Лаборатория микробной экологии и дисбиозов

Описание

Направления исследований лаборатории:

 

  • — оценка биологического разнообразия, физиологии и патогенности прокариот, выделенных из живых организмов и объектов окружающей среды;
  • — анализ бактериально-эритроцитарных взаимодействий, определение их биологического и медицинского значения;
  • — выявление микроэкологических особенностей дисбиозов, внебольничных и госпитальных инфекций, разработка подходов к их диагностике, лечению и профилактике;
  • — выделение и характеристика биотехнологически ценных и промышленно значимых штаммов прокариот; создание на их основе способов биоремедиации и здоровьесберегающих технологий.

 

Состав лаборатории: 2 ведущих научных сотрудника, 1 старший научный сотрудник, 2 научных сотрудника.

Вспомогательный состав лаборатории: лаборант Татьяна Ивановна Архипова

 

Исследования лаборатории поддержаны грантами Российского фонда фундаментальных исследований. Исследования лаборатории поддержаны грантами Российского фонда фундаментальных исследований (№ 07-04-97632-р_офи, 2007-2008; № 10-04-96100-р_урал_а, 2010-2012; № 13-04-97048 р_поволжье_а, 2013-2014; № 13-00-14273 Ир, 2013-2014; № 14-00-10359 Ир, 2014-2015; № 18-10-10118 Ир, 2018-2019).

 

Сотрудники лаборатории являются лауреатами программы Фонда содействия отечественной науке «Выдающиеся ученые. Кандидаты и доктора наук РАН» в номинации «Кандидаты наук РАН» (2004-2005), премий Уральского отделения Российской академии наук по медицине им. акад. В.В. Парина (2005), Губернатора Оренбургской области в сфере науки и техники (2005, 2007, 2010, 2012, 2013 гг.), персональных стипендий и премий Оренбургской области для молодых ученых — кандидатов и докторов наук (2012, 2014 гг.).

 

Прикладные разработки коллектива отмечены золотой медалью ВВЦ (2003 г.), дипломом победителя Второй окружной ярмарки бизнес-ангелов и инноваторов в номинации «За высокий научно-технический уровень проекта» (Нижний Новгород, 2004 г.), бронзовой медалью V Московского международного салона инноваций и инвестиций (Москва, 2005 г.).

Команда лаборатории:

Валышев Александр Владимирович

Ведущий научный сотрудник, и.о. зав. лаб. микробной экологии и дисбиозов
подробнее

Фадеев Сергей Борисович

ведущий научный сотрудник, д.м.н.
подробнее

Щуплова Елена Алексеевна

старший научный сотрудник, к.б.н.
подробнее

Чертков Константин Леонидович

научный сотрудник
подробнее

Галаджиева Анна Александровна 

научный сотрудник, к.б.н.
подробнее

Важнейшие результаты

Важнейшие фундаментальные результаты:

 

  • — Систематизированы и опубликованы в ряде монографий данные о биологическом разнообразии, экологии и патогенности микроорганизмов разных биотопов человека, роли бактерий в развитии патологических процессов инфекционной и «неинфекционной» природы.
  • — Получены новые данные о медиаторах микробного антагонизма – бактериоцинах. Выделены штаммы энтерококков кишечной микрофлоры, продуцирующих бактериоциноподобные субстанции, и уточнен механизм их действия на клетки-мишени.
  • — При изучении феномена внутриэритроцитарной микробной инвазии выявлены биологические свойства микроорганизмов, способствующие адгезии к эритроцитам, инвазии и модификации гемоглобина; установлена роль внутриэритроцитарной микробной инвазии в развитии инфекционных процессов, включая септические состояния.

 

Важнейшие прикладные результаты:

 

  • — Разработаны способы определения персистентных свойств микроорганизмов (антилизоцимная, антилатоферриновая и антигемоглобиновая активность (патенты РФ № 2126051, 2156807, 2245923 2236465, 2262705.
  • — Разработаны и внедрены в клиническую практику новые подходы к диагностике, лечению и профилактике заболеваний микробной этиологии (дисбиоз кишечника, кишечные инфекции, воспалительные заболевания желудочно-кишечного тракта, сепсис, пиелонефрит, гнойно-воспалительные заболевания легких и плевры (патенты РФ № 2088938, 2123834, 2228529, 2237248, 2242756, 2684904, 2716713.

