано студентами как для обучения, так и для самоконтроля приобретенных знаний. В пособие включен обязательный минимум знаний по предмету с учетом Госстандарта по высшему образованию. Материал включает около 1200 вопросов и ответов. Учебное пособие предназначено для студентов лечебного, педиатрического, медико–профилактического факультетов и факультета высшего сестринского образования.
Бухарин О.В., Усвяцов Б.Я., Карташова О.Л., Чайникова И.Н., Михайлова Е.А., Валышев А.В., Бигеева Р.И., Желтова В.И., Ляшенко И.Э., Черкасов С.В. Руководство к практическим занятиям по медицинской микробиологии, вирусологии и иммунологии. / Под редакцией академика РАМН О.В. Бухарина. М.: Медицина; УрО РАН, 2002
Настоящее руководство включает общую и частную микробиологию, разделенные на 8 разделов, внутри которых представлены учебные темы для выполнения работы на занятиях. Число и виды практических занятий не фиксированы в темах, что позволяет кафедральным коллективам с учетом специфики рабочей программы определять собственную структуру занятий по предлагаемой тематике работ. Внимание уделено и организации внеаудиторной самостоятельной работы студентов. Руководство написано в соответствии с действующей учебной программой и государственными образовательными стандартами для студентов лечебного, педиатрического, медико–профилактического факультетов и факультета высшего сестринского образования.
Бухарин О.В., Усвяцов Б.Я., Чайникова И.Н., Валышев А.В., Киргизова С.Б., Ляшенко И.Э., Михайлова Е.А., Перунова Н.Б., Черкасов С.В., Валышева И.В., Хуснутдинова Л.М., Щуплова Е.А. Руководство по организации и проведению практически занятий по медицинской микробиологии / Под редакцией О.В. Бухарина. Екатеринбург: УрО РАН, 2009
Руководство подготовлено коллективом кафедры микробиологии, вирусологии и иммунологии Оренбургской государственной медицинской академии в соответствии с программой и государственными образовательными стандартами для студентов лечебного, педиатрического и медико-профилактического факультетов. Включает методологию организации и проведению практических занятий по общей и частной медицинской микробиологии. Уделено внимание организации самостоятельной работы студентов в учебное и внеучебное время, методике подготовке лекций. Материал предназначен для аспирантов и преподавателей, ведущих практические занятия по медицинской микробиологии.
Бухарин О.В., Усвяцов Б.Я., Чайникова И.Н., Михайлова Е.А., Валышев А.В., Ляшенко И.Э. Медицинская микробиология (вопросы, ответы, схемы) /Под редакцией академика РАМН О.В. Бухарина. М.: Медицина, 2004
Настоящее учебное пособие включает общую и частную медицинскую микробиологию и состоит из трех частей: вопросы и ответы (части I и II) и схемы лабораторной диагностики основных инфекционных болезней (часть III). Пособие адресовано студентам медицинских вузов и рекомендуется для самостоятельной подготовки к практическим занятиям. Соответствует действующим учебным программам и государственным стандартам.
Бухарина Т.Л., Новодранова В.Ф., Михина Т.В. Латинский язык: учебное пособие /М.: ГЕОТАР-Медиа, 2015
Настоящее учебное пособие подготовлено в соответствии с программой медицинских вузов по латинскому языку и включает три раздела: терминология морфологических дисциплин – анатомии и гистологии; терминология комплекса патологической анатомии и клинических дисциплин; фармацевтическая терминология с номенклатурой лекарственных средств. В конце каждого раздела приведены логико – дидактические схемы основных тем. Подход, основанный на принципе системно–терминологического обучения, обеспечивает последовательность изучения латинского языка и основ терминологии и успешность усвоения материала. Книга адресована студентам медицинских вузов лечебного, педиатрического, медико–профилактического факультетов и факультетов высшего сестринского образования.
Бухарина Т.Л., Коровина И.А., Михина Т.В. Латинская медицинская терминология. Екатеринбург: УрО РАН, 2011
О.В. Бухарин, Н.Б. Перунова, Е.В. Иванова, С.В. Андрющенко. Бифидобактерии: геносистематика, экология и роль в организме человека: учебное пособие. Оренбург: Издательский центр ОГАУ, 2013
Бухарин О.В., Усвяцов Б.Я. Медицинская микробиология (компендиум). Екатеринбург: УрО РАН, 2009
