Лаборатория биомедицинских технологий

Сергей Викторович ЧеркасовЗаведующий лабораторией – доктор медицинских наук, член-корреспондент РАН Сергей Викторович Черкасов, автор 76 научных работ, 3 монографий и 15 патентов РФ на изобретения.

В штат лаборатории входят: кандидат наук – Гладышева И.В.,  аспиранты: Балкин А.С., Катаев В.Я., Черкасова Ю.И., Изволь И.А., Базарова Ю.Ю. и младшие научные сотрудники – Насырова М.А., Миндолина Ю.В., Филончикова Е.С.

 Область научных интересов:

 

Основные направления научной деятельности лаборатории: изучение взаимодействий про- и эукариот на генетическом уровне, генетическая расшифровка микробиоты ротовой полости, межмикробные взаимодействия.

Важнейшие результаты научных исследований:

Проведено исследование микробиоты зубного налёта методом секвенирования 16SрДНК у детей с бронхиальной астмой с кариесом и без кариеса. У детей с кариесом отмечено достоверно более высокое содержание микроорганизмов класса Negativicutes, порядка Selenomonadales, семейства Veillonellaceae, рода Veillonella. Относительное обилие рода Neisseria было достоверно выше у детей без кариеса. Вместе с тем, в ротовой полости детей обеих групп выявлены кариесогенные микроорганизмы Streptococcus, Neisseria, Veillonella, Prevotella, Haemophilus, Kingella, Porphyromonas, которые также являются патогенами респираторного тракта и при взаимодействии с иммунной системой могут играть роль в патогенезе астмы.

Методом высокопроизводительного singlecell секвенирования ампликонов гена 16S рРНК определен состав микробиомав клетках инфузорий родов Paramecium и Stentor. Установлено, что микробиомы, ассоциированные с клетками инфузорий, существенно отличались по таксономическому составу и богатству от сообществ свободноживущих бактерий. Кроме того, микробиомы инфузорий разных родов и географической локализации характеризовались выраженными различиями.  В микробиомах инфузорий родов Paramecium и Stentor выявлены бактерии, являющиеся комменсалами или оппортунистами человека, включая Alcaligenes, Bacillus, Bacteroides, Bergeyella, Capnocytophaga, Corynebacterium, Enterococcus, Haemophilus, Lautropia, Mycobacterium, Neisseria, Porphyromonas, Prevotella, Propionibacterium, Pseudomonas, Rothia, Stenotrophomonas, Streptococcus и Veillonella. Полученные данные подтверждают гипотезу о том, что свободноживущие инфузории вовлекают в ассоциации потенциально патогенных бактерий и играют для них роль природного резервуара.