Главная / 2025

2025

Список публикаций научных сотрудников ИКВС УрО РАН за 2025 год

 

 

 Монографии, изданные в России

 

 Горелов А.В., Гриценко В.А., Ермоленко К.Д., Мигачева Н.Б., Усенко Д.В. Рекомендации для практикующих врачей по применению пробиотиков для лечения и профилактики инфекционных заболеваний у детей / Под общей ред. Ю.В. Лобзина. – Санкт-Петербург: МОО «ЕАОИБ», 2025. – 88 с. Усл. печ. 5,5. Тираж 300 экз. ISBN 978-5-4380-0356-4.

  

Статьи в отечественных научных журналах, входящих в «Белый список»

 

  1. Бухарин, О.В. Симбиотические эффекты системы «микробиота–хозяин» в регуляции гомеостаза человека / О. В. Бухарин, Е. В. Иванова, Н. Б. Перунова, И. Н. Чайникова // Вестник Российской академии наук. – 2025. – Т. 95, № 12. — С. 29-47.
  2. Бухарин, О.В. Микробная регуляция иммунного гомеостаза толстого кишечника человека /О. В. Бухарин, Е. В. Иванова, И. Н. Чайникова – DOI 10.31857/S0869587325020095 // Вестник Российской академии наук. – 2025. – Т. 95, № 2. – С. 85-93.
  3. Пашинина, О.А. Влияние штамма Enterococcus faecium 18 на грибы рода Candida / О.А. Пашинина, Т.М. Пашкова, М.В. Сычева и др. —   https://doi.org/10.36233/0372-9311-569   // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. – 2025. – Т. 102, №1. – С. 72-79
  4. Бухарин О.В., Персистентный профиль штаммов Escherichia coli и Klebsiella pneumoniae с генетическими детерминантами хелаторов железа / Иванова Е.В., Здвижкова И.А., Перунова Н.Б. – DOI https://doi.org/10.31857/S0026365625020042 // Микробиология. — 2025. — Т. 94, №2. — C. 157–164. / Bukharin O. V., Persistence рrofiles of Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae strains with genetic determinants of iron chelators / Ivanova E. V., Zdvizhkova I. A., Perunova N. B. — https://doi.org/10.1134/S0026261724609175  // Microbiology. — 2025. — V. 94. — P. 220–226.
  5. Трубицын В.Э., Мethanoculleus bovis sp. nov., новая метанообразующая водородиспользующая архея из рубца коровы / Речкина В.И., Сузина Н.Е., Плотников А.О., Валышев А.В., Катаев В.Я., Щербакова В.А. — doi: 10.7868/S3034546425060031 // Микробиология. — 2025. — Т. 94, № 6. — C. 527–539. / Trubitsyn V.E., Methanoculleus bovis nov., a New Methanogenic Hydrogen-Utilizing Archaeon from the Cow Rumen Rechkina V.I., Suzina N.E., Plotnikov A.O., Valyshev A.V., Kataev V.Ya., Shcherbakova V.A.. — DOI: 10.1134/S0026261725602076 // Microbiology. – 2025. – V. 94. № 6. – C. 902–912.
  6. Извекова Г.И., Первые данные об антибактериальной активности цестод / Филончикова Е.С., Фролова Т.В., Плотников А.О. —  DOI: 10.7868/S3034522725030141 // Биология внутренних вод. – 2025. – T. 18. – № 3. – C. 527-531. / Izvekova G.I., First Finding of Antibacterial Activity in Cestodes. Inland Water /   Filonchikova E.S., Frolova T.V., Plotnikov A.O.// DOI: 10.1134/S1995082925600450. // Biology. — 2025.- V. 18.- Р. 689–692.
  7. Гимранова И.А. Факторы патогенности Filifactor alocis и Streptococcus gordonii, идентифицированные у пациентов с воспалительными заболеваниями пародонта / И.А. Гимранова, А.Х. Баймиев, Г.М. Акмалова, В.А. Гриценко — // Пародонтология. – 2025. – Т. 30, №2. – С. 161-169.
  8. Лобзин Ю.В. Пробиотики в терапии острых киш / Ю.В. Лобзин, А.В. Горелов, В.А. Гриценко и др. — DOI: 10.22625/2072-6732-2025-17-1-5-14 // Журнал инфектологии. – 2025. – Т. 17,  №1. – С. 5-14.
  9. Горбунов Н.П. Исследование природы цитокиноподобных веществ, выявляемых иммунохимическими методами в супернатантах культур Staphylococcus aureus / Н.П. Горбунов, А.М. Ищенко, А.Г. Афиногенова и др. . DOI: 10.15789/2220-7619-IDS-17972.  // Инфекция и иммунитет. – 2025. – Т.15,№ 6
  10. Gerasimova E.A., Where elves get their ears: diversity, evolution and life cycle of Quendis nov., formerly “Pterocystidae A” (Haptista: Centroplasthelida) – centrohelids with leaf-shaped scales. / Zagumyonnyi D.G., Balkin A.S., Kataev V.Y., Nasyrova M.A., Makarenko E.E., Tran H.Q., Kasseinov R., Tikhonenkov D. DOI: 10.21685/1680-0826-2025-19-3-1V//  Protistology. —  2025. — V. 19 (3), Р. 163–184.
  11. Mindolina Y.V., Species richness and taxonomic composition of protists in the Arctic meromictic Lake Trekhtzvetnoe. /Krasnova E.D., Ivanova D.A., Ignatenko M.E., Radchenko I.G., Voronov D.A., Plotnikov A.O. — DOI: 10.21685/1680-0826-2025-19-3-5    —  2025. — V. 19 (3), —  P. 229–256.
  12. Selivanova, E.A. Prokaryotic assemblages of halophilic protists in laboratory cultures / E. A. Selivanova, Y. A. Khlopko, A. O. Plotnikov. – DOI 10.21685/1680-0826-2025-19-1-4 // Protistology. – 2025. – Vol. 19, № 1. – Р. 34-55.
  13. Ignatenko M., New records of Hymenomonas roseola (Coccolithophyceae, Haptophyta) from Russia».  Chudaev D., Kapustin D., Yatsenko-Stepanova T.  —  DOI: 10.21685/1680-0826-2025-19-2-2// Protistology. —  —  V. 19 (2), —  P. 102–106.
  14. Коткова В.М. Новые находки водорослей, грибов, лишайников и мохообразных. 16.  / В.М.  Коткова, О.М. Афонина, В.И. Андросова, Т.А. Беляева, П.Н. Белый, А.Ю. Бессудова, И.М. Болсун, Е.В. Чемерис, Н.А. Чернова, С.В. Чесноков, И.В. Чернядьева, Е.А. Давыдов, А.Ю. Доронина, Г.Я. Дорошина, Г.Л. Фрейдин, К.К. Горин, О.Г. Гришуткин, М.Е. Игнатенко, Е.А. Игнатова, В.А. Ильюшин, Т.Г. Ивченко, Т.В. Ицык, В.И. Капитонов, О.А. Катаева, В.Д. Казьмин, Т.М, Харпухаева, М.П. Киркина, И.Ю. Кирцидели, Л.А. Конорева, Р.И. Королев, А.С. Котова, А.В. Котовщиков, О.В. Лавриненко, В.Н. Лебедько, Н.С. Ликсакова, А.В. Лукин, А.В. Мелехин, Т.А. Михайлова, О.А. Мочалова, Ч.Б. Монгуш, А.Д. Мырзахан, М.M. Норкулов, А.А. Нотов, М.А. Паламарчук, И.Г. Панькова, Е.Н. Патова, А.Г. Пауков, А.В. Пчёлкин, Д. А. Филиппов, Н. Н. Попова, А. Д. Потёмкин, Т. Н. Пыстина, Е.В. Рахимова, С.С. Савчук, А.Е. Селиванов, Н.А. Семенова, Д.С. Щуряков, С.Н. Шадрина, А.В. Шкурко, А.В. Сонина, И.Н. Стерлягова, В.А. Столбов, Ю.В. Стороженко, А.Г. Цуриков, Е.Г. Тюлькова, О.А. Тынников, В.С. Вишняков, А.В. Власенко, В.А. Власенко, О.Г. Воронова, Л.С. Яковченко, Т.Н. Яценко-Степанова, И.С. Жданов – DOI:  31111/nsnr/2025.59.2.R1 // Новости систематики низших растений. – 2025. – T. 59, №2. – С. R1–R37.