 

Основные публикации:

 

  1. Щуплова Е.А., Кузьмин М.Д. Оценка антибиотико-чувствительности микроорганизмов, выделенных от больных острым пиелонефритом в стадии гнойного воспаления, при их внутриэритроцитарной локализации (эксперимент in vitro). Урология. 2021. 6: 25-29. doi: 10.18565/urology.2021.6.25-29.
  2. Gladysheva I.V., Chertkov K.L., Cherkasov S.V., Khlopko Y.A., Kataev V.Y., Valyshev A.V. Probiotic Potential, Safety Properties, and Antifungal Activities of Corynebacterium amycolatum ICIS 9 and Corynebacterium amycolatum ICIS 53 Strains. Probiotics Antimicrob. Proteins. 2021. Nov. 22. doi: 10.1007/s12602-021-09876-3.
  3. Gogoleva O.A., Shchuplova E.A. The influence of non-tuberculous mycobacteria on the interaction of opportunistic microorganisms with erythrocytes. Folia Microbiol. (Praha). 2020. 65(2): 417-421. doi: 10.1007/s12223-019-00748-6.
  4. Vasilchenko A.S., Valyshev A.V. Pore-forming bacteriocins: structural-functional relationships. Arch. Microbiol. 2019. 201(2): 147-154. doi: 10.1007/s00203-018-1610-3.
  5. Vasilchenko A.S., Vasilchenko A.V., Valyshev A.V., Rogozhin E.A. A Novel High-Molecular-Mass Bacteriocin Produced by Enterococcus faecium: Biochemical Features and Mode of Action. Probiotics Antimicrob. Proteins. 2018. 10(3): 427-434. doi: 10.1007/s12602-018-9392-0.
  6. Vasilchenko A.S., Rogozhin E.A., Valyshev A.V. Purification of a Novel Bacteriocin-Like Inhibitory Substance Produced by Enterococcus faecium ICIS 8 and Characterization of Its Mode of Action. Microb. Drug Resist. 2017. 23(4): 447-456. doi: 10.1089/mdr.2016.0069.
  7. Тарасенко В.С., Фадеев С.Б., Бухарин О.В. Хирургическая инфекция мягких тканей: клинико-микробиологический аспект. Екатеринбург: УрО РАН, 2015. 180 с. ISBN 978-5-7691-2419-8.
  8. Бухарин О.В., Валышев А.В. Биология и экология энтерококков. Екатеринбург: УрО РАН, 2012. 227 с. ISBN 978-5-7691-2270-5.
  9. Бухарин О.В., Валышев А.В., Гильмутдинова Ф.Г., Гриценко В.А., Карташова О.Л., Кузьмин М.Д., Усвяцов Б.Я., Черкасов С.В. Экология микроорганизмов человека. Екатеринбург: УрО РАН, 2006. 480 с. ISBN 5-7691-1738-9.
  10. Бухарин О.В., Валышев А.В. Анаэробная микрофлора человека. Екатеринбург: УрО РАН, 2004. 264 с. ISBN 5-7691-1477-0.

 

Оборудование :

 

  • Весы аналитические XP205DR (Mettler Toledo, Швейцария)
  • Низкотемпературный морозильник MDF-U33V (Sanyo Electric Co., Япония)
  • Термостат электрический с охлаждением ТСО-200 СПУ (ОАО «Смоленское СКТБ СПУ», Россия)
  • Спектрофотометр Genesys 6 (Thermo Fisher Scientific, США)
  • Весы BK-300 (Massa K, Россия)
  • pH-метр рН-150М (РУП «Гомельский завод измерительных приборов», Беларусь)
  • Миницентрифуга ХС-80 (Apexlab, Китай)
  • Вортекс XH-D (Apexlab, Китай)
  • Термостат для планшетов ST3 (ELMI ltd, Латвия)
  • Микроскоп Axiostar plus (Carl Zeiss, Германия)

 

Оборудование

Обратная связь

Оставьте свои данные для связи, мы свяжемся с вами



    Отправляя форму вы даете свое согласие на обработку персональных данных и принимаете условия политики конфиденциальности