Учебное пособие включает темы общей и частной медицинской микробиологии, которые в соответствии с Государственным образовательным стандартом и Программой по микробиологии, вирусологии и иммунологии составляют основной курс данного предмета в медицинских вузах страны. Материал изложен кратко, в структурно-функциональном аспекте, с охватом основного содержания предмета. Учебное пособие по медицинской микробиологии адресовано студентам медицинских вузов различных факультетов и может быть использовано для самостоятельной подготовки к практическим занятиям и лекциям.
О.В. Бухарин, Н.Б. Перунова, Е.В. Иванова, С.В. Андрющенко. Бифидобактерии: геносистематика, экология и роль в организме человека: учебное пособие. Оренбург: Издательский центр ОГАУ, 2013
В настоящем пособии представлены современные данные по таксономии и номенклатуре рода Bifidobacterium, их экологии. Приведены особенности влияния бифидобактерий на факторы местного иммунитета и механизмы взаимодействий доминантов с ассоциантами микросимбиоценоза кишечника человека. Особое внимание в учебном пособии уделено методическим подходам для изучения биологического профиля бифидобактерий. Описаны современные методы диагностики, лечебной коррекции и профилактики нарушений микрофлоры кишечника человека. Учебное пособие предназначено для самостоятельной работы для студентов высших учебных заведений, обучающихся по специальности «Бактериология».
Бухарин О.В., Немцева Н.В. Микробиология биоценозов природных водоемов. Екатеринбург: УрО РАН, 2008. 156 с.
Представлены материалы по изучению взаимоотношений симбионтов в гидробиоценозах природных водоемах. Описаны особенности симбиотических взаимоотношений в различных структурных компонентах микробиоценозов, включая известные связки: «простейшие–бактерии», простейшие–водоросли», «водоросли-водоросли», «водоросли–бактерии», «бактерии–водоросли». В ряде случаев приведены соответствующие оригинальные авторские иллюстрации. Показано, что в основе ассоциативных симбиотических взаимодействий хозяина с доминантными и ассоциативными микросимбионтами лежат трофические, пространственные и защитные связи, обеспечивающие выживание симбионтов в биотопе. Раскрыто значение персистентного потенциала микросимбионтов при контакте с хозяином на примере различных модельных систем: «лизоцим-антилизоцим», «гистон-антигистон», «каталаза-перекись водорода». Приведены новые данные по регуляции межмикробных отношений симбионтов при помощи осмопротекторов, ауторегуляторов роста, биологически активных веществ и др. Особое внимание в учебном пособии уделено прикладному аспекту феномена ассоциативного симбиоза, где микробные биоценозы рассмотрены в качестве информативной компоненты биоты и могут быть использованы для проведения мониторинга качества водной среды в санитарно-гигиенических и экологических целях и для решения ряда других вопросов лабораторной практики. Книга адресована микробиологам, гидробиологам, эпидемиологам, экологам, а также врачам системы послевузовского профессионального образования медико-профилактического и экологического профилей.
Бухарин О.В., Перунова Н.Б., Иванова Е.В., Андрющенко С.В. Роль бифидофлоры в организме человека. Екатеринбург: РИО УрО РАН, 2013. 128 с.
Учебное пособие предназначено для самостоятельной работы студентов лечебного, педиатрического, стоматологического факультетов по специальности «Микробиология, вирусология». Содержит общую характеристику бифидобактерий, современные данные по таксономии и номенклатуре рода Bifidobacterium, их экологии. Охарактеризованы особенности взаимодействия бифидобактерий с факторами врожденного иммунитета и механизмы межмикробных взаимодействий доминантов с условно-патогенным звеном кишечного микросимбиоценоза. Рассмотрены методические подходы к изучению биологического профиля бифидобактерий. Описаны современные методы диагностики, лечебной коррекции и профилактики нарушений микрофлоры кишечника человека.
А. А. Вялкова, С. А. Чеснокова, С. В. Плотникова, В. А. Гриценко, И. В. Зорин, Л. М. Гордиенко ; под общей редакцией А. А. Вялковой. Тубулоинтерстициальная болезнь и хроническая болезнь почек у детей в работе врача первичного звена здравоохранения. / Оренбург : Изд-во ОрГМУ, 2 0 2 1. – 2 5 6 с. : ил.

