Публикации и патенты

Список публикаций научных сотрудников ИКВС УрО РАН за 2024 год

Монографии, изданные за рубежом

Skalny A.V., Aschner M., Gritsenko V.A., Martins A.C., Tizabi Y., Korobeinikova T.V., Paoliello M.M.B., Tinkov A.A. Four — Modulation of gut microbiota with probiotics as a strategy to counteract endogenous and exogenous neurotoxicity. In: The Microbiome and Neurotoxicity / Ed.: Alexey A. Tinkov, Michael Aschner, Lucio G. Costa. Advances in Neurotoxicology, Academic Press, 2024. Vol. Pp. 133-176. ISBN 9780443215605, ISSN 2468-7480. https://doi.org/10.1016/bs.ant.2024.02.002

Статьи в отечественных научных журналах, входящих в «Белый список»

1. Парфенова Л.В., Галимшина З.Р., Гильфанова Г.У., Алибаева Э.И., Пашкова Т.М., Карташова О.Л., Фаррахов Р.Г., Аубакирова В.Р., Парфенов Е.В. Гибридное антимикробное покрытие на основе конъюгата гиалуроновой кислоты и пептида LL-37 для ПЭО-модифицированных титановых имплантатов. Биоорганическая химия. 2024. Т. 50. №2. С. 101-110. DOI: 10.31857/S0132342324020011
2. Гриценко В.А., Морозова Н.В., Гладышева И.В., Черкасов С.В. Оценка влияния синтетического пептида активного центра гранулоцитарно-макрофгального колониестиму-лирующего фактора – ZP2 на ростовые свойства Corynebacterium spp. Российский иммунологический журнал. 2024. Т.27. №3. С. 441-448. DOI:  46235/1028-7221-16862-AOT
3. Пашинина О.А., Карташова О.Л., Пашкова Т.М., Гриценко В.А. Влияние синтетического аналога активного центра ГМ-КСФ – пептида ZP2 на рост и биопленкообразование грамотрицательных бактерий – возбудителей хирургических инфекций. Российский иммунологический журнал. 2024. Т.27. №3. С. 433-440. DOI:  46235/1028-7221-16827-IOА
4. Игнатенко М.Е., Яценко-Степанова .Т.Н., Миндолина Ю.В., Насырова М.А. 2024. К флоре золотистых водорослей (Chrysophyceae: Chromulinales, Paraphysomonadales) водоемов степной зоны (Оренбургская область) // Ботанический журнал. Т. 109. № 5. C. 484–501. doi: 10.31857/S0006813624050069
5. Игнатенко М. Е., Яценко-Степанова Т. Н., Гусев Е. С. 2024. Ревизия таксономического статуса Mallomonas multiunca var. pocosinensis на основании ультраструктуры кремнеземных покровов клетки, Mallomonas pocosinensis comb. et stat. nov. // Новости систематики низших растений 58(2): A61–A72. https://doi.org/10.31111/nsnr/2024.58.2.A61
6. Гимранова И.А., Гриценко В.А., Акмалова Г.М. Сравнительная характеристика видового состава микробиома ротовой полости у пациентов с гингивитом и пародонтитом. — Клиническая стоматология. – 2024; 27 (4): 76-81. DOI: 10.37988/1811-153X_2024_4_76
7. Вивтаненко Т.В., Попова Л.Ю., Хлопко Ю.А., Демина Р.Р. Состояние микробиома десневой борозды детей с бронхиальной астмой // Доктор.Ру. – 2024. – Т. 23, №3. – С. 42–48. DOI: 10.31550/1727-2378-2024-23-3-42-48
8. Бухарин О.В., Иванова Е.В., Здвижкова И.А. Синергидная активность лизоцима и карнозина с антимикробными препаратами в отношении Кlebsiella pneumoniae // Вестник Российской академии наук. 2024. Т. 94. № 4. С. 358-365. DOI: 10.31857/S0869587324040057
9. Мячина Ю.Л., Сгибнев А.В., Черкасова Ю.И. Влияние метаболитов вагинальных лактобацилл на функционирование нейтрофилов // Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. 2024. Т. 178, № 12. С. 730-735. DOI:10.47056/0365-9615-2024-178-12-730-735
10. Селиванова Е.А., Балкин А.С., Хлопко Ю.А., Катаев В.Я., Плотников А.О. Геном нового штамма Halorubrum distributum ICIS4, выделенного из культуры микроводоросли Dunaliella salina // Микробиология. – 2024. – Т. 93, № 4. – с. 444–450. DOI: 10.31857/S0026365624040075./ Selivanova, E.A., Balkin, A.S., Khlopko, Y.A., Kataev, V.Y., Plotnikov, A.O. The Genome of a New Halorubrum distributum Strain ICIS4 Isolated from the Culture of a Microalga Dunaliella salina // Microbiology. – 2024. – V. 93(4). – P. 482–486. https://doi.org/10.1134/S0026261723604426