  15. Валышев А.В., Микробиота мочевыводящих путей: новые таксоны. / А.В. Валышев, Кузьмин М.Д. https://dx.doi.org/10.18565/urology.2025.4.75-79 // Урология. —   — (4)- С. 75-79.
  16. Кузьмин М.Д. Характеристика патогенного потенциала штаммов Staphylococcus aureus, выделенных из секрета простаты при хроническом бактериальном простатите / М.Д. Кузьмин, О.Л. Карташова, О.А. Капустина и др. — // https://dx.doi.org/10.18565/urology.2025.5.59-65 // Урология. – 2025. – №5. – С. 59-65.
  17. Бухарин, О.В. Сравнительная характеристика цитокинового профиля, индуцируемого супернатантами производственных и кишечных штаммов бифидо- и лактобактерий в условиях in vitro / О. В. Бухарин, Е. В. Иванова, И. Н. Чайникова, Н. Б. Перунова, Т. А. Бондаренко, А. В. Бекпергенова – DOI 10.15789/1563-0625-CCO-3015 // Медицинская иммунология. – 2025. – Т. 27, № 2. – С. 437-444.
  18. Бухарин О.В., Перспективы создания новых лечебно-профилактических средств на основе симбиотических штаммов бактерий для коррекции нарушений иммунной регуляции, опосредованной кишечной микробиотой при COVID-19 / Перунова Н.Б., Тимохина Т.Х., Костоломова Е.Г., Паромова Я.И., Иванова Е.В., Полянских Е.Д., Марков А.А. -. https://doi.org/10.15789/1563-0625-PON-2962 // Медицинская иммунология. — 2025. — Т. 27. — № 5 -. С. 961–972
  19. Перунова, Н.Б. Пробиотические свойства композиции индигенных штаммов Bifidobacterium bifidum ICIS-310 и Bifidobacterium longum ICIS-505 в условиях in vitro / Н. Б. Перунова, О. В. Бухарин, Е. В. Иванова, А. В. Бекпергенова, Т. А. Бондаренко – DOI 10.30895/2221-996X-2025-565 // БИОпрепараты. Профилактика, диагностика, лечение. – 2025. – Т. 25, № 2. – С. 203-213.
  20. Бекпергенова, А.В. Динамика численности йогуртовых культур и бифидобактерий при их сокультивировании в молоке / А. В. Бекпергенова, Н. Б. Перунова – DOI 10.21603/1019-8946-2025-5-55 // Молочная промышленность. – 2025. – № 5. – С. 26-32.
  21. Пашинина О.А. Сравнительный анализ иммунорезистентности клинических изолятов энтерококков и стафилококков при хроническом бактериальном простатите / О.А. Пашинина, Т.М. Пашкова, О.Л. Карташова и др. — DOI: 10.46235/1028-7221-17260-CIR. // Российский иммунологический журнал. – 2025. – Т. 28,№4. – С.1047-1054.
  22. Попова Л.П. Антицитокиновая активность микроорганизмов, выделенных при хроническом бактериальном простатите / Л.П. Попова, М.Д. Кузьмин, О.Л. Карташова — DOI: 10.46235/1028-7221-17150-AAO // Российский иммунологический журнал. – 2025. – Т. 28, №3. – С.421-424.
  23. Пашинина О.А. Регуляция синтетическим пептидом ZP2 антицитокиновой активности микроорганизмов, выделенных при послеоперационных осложнениях / О.А. Пашинина, Т.М. Пашкова, В.А. Гриценко // Российский иммунологический журнал. 2025. Т. 28. №3. С.667-672.
  24. Гимранова И.А. Роль оральной микробиоты в этиологии, патогенезе пародонтита и в системной патологии / И.А. Гимрано DOI: 10.46235/1028-7221-17151-ROA ва, В.А. Гриценко, И.М. Рабинович и др. —  DOI: 10.37988/1811-153X_2025_1_179  //   Клиническая стоматология. – 2025. – Т. 28, №1. – С. 179-185.
  25. Здвижкова И.А., Структура распределения генетических детерминант хелаторов железа среди кишечных штаммов энтеробактерий, изолированных от жителей Оренбургской и Тюменской областей. Иванова Е.В., Николенко М.В., Сивкова Д.С., Тимохина Т.Х. — DOI: 10.24411/2304–9081-2025-11002 // Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. — 2025. — № 1. С. 1–15. [Электр. ресурс] (URL: http://elmag.uran.ru:9673/magazine/Numbers/2025-1/Articles/ZIA-2025-1.pdf).
  26. Изволь И.А. Оптимизация метода приготовления фиксированных препаратов солнечников (Сentroplasthelida: Haptista) для сканирующей электронной микроскопии / И.А. Изволь – DOI: 10.24411/2304-9081-2025-11001 // Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. — 2025. 1. 9 С. [Электр. ресурс] (URL: http://elmag.uran.ru:9673/magazine/Numbers/2025-1/Articles/IAI-2025-1.pdf).
  27. Щуплова Е.А., Галаджиева А.А. Влияние короткоцепочечных жирных кислот на адгезивную способность Staphylococcus aureus к эритроцитам / Е.А. Щуплова — DOI: 10.24411/2304-9081-2025-14001 // Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. 2025. 13 с. [Электр. ресурс] (URL: http://elmag.uran.ru:9673/ magazine/Numbers/2025-4/Articles/ShEA-2025-4.pdf).
  28. Морозова Н.В. Антибактериальная активность синтетического пептида активного центра ГМ-КСФ – ZP2 в отношении Corynebacterium spp. / Н.В. Морозова — DOI: 10.24411/2304-9081-2025-13001 // Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. –  – №3. – 7с. [Электр. ресурс] (URL: http://elmag.uran.ru:9673/ magazine/Numbers/2025-3/Articles/MNV-2025-3.pdf).
  29. Немцева Н.В. Феномен преадаптации в эволюции патогенности бактерий / Н.В. Немцева, В.А. Гриценко — DOI: 10.24411/2304-9081-2025-12004.  // Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. – 2025. – № 2. – 45c. [Электр. ресурс] (URL: http://elmag.uran.ru:9673/magazine/Numbers/2025-2/Articles/NVN-2025-2.pdf).
  30. Игнатенко М.Е. Новые сведения о флоре водорослей среднего течения реки Урал и Ириклинского водохранилища (Оренбургская область, Россия) / М.Е. Игнатенко, Т.Н. Яценко-Степанова – DOI: 10.24411/2304-9081-2025-13002 // Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. 2025. №3. 13 с. [Электр. ресурс] (URL: http://elmag.uran.ru:9673/magazine/Numbers/2025-3/Articles/IME-2025-3.pdf)

