Катаев Владимир Ярославович

Сведения об образовании и защищенных диссертациях

2011-2015 – бакалавриат по специальности 06.03.01 Биология в Оренбургском государственном университете

2015 – защита выпускной квалификационной работы бакалавра по теме «Динамика количественных характеристик и стрессоустойчивости голодающих культур Salmonella typhimurium в водной среде»

2015-2018 – магистратура по специальности 06.04.01 Биология в Оренбургском государственном университете

2008 – защита магистерской диссертации по теме «Генетические детерминанты стрессоустойчивости Salmonella typhimurium»

2008-2011 – аспирантура по специальности 03.02.03 Микробиология в Институте клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН

Сведения о трудовой деятельности

1 сентября 2018– настоящее время: научный сотрудник лаборатории биомедицинских технологий ИКВС УрО РАН

1 марта 2016 – 31 августа 2018: старший лаборант-исследователь ЦКП ИКВС УрО РАН

Область экспертизы

Персистенция патогенных микроорганизмов в олиготрофных условиях, и её механизмы. Оценка экспрессии генов. Транскриптомика. NGS-секвенирование. Метабаркодинг

Проекты, гранты

Грант РНФ № 21-74-00043 «Разнообразие и филогения центрохелидных солнечников из экстремальных местообитаний», 2021 г., исполнитель

Грант РФФИ № 17-04-02079 «Комплексная оценка разнообразия гетеротрофных протистов в гипергалинных водоемах с экстремальной соленостью», исполнитель

Грант РФФИ № 18-44-560005 «Мониторинг микробных сообществ и агрохимических показателей земель сельскохозяйственного назначения, подверженных деградационным процессам», 2018 г., исполнитель

Грант РФФИ № 14-04-01796 «Молекулярно-генетические механизмы, обеспечивающие выживание и размножение протеобактерий в водных экосистемах», 2015-2016 г.,

Тема НИР № АААА-А19-119011890039-8 «Симбиотические системы эукариот различного эволюционного уровня с прокариотами, и их значение в медицине и экологии» (2019-2021гг)

№ FUUG-2022-0007 Исследование симбиотических систем про- и эукариот в биологии и медицине (2022-2026 гг)

Публикации

2022

Kovaleva, O.V.; Podlesnaya, P.; Sorokin, M.; Mochalnikova, V.; Kataev, V.; Khlopko, Y.A.; Plotnikov, A.O.; Stilidi, I.S.; Kushlinskii, N.E.; Gratchev, A. Macrophage Phenotype in Combination with Tumor Microbiome Composition Predicts RCC Patients’ Survival: A Pilot Study. Biomedicines 2022, 10, 1516. https://doi.org/10.3390/biomedicines10071516

Gladysheva, I.V., Khlopko, Y.A., Cherkasov, S.V. et al. Genome sequence of Corynebacterium amycolatum ICIS 99 isolated from human vagina reveals safety and beneficial properties. Arch Microbiol 204, 226 (2022). https://doi.org/10.1007/s00203-022-02852-7

Gorbunov, M.Y., Khlopko, Y.A., Kataev, V.Y. et al. Bacterial Diversity in Attached Communities of a Cold High-Sulfide Water Body in European Russia. Microbiology 91, 77–90 (2022). https://doi.org/10.1134/S0026261722010040

2021

Gladysheva, I.V., Chertkov, K.L., Cherkasov, S.V. et al. Probiotic Potential, Safety Properties, and Antifungal Activities of Corynebacterium amycolatum ICIS 9 and Corynebacterium amycolatum ICIS 53 Strains. Probiotics & Antimicro. Prot. (2021). https://doi.org/10.1007/s12602-021-09876-3

Sycheva M. V., Popova E. V., Khlopko Y. A. et al. Genome Analysis of the Probiotic Strain Enterococcus faecium Ef79OSAU. Microbiology Resource Announcements, 2021, 10, 42 doi:10.1128/MRA.00691-21

Kovaleva, O.; Podlesnaya, P.; Rashidova, M.; Samoilova, D.; Petrenko, A.; Mochalnikova, V.; Kataev, V.; Khlopko, Y.; Plotnikov, A.; Gratchev, A. Prognostic Significance of the Microbiome and Stromal Cells Phenotype in Esophagus Squamous Cell Carcinoma. Biomedicines 2021, 9, 743. https://doi.org/10.3390/biomedicines9070743

2020

Vladimir Ya Kataev, Ivan I. Sleptsov, Andrey A. Martynov et al. Data on rumen and faeces microbiota profiles of Yakutian and Kalmyk cattle revealed by high-throughput sequencing of 16S rRNA gene amplicons. Data in Brief (2020), 33, 106407, https://doi.org/10.1016/j.dib.2020.106407

Kovaleva, O.; Podlesnaya, P.; Rashidova, M.; Samoilova, D.; Petrenko, A.; Zborovskaya, I.; Mochalnikova, V.; Kataev, V.; Khlopko, Y.; Plotnikov, A.; Gratchev, A. Lung Microbiome Differentially Impacts Survival of Patients with Non-Small Cell Lung Cancer Depending on Tumor Stroma Phenotype. Biomedicines 2020, 8, 349. https://doi.org/10.3390/biomedicines8090349

Elena S. Kashkak, Vladimir Ya Kataev, Yuri A. Khlopko, Valentina G. Budagaeva, Erzhena V. Danilova, Urana S. Oorzhak, Olga P. Dagurova, Andrey O. Plotnikov, Data on draft genome sequence of Stenotrophomonas sp. SAM-B isolated from a mineral cold spring located in Tyva, southern Siberia. Data in Brief (2020), 32, 106278, https://doi.org/10.1016/j.dib.2020.106278

Natalia E. Gogoleva, Vladimir Ya. Kataev, Alexander S. Balkin, Andrey O. Plotnikov, Elena I. Shagimardanova, Anastasia M. Subbot, Sergey V. Cherkasov, Yuri V. Gogolev, Dataset for transcriptome analysis of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium strain 14028S response to starvation. Data in Brief (2020), 31, 106008, https://doi.org/10.1016/j.dib.2020.106008

Участие в конференциях с докладами

2022

FEMS Conference on Microbiology, Belgrade, Serbia, 30 June — 2 July 2022«Starvation response of salmonella enterica at various population density», Постер, Докладчик.

2021

3-й Российский микробиологический конгресс, Псков, 26 сентября – 1 октября 2021 г., «Транскриптомный анализ Salmonella enterica в условиях голодания при различной плотности популяции». Постер, Докладчик.

Микробные симбиозы в природных и экспериментальных экосистемах. Оренбург, 4-8 октября 2021, «Характеристика стратегий ответа Salmonella enterica на стрессовые факторы, ассоциированные с голоданием». Устный доклад, Докладчик.

Научные награды, премии

2021 г. – премия губернатора Оренбургской области для талантливой молодёжи за работу «Характеристика стратегий ответа Salmonella enterica на стрессовые факторы, ассоциированные с голоданием», 2021 г.

Членство в российских и международных научных обществах

МОО «Микробиологическое общество», являющееся коллективным членом Федерации Европейских Микробиологических Обществ (FEMS) с 2018 г. по наст. время.