Статьи в отечественных научных журналах, входящих в перечень ВАК

1. Пашинина О.А., Карташова О.Л., Пашкова Т.М. Генетические детерминанты патогенности Enterococcus faecalis, выделенных из секрета предстательной железы у мужчин с хроническим бактериальным простатитом. Проблемы медицинской микологии. 2024. Т.26. №2. С. 183.
2. Пашкова Т.М., Пашинина О.А., Карташова О.Л. Фитотерапия как перспективный способ борьбы с заболеваниями мочеполовой системы человека. Проблемы медицинской микологии. 2024. Т.26. №2. С. 184.
3. Карташова О.Л., Пашинина О.А., Пашкова Т.М., Гриценко В.А., Попова Л.П. Факторы патогенности и антибиотикорезистентность штаммов Enterococcus faecalis, выделенных из секрета предстательной железы у мужчин с хроническим бактериальным простатитом. Тихоокеанский медицинский журнал. 2024. № 2 (96). С. 60-64. DOI: 10.34215/1609-1175-2024-2-60-64
4. Савин Е.З., Немцева Н.В., Березина Т.В. Мониторинг роста саженцев черной смородины в условиях биоконтроля фитопатогенов различными биопрепаратами// Проблемы региональной экологии, 2024. — № 2.- С. 17-25. doi:10.24412/1728-323X-2024-2-17-25.

Статьи в прочих отечественных научных журналах

1. Морозова Н.В., Гриценко В.А. Особенности влияния синтетического пептида активного центра ГМ-КСФ  – ZP2 на рост грамположительных и грамотрицательных палочек in vitro. Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. 2024. 1. 10с. [Электр. ресурс] (URL: http://elmag.uran.ru:9673/magazine/Numbers/2024-1/Articles/MNV2024-1.pdf).  DOI: 10.24411/2304-9081-2024-11001

Публикации в зарубежных изданиях, входящих в WoS

1. Skalny A.V., Aschner M., Santamaria A., Fjlippini T., Gritsenko V.A., Tizabi Y., Zhang F., Guo X., Rocha J.B.T., Tinkov A.A. The role of gut microbiota in the neuroprotective effects of selenium in Alzheimer’s disease. Molecular Neurobiology. 2024. 19 p. — https://doi.org/10.1007/s12035-024-04343-w
2. Kochkina E., Andreeva A., Torshkov A., Dymova V., Altynbekov O., Sycheva M. Metabolic response of broiler chickens to different doses Enterococcus faecium ICIS 96 in the diet. Canadian Journal of Veterinary Research. 2024. T.88. N 1. C. 19-23.
3. Faradina A., Tinkov A., Skalny A.V., Chang J.S. Micronutrient (iron, selenium,vitamin D) supplementation and the gut microbiome. Current opinion in clinical nutrition and metabolic care. 2024. N 27(5). P. 421-427. doi: 10.1097/MCO.000000000000001046.
4. Ignatenko M., Gusev E., Yatsenko-Stepanova T. 2024. Mallomonas paraperfossa sp. nov. (Chrysophyceae, Synurales), a new species from the shallow ephemeral ponds in the steppe zone of the Southern Urals, Russia. Phytotaxa 650 (3): 277–284. https://doi.org/10.11646/phytotaxa.650.3.8
5. Gusev E., Ignatenko M., Yatsenko-Stepanova T. 2024. Mallomonas uralensis sp. nov. (Chrysophyceae, Synurales), a new species of the genus Mallomonas from the section Torquatae. Phytotaxa 655 (3): 293–300. https://doi.org/10.11646/phytotaxa.655.3.7
6. Gogoleva N.E., Nasyrova M.A., Balkin A.S., Chervyatsova O.Y., Kuzmina L.Y., Shagimardanova E.I., Gogolev Y.V., Plotnikov A.O. Flourishing in Darkness: Protist Communities of Water Sites in Shulgan-Tash Cave (Southern Urals, Russia) // Diversity. – 2024. – V. 16 (9). – P. 526. https://doi.org/10.3390/d16090526
7. Selivanova E.A., Yakimov M.M., Kataev V.Y., Khlopko Y.A., Balkin A.S., Plotnikov A.O. The Cultivation of Halophilic Microalgae Shapes the Structure of Their Prokaryotic Assemblages // Microorganisms. – 2024. – V. 12(10). – P. 1947. https://doi.org/10.3390/microorganisms12101947
8. La Cono V., La Spada G., Smedile F., Crisafi F., Marturano L., Modica A., Nhu Khanh H.H., Thinh P.D., Thuy Hang C.T., Selivanova E.A., Bản N.K., Yakimov M.M. Unique Features of Extremely Halophilic Microbiota Inhabiting Solar Saltworks Fields of Vietnam // Microorganisms. – 2024. – V. 12(10). – P. 1975. https://doi.org/10.3390/microorganisms12101975
9. Poshvina D.V., Balkin A.S., Teslya A.V., Dilbaryan D.S., Stepanov A.A., Kravchenko S.V., Vasilchenko A.S. Structural and Functional Differences in the Bacterial Community of Chernozem Soil Under Conventional and Organic Farming Conditions // Agriculture. – 2024. – V. 14(12). – P. 2127. https://doi.org/10.3390/agriculture14122127
10. Gerasimova E.A., Balkin A.S., Kataev V.Y., Filonchikova E.S., Mindolina Y.V., Tikhonenkov D.V. Taxonomic and functional diversity of protists in saline and hypersaline lakes in southern Western Siberia, a region strongly affected by climate change. // Water Biology and Security. – 2024. doi.org/10.1016/j.watbs.2024.100316
11. Gladysheva I.V., Stroganova E.A., Chertkov K.L. Cherkasov S.V. Antimicrobial Activity of Corynebacterium amycolatum ICIS 53 and Corynebacterium amycolatum ICIS 82 Against Urogenital Isolates of Multidrug-Resistant Staphylococcus aureus. Current Microbiology. 81, 426 (2024). https://doi.org/10.1007/s00284-024-03936-x