Патенты на изобретения, действующие в РФ

«Способ отбора индигенных штаммов бифидобактерий кишечника человека для их включения в состав пробиотических препаратов»

авторы: Бухарин О.В., Иванова Е.В., Перунова Н.Б (п. 2806579, з. 2023109389, 2023)

«Способ лечения бактериального вагиноза»

авторы: Сгибнев А.В., Кремлева Е.А., Черкасова Ю.И., Крайникова Д.А., Роговая Ю.Л. (п. 2805786, з. 2022121049, 2022)

«Средство для продуцирования органических соединений, обладающих антибактериальной и антиоксидантной активностью»

авторы: Строганова Е.А., Гладышева И.В., Черкасов С.В. (п. 2802776, з. 2023101178, 2023)

«Способ выявления стимулирующего действия пектина на рост штаммов кисломолочных бактерий в неблагоприятных условиях»

авторы: Жабина Ю.Ю., Чертков К.Л., Черкасов С.В. (п. 2789088, з. 2022112134, 2022)

«Способ повышения продуктивности цыплят-бройлеров»

Сычева М.В., Карташова О.Л., Кочкина Е.Е. https://www.fips.ru/

«Средство для продуцирования органических соединений, обладающих антибактериальной и антигрибковой активностью»

авторы: Гладышева И.В., Строганова Е.А., Черкасов С.В. (п. 2774192, з. 2021127038, 2022)

«Средство для лечения акне»

авторы: Бухарин О.В., Челпаченко О.Е., Данилова Е.И., Перунова Н.Б., Чайникова И.Н., Шадрина Е.В., Хонина Т.Г., Чупахин О.Н. (п. 2764574, з. 2020134067, 2022)

Свидетельства о регистрации программ для ЭВМ и баз данных

Карташова О.Л., Пашкова Т.М., Морозова Н.В., Сычева М.В., Хлопко Ю.А. «Дифференциация по факторам персистенции штаммов Staphylococcus aureus, выделенных из мочи кошек при мочекаменной болезни или цистите»№ 2020660094 от 27.08.2020.
Карташова О.Л., Пашкова Т.М., Морозова Н.В., Кузьмин М.Д., Мещеряков А.О., Попова Л.П., Хлопко Ю.А. «Дифференциация штаммов Escherichia coli, выделенных у больных мочекаменной болезнью, осложненной хроническим пиелонефритом, по их генетическому профилю»№ 2020613808 от 23.03.2020.
Гриценко В.А., Головин В.Ю., Бирюкова Т.В., Вялкова А.А., Аникеева Н.А.. Свидетельство о государственной регистрации программ для ЭВМ № 2022681325 «Прогнозирование развития врожденной пневмонии – Prognosis – CP ver.1.0»
Карташова О.Л., Пашкова Т.М., Пашинина О.А., Попова Л.П., Хлопко Ю.А.. Свидетельство о государственной регистрации программ для ЭВМ № 2022685268 «Генетическая идентификация урогенитальных штаммов Staphylococcus aureus, как возбудителей хронического бактериального простатита»

Обратная связь

Оставьте свои данные для связи, мы свяжемся с вами



    Отправляя форму вы даете свое согласие на обработку персональных данных и принимаете условия политики конфиденциальности