 

 

Статьи в отечественных научных журналах, входящих в перечень ВАК

 

  1. Гимранова И.А. Микробиота ротовой полости пациентов с хроническим генерализованным пародонтитом / И.А. Гимранова, В.А. Гриценко, Г.М. Акмалова и др. // Вестник биотехнологии и физико-химической биологии им. Ю.А. Овчинникова. – – Т.21,№1. –  С. 23-29.
  2. Лобзин Ю.В. Применение пробиотиков при лечении респираторных инфекций у детей (обзор научных публикаций) / Ю.В. Лобзин, А.В. Горелов, В.А. Гриценко и др. — DOI: 10.53529/2500-1175-2025-3-6-16 // Аллергология и иммунология в педиатрии. – 2025. – Т.23,№3. – С. 6-16.
  3. Пашинина О.А. Антицитокиновая активность и продукция цитокиноподобных веществ грамотрицательными бактериями, выделенными от больных с инфекционно-воспалительными послеоперационными осложнениями / О.А. Пашинина, Т.М. Пашкова, О.Л. Карташова и др. — DOI: 10.17816/CI636439 EDN: WXTLEQ 52.  // Цитокины и воспаление. – 2024. – Т.21,№3. – С. 144-150.
  4. Гладышева И.В. Антибактериальная и антибиопленочная активность экстрактов вагинальных изолятов Corynebacterium amycolatum / И.В. Гладышева, С.В. Черкасов – DOI: 10.17021/1992-6499-2025-2-105-114 // Астраханский медицинский журнал. – 2025. – Т. 20, № 2. – С. 105–113.