12. Kryuchkova Y.V., Neshko A.A., Gogoleva N.E., Balkin A.S., Safronova V.I., Kargapolova K.Yu., Shagimardanova E.I., Gogolev Yu.V., Burygin G.L. Genomics and taxonomy of the glyphosate-degrading, copper-tolerant rhizospheric bacterium Achromobacter insolitus LCu2 // Antonie van Leeuwenhoek. – 2024. – V. 117. – P. 105. https://doi.org/10.1007/s10482-024-01989-3
13. Sgibnev, A., Kremleva, E. Lactobacilli Have an Opposite Effect on the Resistance to Oxidative Damage of HPV-Infected Compared with Uninfected Vaginal Epithelial Cells // Probiotics & Antimicrobial Proteins. 2024. https://doi.org/10.1007/s12602-024-10317-0
14. Dubashynskaya, N.V., Petrova, V. A., Ustyukhina, I. S., Sgibnev, A. V., Cherkasova, Y. I., Nashchekina, Y. A., Vlasova, E. N., Romanov, D. P. & Skorik, Y. A. Mucoadhesive polyelectrolyte complexes of fucoidan and chitin nanowhiskers to prolong the antiprotozoal activity of metronidazole. Carbohydrate Polymers, 2024. V.349. Part A. https://doi.org/10.1016/j.carbpol.2024.122975.
15. Ryazanov V.A., Duskaev G.K., Sheida E.V., Khlopko Y.A., Plotnikov A.O. Effect of Artemisia absinthium (Asteraceae) and Cobalt Supplementation on Rumen Bacterial Community in Cattle // Indian Journal of Animal Research. – 2024. – V. 58(8). – P. 1266-1274. DOI: 10.18805/IJAR.BF-1694
16. Feizi H., Plotnikov A., Rezaee M.A., Ganbarov Kh., Kamounah F.S., Nikitin S., Kadkhoda H., Gholizadeh P., Pagliano P., Kafil H.S. Postbiotics versus probiotics in early-onset colorectal cancer //Critical Reviews in Food Science and Nutrition. – 2024. – V. 64 (11). – P. 3573-3582. https://doi.org/10.1080/10408398.2022.2132464

17. Potekhin A., Plotnikov A.O., Gogoleva N., Sonntag B. Editorial: Microbial associations formed and hosted by protists, algae, and fungi // Frontiers in Microbiology. – 2024. – V. 14. – P. 1341058. https://doi.org/10.3389/fmicb.2023.1341058
18. Ignatenko M., Ngoc N., Trong Huan  , Gusev E. A new species of the genus Mallomonas from section Marsupiales from Viet Nam. Phytotaxa 675 (3): 283–291 DOI: 10.11646/phytotaxa.675.3.7