 

Статьи в прочих отечественных научных журналах

 

  1.  Игнатенко, М.Е. Комплексная характеристика нового штамма Navicula salinicola Hustedt из гипергалинного озера Джарылгач / М. Е. Игнатенко, О. А. Черногорец, О. А. Тынников, О. Б. Чивкунова, А. Е. Соловченко, Е. С. Лобакова, Е. А. Селиванова. – DOI 10.33624/2311-0147-2025-1(37)-94-98 // Вопросы современной альгологии. – 2025. – Т. 1, № 37. – С. 94–98. (URL: http://algology.ru/2144).
  2. Яценко-Степанова Т.Н. Диатомовые водоросли среднего течения реки Урал (Южный Урал, Россия) / Т.Н. Яценко-Степанова, М.Е. Игнатенко – DOI: 10.33624/2311-0147-2025-1(37)-158-160 // Вопросы современной альгологии. – 2025. ¬– № 1 (37). – С. 158–160. (URL: http://algology.ru/2159)

 

Публикации в зарубежных изданиях, входящих в WoS

 

  1. Myachina Y., The Effect of Cell-Free Metabolites of Vaginal Lactobacilli on HeLa Cells Is Independent of Lactic Acid Concentration Sgibnev A. // International Journal of Molecular Sciences.  — 2025. —  26(24). — P. 11929.
  2. Sakhabutdinov I.T., Variability of microbiomes in winter rye, wheat, and triticale affected by snow mold: predicting promising microorganisms for the disease control / Chastukhina I.B., Ryazanov E.A., Ponomarev S.N., Gogoleva O.A., Balkin A.S., Korzun V.N., Ponomareva M.L., Gorshkov V.Y.. — DOI: 10.1186/s40793-025-00665-x //  Environmental Microbiome.-   —  V. 20.-  P. 3.
  3. Vasilchenko A.S., Agropedogenesis alters microbial communities and antibiotic resistomes in tundra soils: A comparison of modern and ancient cryogenic ecosystems in West Siberia. / Poshvina D.V., Stepanov A.A., Balkin A.V., Dilbaryan D.S., Iashnikov A.V., Shmidt E., Domanskaya O. — , et al. Soil Ecology Letters. 2025. V. 7. P. 250358.
  4. Reva O.N. DPANN symbiont of Haloferax volcanii accelerates xylan degradation by the non-host haloarchaeon Halorhabdus sp. / O. N. Reva, V. La Cono, L. Marturano, F. Crisafi, F. Smedile, M. Mudaliyar, D. Ghosal, E. A. Selivanova, M. E. Ignatenko, M. Ferrer, L. Fernandez-Lopez, M. Krupovic, M.M. Yakimov. – DOI: 10.1016/j.isci.2025.111749 // Iscience. – 2025. – Vol. 28. – № 2. – p. 111749.
  5. Poshvina D.V., Unravelling the response of the soil microbiome to macrolactin A: A metagenomic study /Balkin A.S., Dilbaryan D.S., Vasilchenko A.S.. — DOI: 10.1016/j.chemosphere.2025.144645 // Chemosphere —  — V. 387. —  P. 144645.
  6. Tizabi Y. Review on the Role of Microbiota and Microglia in Premotor Symptoms of Parkinson’s Disease / Tizabi Y., Amaral da Silva V.D., Aschner M.. A Getachew B., Mendieta L., Palafox-Sánchez V., Tsytsarev V.,  Manaye K.F. , Tinkov A.A. , //Neurotoxicity Research. 2025. V. 43. P. 45. https://doi.org/10.1007/s12640-025-00768-w
  7. Feizi H. Polyp and tumor microenvironment reprogramming in colorectal cancer: insights from mucosal bacteriome and metabolite crosstalk / Feizi H., Kafil H.S., Plotnikov A., Kataev V., Balkin A., Filonchikova E., Rezaee M.A., Ghotaslou R., Sadrkabir M., Kadkhoda H., Kamounah F.S., Nikitin S. // Annals of clinical microbiology and antimicrobials. 2025. V. 24. P. 9. DOI: 10.1186/s12941-025-00777-9.
  8. Skalny A.V. Serum trace element and mineral levels and fecal microbiota in relation to cartilage damage in rheumatoid arthritis patients / А.V. Skalny, T. V. Korobeinikova, G. Morozova et al. — https://doi.org/10.1016/j.jtemb.2025.127787 // Journal of Trace Elements in Medicine and Biology. – 2025. – Vol. 92. –  127787.
  9. Skalny A.V. The protective effects of selenium against NLRP3 mediated inflammation and pyroptosis: mechanisms and the potential health benefts / A.V. Skalny, M. Aschner, A. Santamaria et al. —  https://doi.org/10.1007/s10534-025-00754-x // BioMetals. –
  10. Deryabin, D. G. Quorum sensing in Chromobacterium subtsugae ATCC 31532 (formerly Chromobacterium violaceum ATCC 31532): transcriptomic and genomic analyses / D. G. Deryabin, K. S. Inchagova, E. R. Nikonorova, I. F. Karimov, G. K. Duskaev. – DOI 10.3390/ microorganisms13051021. – Текст : электронный // Microorganisms. – 2025. – V. 13. – No. 5. – P. 1021. – URL: https://www.mdpi.com/2076-2607/13/5/1021 (дата обращения: 18.12.2025).
  11. Ignatenko M,. New and noteworthy chrysophycean stomatocysts from the Steppe zone of South Urals (Russia) with comments on the morphological variability., Yatsenko-Stepanova T., Kapustin D DOI: 1016/j.protis.2024.126075 //.  —    Protist.  — 2025. —  V. 176. —  Р. e126075.
  12. Ignatenko M., wo new species of the genus Mallomonas (Chrysophyceae) from ephemeral pools in the steppe zone of the Southern Urals, Russia / Gusev E., Yatsenko-Stepanova T. — DOI: 10.11646/phytotaxa.705.1.7 //   Phytotaxa. —  2025. —  V. 705 (1). — P. 86–96.
  13. Sterlyagova I.N., Mallomonas cetosa sp. nov. (Synurales, Chrysophyceae)—a new species from the tropics. / Ignatenko M.E., Lan N.T., Gusev E.S. — DOI:11646/phytotaxa.720.3.8 // Phytotaxa. — 2025. — V. 720 (3). — P. 281–288.
  14. Gusev E.S., Phan Trong Huan, Ignatenko M.E., Efeykin B.D. Mallomonas capitata nov.—a new rare tropical species from section Mallomonas (Synurales, Chrysophyceae). — DOI: 10.11646/phytotaxa.730.1.7  // Phytotaxa.  — 2025. —  V. 730 (1). —  P. 089–095.
  15. Ignatenko M.E., Two new species from the Mallomonas favosa species complex (Synurales, Chrysophyceae) from acidified water bodies in Vietnam Phan Trong Huan,/ Gusev E.S.. — DOI: 10.11646/phytotaxa.730.3.5//    — 2025. — V. 730 (3). —  P. 277–284.
  16. Gusev E.S., Diversity of silica-scaled chrysophytes (Chrysophyceae) from Mindanao Island (Philippines) with the description of Mallomonas pseudopustula sp. Nov/ Ignatenko M.E., Lituanas C.R., Gumapac K.R., Martynenko N.A., Efeykin B.D. — DOI: 10.3897/phytokeys.268.176758// – 2025. — V. 268. — P. 81–102.
  17. Gusev E.S., A revision of the Mallomonas guttata species complex (Synurales, Chrysophyceae) based on morphological and molecular criteria / Ignatenko M.E., Martynenko N.A., Tran H., Lituanas C.R., Podunay Y.A.. — DOI: 10.3897/phytokeys.268.178310 //  — 2025. — V. 268. — P. 103–127.
  18. Balkin A.S., The Phase-Specific Dynamics in Gene Expression of Salmonella Typhimurium During Acanthamoeba castellanii Infection. / Cherkasov S.V., Gogolev Y.V., Plotnikov A.O. —  DOI: 10.1007/s00284-025-04256-4 //  Current Microbiology.-  — V. 82. —  P. 270
  19. Fomina M.V., The Bioactivity of Janus-like CuO–Ag Nanoparticles on Antibiotic-Resistant Clinical Isolates of Klebsiella pneumoniae and their Mechanism of Action \ Gladysheva I.V., Bakina O.V., Cherkasov S.V., Karimov I.F. — DOI: 10.1007/s00284-025-04381-0 // Current Microbiology.- —  V. 82. — P. 433.
  20. Balkin A, . Cappable-seq RNA-sequencing data sets of Escherichia coli K-12 MG1655 treated with novobiocin, tetracycline, and rifampicin./ Plotnikov A, Konnova T, Shagimardanova E, Hamo H, Gogolev Y, Gogoleva — https://doi.org/10.1128/mra.01194-24 // Microbiology Resource Announcments. 2025. V. 14. P. 01194-24.
  21. Balkin A., Cappable-seq RNA-sequencing data sets for comparative studying of Salmonella enterica adaptation to Acanthamoeba castellanii intracellular environment, oxidative stress, and starvation / Plotnikov A., Konnova T., Gogoleva N., Shagimardanova E., Gogolev Y.. — DOI: 10.1128/mra.01129-24 // Microbiology Resource Announcments. 2025.  -V. 14 (7). —  e01129-24.
  22. Balkin A., Transcriptome sequencing data sets of Escherichia coli K-12 MG1655 treated with novobiocin, tetracycline, and rifampicin. / Plotnikov A., Konnova T., Shagimardanova E., Hamo H., Gogolev Y., Gogoleva N.  — DOI: 10.1128/mra.01169-24//  Microbiology Resource Announcments. 2025. — V. 14 (6) — P. e01169-24.
  23. Balkin A., Transcriptomic data sets for Salmonella enterica serovar Typhimurium 14028S that survived ingestion by Acanthamoeba castellanii, hydrogen peroxide treatment, or starvation / Plotnikov A., Konnova T., Shagimardanova E., Gogolev Y., Gogoleva N. — DOI: 10.1128/mra.01093-24 // Microbiology Resource Announcments. — 2025.- V. 14 (10). — P. e01093-24.
  24. Shchuplova E. A, Changes in morphofunctional parameters of erythrocytes and oxygen‑binding capacity of hemoglobin under the influence of microorganisms of various types / Cherkasov S.V., Revin V. V., Pinyaev S. I., Syusin I. V.  — https://doi.org/10.1007/s00249-025-01736-0 // European Biophysics Journal. — 2025. — V. 54 (1-2). —  Р. 73-87

 

Публикации в прочих зарубежных изданиях

 

  1. Valyshev A.V. Antibacterial activity of rhizosphere pseudomonads against economically significant phytopathogens. BIO Web Conf. 2025. 160: 01035. doi: 10.1051/bioconf/202516001035.

 

 

Доклады, тезисы, сообщения и т.д. в сборниках статей, включая сборники материалов конференций

 

  1.  Филончикова, Е.С. Скрининг вагинальных изолятов Corynebacterium spp. на способность к продукции фолатов / Е. С. Филончикова // Материалы III Российского конгресса с международным участием по медицинской микробиологии и инфектологии (РКММИ) / Москва, 27-28 февр. 2025 г. – Лабораторная диагностика. Восточная Европа. Электронное приложение, 2025. – Т. 14, № 1. – С. 357-359. – ISSN 2522-5392.
  2. Рощина, Е.С. Изучение способности микроорганизмов рода Corynebacterium spp., выделенных из репродуктивного тракта здоровых женщин, к продукции фолатов / Е.С. Рощина // Микробные симбиозы в природных и экспериментальных экосистемах. Материалы научных докладов Пятой всероссийской молодежной школы-конференции с международным участием. Оренбург, ИКВС УрО РАН, 2025. – ISBN 978-5-6054826-2-8 https://ikvs.info/wp-content/uploads/2025/10/sbornik-tezisov_6-10.10.2025.pdf. – С. 45-46.
  3. Щуплова, Е.А. Молекулярно-генетический метод выявления бактерий в крови у пациентов с септическим состоянием / Е.А. Щуплова // Материалы III Российского конгресса с международным участием по медицинской микробиологии и инфектологии (РКММИ) / Москва, 27-28 февр. 2025 г. – Лабораторная диагностика. Восточная Европа. Электронное приложение, 2025. – Т. 14, № 1. – С. 268-271. – ISSN 2522-5392.
  4. Балкин А.С., Черкасов С.В., Гоголев Ю.В., Плотников А.О. Транскриптом Salmonella enterica serovar Typhimurium при фагоцитозе свободноживущими амебами Acanthamoeba castellanii // Сборник материалов Х Всероссийской конференции молодых ученых «Стратегия взаимодействия микроорганизмов и растений с окружающей средой» (21-24 октября 2025 г., Саратов). 2025. С. 16. https://disk.360.yandex.ru/i/7sVvLrTgFtdkkw
  5. Миндолина, Ю.В. Сообщества одноклеточных эукариот в основных функциональных зонах прибрежного меромиктического озера Трехцветное (Белое море, губа Ругозерская) / Ю.В. Миндолина, Е.Д. Краснова, Д.А. Воронов, Д.А. Иванова, М.Е. Игнатенко, М.В. Мардашова, И.Г. Радченко, А.О. Плотников // LXXVIII Герценовские чтения. География: развитие науки и образования: Материалы Международной научно-практической конференции 23 – 26 апреля 2025 г. / отв. ред. Д. А. Субетто, А. Н. Паранина. — Санкт-Петербург: Издательство РГПУ им. А. И. Герцена, 2025. — Текст: электронный. ISBN 978-5-8064-3705-2. – С. 172-176.
  6. Миндолина, Ю.В. Таксономическое и функциональное разнообразие сообществ протистов трех меромиктических водоемов побережья Белого моря (Арктический регион, Россия) / Ю.В. Миндолина, А.С. Балкин, В.Я. Катаев, Е.Д. Краснова, Д.А. Воронов, А.О. Плотников // Микробные симбиозы в природных и экспериментальных экосистемах. Материалы научных докладов Пятой всероссийской молодежной школы-конференции с международным участием. Оренбург, ИКВС УрО РАН, 2025. – ISBN 978-5-6054826-2-8 https://ikvs.info/wp-content/uploads/2025/10/sbornik-tezisov_6-10.10.2025.pdf. – С. 38-39.
  7. Краснова, Е.Д. Функциональное зонирование экосистемы прибрежного меромиктического озера Трехцветное / Е.Д. Краснова, Д.А. Воронов, А.А. Жильцова, Д.А. Иванова, Е.А. Лабунская, Ю.В. Миндолина, С.В. Пацаева, А.О. Плотников, Ю.Г. Соколовская // Геология морей и океанов: Материалы XXVI Международной научной конференции (Школы) по морской геологии. Т. III. – М.: ИО РАН, 2025. – ISBN 978-5-6051054-9-7. DOI: https://doi.ocean.ru/10.29006/978-5-6051054-9-7. – С. 244-249.
  8. Насырова, М.А. Функциональная характеристика сообществ протистов карстовой пещеры Шульган-Таш (Башкортостан, Россия) / М. А. Насырова, Н. Е. Гоголева, А. С. Балкин, А. О. Плотников // Микробные симбиозы в природных и экспериментальных экосистемах. Материалы научных докладов Пятой всероссийской молодежной школы-конференции с международным участием. Оренбург, ИКВС УрО РАН, 2025. – ISBN 978-5-6054826-2-8 https://ikvs.info/wp-content/uploads/2025/10/sbornik-tezisov_6-10.10.2025.pdf. – С. 43-44.
  9. Насырова, М.А. Анализ сообществ протистов карстовой пещеры Шульган-Таш (республика Башкортостан, Россия) / М.А. Насырова, Н.Е. Гоголева, А.С. Балкин, А.О. Плотников // V Всероссийская конференция с международным участием «Актуальные проблемы планктонологии» с таксономическим тренингом для молодых ученых / Гидробиологическое общество при Российской академии наук [ и др.].– Калининград: ФГБОУ ВО «КГТУ», 2025. – С. 90 -91.
  10. Гриценко, В.А. Персистенция бактерий и хронические эндогенные инфекции: причина и следствие / В.А. Гриценко // Материалы III Российского конгресса с международным участием по медицинской микробиологии и инфектологии (РКММИ). Симпозиум: «Бактериальная персистенция и хронические инфекции: от феномена к патологии» / Москва, 27-28 февр. 2025 г. – Лабораторная диагностика. Восточная Европа. Электронное приложение, 2025. – Т. 14, № 1. – С. 268-271. – ISSN 2522-5392.
  11. Гриценко, В.А. Послеоперационные инфекции: ведущие факторы риска, биопрофили приоритетных возбудителей, инновационные подходы к диагностике, терапии и профилактике / В.А.Гриценко, О.Л. Карташова // XI Конгресс Евро-Азиатского общества по инфекционным болезням, посвященном 80-й годовщине Победы в Великой Отечественной войне 1941-1945 гг. Симпозиум ПРОБЛЕМА РЕЗИСТЕНТНОСТИ ВОЗБУДИТЕЛЕЙ И РАЦИОНАЛЬНАЯ АНТИМИКРОБНАЯ ХИМИОТЕРАПИЯ. — Санкт-Петербург, 18-20.05.2025 г.
  12. Гриценко, В.А. Ключевые факторы риска развития послеоперационных инфекционных осложнений как проявлений эндогенной инфекции и подходы к их профилактике / В.А. Гриценко // XI Межведомственная научно-практическая конференция «Инфекционные болезни – актуальные проблемы, лечение и профилактика. — Москва 22-23.05.2025г.
  13. Гриценко, В.А. Дискутабельные вопросы этиологии и патогенеза ИСМП эндогенной природы. (приглашенный доклад). XIII Конгресс с международным участием «Контроль и профилактика инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи» (ИСМП-2025). — Москва, 27-28 ноября 2025 г.
  14. Изволь, И.А. Изучение видового разнообразия Centroplasthelida в водоемах биологического заказника «Светлинский» по данным метабаркодинга и сканирующей электронной микроскопии / И.А. Изволь, М.Е. Игнатенко, Т.Н. Яценко-Степанова, Ю.А. Хлопко, А.О. Плотников // V Всероссийская конференция с международным участием «Актуальные проблемы планктонологии» с таксономическим тренингом для молодых ученых / Гидробиологическое общество при Российской академии наук [ и др.]. – Калининград: ФГБОУ ВО «КГТУ», 2025. – С. 56-57
  15. Изволь, И. А. Сообщества гетеротрофных протистов в водоемах Шалкаро-Жетыкольского озерного района (Оренбургская область, Россия) / И.А. Изволь, М.Е. Игнатенко, Т.Н. Яценко-Степанова, Ю.А. Хлопко, А.О. Плотников // Микробные симбиозы в природных и экспериментальных экосистемах. Материалы научных докладов Пятой всероссийской молодежной школы-конференции с международным участием. Оренбург, ИКВС УрО РАН, 2025. – ISBN 978-5-6054826-2-8 https://ikvs.info/wp-content/uploads/2025/10/sbornik-tezisov_6-10.10.2025.pdf. – С. 43-44.
  16. Инчагова, К. С. Перспектива использования экстрактов культуральной жидкости непатогенных штаммов Corynebacterium amycolatum в качестве эффективных ингибиторов системы quorum sensing LuxI/LuxR-типа у бактерий / К. С. Инчагова, И. В. Гладышева. – Текст : непосредственный // Стратегия взаимодействия микроорганизмов и растений с окружающей средой : материалы X Всероссийской конференции молодых ученых / Министерство науки и высшего образования Российской Федерации Российская академия наук Институт биохимии и физиологии растений и микроорганизмов – обособленное структурное подразделение федерального Государственного бюджетного учреждения науки Федерального исследовательского центра «Саратовский научный центр Российской академии наук» (ИБФРМ РАН); под общей редакцией Г. Л. Бурыгина, А. В. Тугаровой, А. С. Астанковой. – Саратов : «Саратовский источник», 2025. – С. 29.
  17. Плотников, А.О. Протисты соленых водоемов, и их микробиомы: от симбиоза к биотехнологиям / А.О. Плотников, Е.А. Селиванова // Сборник тезисов докладов 5-го Российского микробиологического конгресса (Волгоград, 29 сентября – 3 октября 2025 г.) / под ред. Д. А. Бабкова. – Волгоград: Библиотечноиздательский центр ВолгГМУ, 2025. – С. 28-29.
  18. Тынников, О.А. Разнообразие микроводорослей филума Chlorophyta в гипергалинных водоемах Крымского полуострова / О.А. Тынников, Е.А. Селиванова // Тезисы докладов V Всероссийской конференции с международным участием «Актуальные проблемы планктонологии» с таксономическим тренингом для молодых ученых (Светлогорск, 8-12 сентября 2025 г.) – Калининград: ФГБОУ ВО «КГТУ», 2025. – С. 123-124.
  19. Тынников, О.А. Оценка влияния солености на рост культур галофильных микроводорослей / О.А. Тынников, Е.А. Селиванова // Сборник тезисов Пятой всероссийской молодёжной научной школы-конференции с международным участием «Микробные симбиозы в природных и экспериментальных экосистемах» (Оренбург, 6-10 октября 2025 г.) – Оренбург: ООО «Типография «Агентство пресса», 2025. – С. 49-50.
  20. Морозова Н.В. Особенности влияния синтетического пептида активного центра ГМ-КСФ-ZP2 в отношении грамположительных и грамотрицательных микроорганизмов / Н.В. Морозова // Микробные симбиозы в природных и экспериментальных экосистемах : материалы пятой всероссийской молодѐжной научной школы-конференции с международным участием / Оренбургский федеральный исследовательский центр Уральского отделения Российской академии наук (УрО РАН) – обособленное структурное подразделение Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН; под общей редакцией С. В. Черкасова. – Оренбург : ООО «Типография «Агентсво пресса», 2025. – С. 17–18.
  21. Галаджиева, А. А. QS- ингибирующая способность растительных соединений класса кумаринов / А. А. Галаджиева,  К. С. Инчагова. – Текст : непосредственный // Микробные симбиозы в природных и экспериментальных экосистемах : материалы пятой всероссийской молодѐжной научной школы-конференции с международным участием / Оренбургский федеральный исследовательский центр Уральского отделения Российской академии наук (УрО РАН) – обособленное структурное подразделение Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН; под общей редакцией С. В. Черкасова. – Оренбург : ООО «Типография «Агентсво пресса», 2025. – С. 14–15.

 

Статьи в зарубежных сборниках

 

  1. Gerasimova E., Balkin A., Sozonov G., Poluzerov S., Poshvina D., Kataev V., Chagan T., Garipova K., Tikhonenkov D. The unexpected taxonomic diversity of centrohelid heliozoans and their symbionts // 16th International Congress of Protistology. Abstract book. 2025. P. 267. https://www.icop2025.org/assets/file/ICOP%202025_Abstract%20Book_FINAL_0623.pdf
  2. Potekhin A., Balkin A., Khlopko Y., Kataev V., Lebedeva N., Mayén-Estrada R., Flemming F., Sonntag B., Plotnikov A. Diversity and dynamics of microbiomes associated with freshwater ciliates Stentor and Paramecium. // 16th International Congress of Protistology. Abstract book. 2025. P. 270. https://www.icop2025.org/assets/file/ICOP%202025_Abstract%20Book_FINAL_0623.pdf
  3. Balkin A., Kataev V., Gerasimova E., Poshvina D. Concubinage in the dark: Metagenomic insight into the microbiome of centrohelid heliozoan (Haptista, Centroplasthelida) isolated from underground pond in the cave // 16th International Congress of Protistology. Abstract book. 2025. P. 333. https://www.icop2025.org/assets/file/ICOP%202025_Abstract%20Book_FINAL_0623.pdf
  4. Poshvina D., Poluzerov S., Balkin A., Kataev V., Sozonov G., Gerasimova E. Hidden world within: Unraveling the bacterial community in marine strain of centrohelid heliozoan Raphidocystis sp. // 16th International Congress of Protistology. Abstract book. 2025. P. 343. https://www.icop2025.org/assets/file/ICOP%202025_Abstract%20Book_FINAL_0623.pdf
  5. Selivanova, E.A. Diversity, phylogeny and ecology of halophilic microalgae (Bacillariophyta and Chlorophyta) in geographically distant hypersaline habitats / E. A. Selivanova, O. A. Tynnikov, M. M. Yakimov // Conference on Halophilic Microorganisms (Mexico, November 23 to 26, 2025). – 33.

 

Статьи в научно-популярных журналах и периодических изданиях

 

  1. «Наследие Мечникова в борьбе за долголетие» газета «Аргументы и факты в Оренбуржье» https://oren.aif.ru/society/education/nasledie-mechnikova-v-borbe-za-dolgoletie-bakterii-na-strazhe-zdorovya
  2. «Наука начинается с увлечения» «Аргументы и факты в Оренбуржье. Специальный выпуск» № 7 (235) с. 7 https://oren.aif.ru/society/education/nauka-nachinaetsya-s-uvlecheniya-uchyonye-prodvigayut-svoi-dostizheniya-u-molodezhi
  3. Кузьмин М.Д. «Фармакотерапия больных местно-распространенным раком предстательной железы» // «Московский уролог», №1 2025 г., стр. 6
  4. Игнатенко М.Е. «Водоросли — экстремалы» // Наука Урала. 2025 г. № 1-2 (январь), стр. 9
  5. Черкасов С.В. Расшифровать микробиом // Наука Урала. 2025 г. № 17-18, стр. 4-5
  6. Соколова В. Микробы – индикаторы здоровья и экологии // Южный Урал, 2025. № 5 с. 14
  7. Черкасов С.В. Эффекты симбиоза // Поиск. 2025. https://poisknews.ru/releases/effekty-simbioza/

 

 

Патенты на изобретения РФ за 2025 год

 

  1. Инчагова К.С., Галаджиева А.А. Композиция на основе ципрофлоксацина и 7-гидроксикумарина, подавляющая систему чувства кворума LuxI/Lux R -типа у бактерий. Патент на изобретение РФ № 2833847 от 29.01.2025., Бюл. №4.
  2. Крайникова Д.А., Фатеева Н.И., Сгибнев А.В. Антимикробное средство. Патент на изобретение РФ № 2852019 от 02.12.2025., Бюл. №34.