Публикации в прочих зарубежных изданиях

1. Zhurlov O., Zhurlova M. Influence of topsoil manure mix on affects germination in Pea and Onion seeds // BIO Web Conf. – 2024. — V. 93. – P. 02008 https://doi.org/10.1051/bioconf/20249302008
2. Zhurlov O., Zhurlova M. The effectiveness of bacterial contamination of beetles during their transfer to wheat bran // BIO Web Conf. – 2024. — V. 130. – P. 07004 https://doi.org/10.1051/bioconf/202413007004
3. Zhurlov O. Using of Tenebrio molitor larvae to study the toxicity of heavy metals // BIO Web Conf. – 2024. — V. 149. – P. 01060 https://doi.org/10.1051/bioconf/202414901060

Статьи в отечественных сборниках

1. Игнатенко М.Е., Яценко-Степанова Т.Н. 2024. Новые и редкие виды в структуре водорослевых сообществ водоемов биологического заказника областного значения «Светлинский» (Оренбургская область, Южный Урал, Россия)// Степи Северной Евразии: материалы X международного симпозиума – Оренбург: ИС УрО РАН, 2024. – С. 503-509. DOI: 10.24412/cl-37200-2024-503-509
2. Игнатенко М.Е., Яценко-Степанова Т.Н. 2024. Coccolithophyceae в альгофлоре водоемов степной зоны Южного Урала // Водоросли: проблемы таксономии и экологии, использование в мониторинге и биотехнологии. Материалы VII Всероссийской научной конференции с международным участием (г. Владивосток, Россия, 16—20 сентября 2024 г.) [Электронный ресурс]. — Владивосток: 2024. – С. 48
3. Изволь И.А., Игнатенко М.Е., Плотников А.О. 2024. Разнообразие солнечников (Сentroplasthelida) в водоемах Шалкар-Жетыкольского озерного района Оренбургской области// Биология внутренних вод. Перспективы и проблемы современной гидробиологии: материалы XVII Всероссийской научной конференции молодых ученых, посвящённой 300-летию Российской академии наук, 170-летию со дня рождения Н.А. Морозова и 130-летию со дня рождения И.Д. Папанина, 21–25 октября 2024 г. / под ред. Д.Г. Загумённого, В.С. Вишнякова – Ярославль: Канцлер, 2024. С. 48. ISBN 978-5-907773-79-0
4. Миндолина Ю.В., Краснова Е.Д., Игнатенко М.Е., Воронов Д.А., Плотников А.О. Видовое богатство и вертикальное распределение протистов в меромиктическом озере Трехцветное (Кандалакшский залив, Белое море) // LXXVII Герценовские чтения. География: развитие науки и образования: Материалы Международной научно-практической конференции 22–26 апреля 2024 года: в 2 т. Т. I / отв. ред. Д.А. Субетто, Ю Л. Войтеховский, А Н. Паранина. – Санкт-Петербург: Изд-во РГПУ им. А. И. Герцена, 2024. – С. 298–301. ISBN 978-5-8064-3535-5
5. Миндолина Ю.В., Балкин А.С., Катаев В.Я., Краснова Е.Д., Воронов Д.А., Плотников А.О. Структура сообществ протистов двух стратифицированных водоемов, отделяющихся от Белого моря, изученная методом ДНК метабаркодинга // Биология внутренних вод. Перспективы и проблемы современной гидробиологии: материалы XVII Всероссийской научной конференции молодых ученых, посвящённой 300-летию Российской академии наук, 170-летию со дня рождения Н.А. Морозова и 130-летию со дня рождения И.Д. Папанина, 21–25 октября 2024 г. / под ред. Д.Г. Загумённого, В.С. Вишнякова – Ярославль: Канцлер, 2024. С. 70. ISBN 978-5-907773-79-0
6. Насырова М.А., Балкин А.С., Гоголева Н.Е, Плотников А.О. Метабаркодинг сообществ протистов подземного озера карстовой пещеры Шульган-Таш (Республика Башкортостан, Россия) // Биология внутренних вод. Перспективы и проблемы современной гидробиологии: материалы XVII Всероссийской научной конференции молодых ученых, посвящённой 300-летию Российской академии наук, 170-летию со дня рождения Н.А. Морозова и 130-летию со дня рождения И.Д. Папанина, 21–25 октября 2024 г. / под ред. Д.Г. Загумённого, В.С. Вишнякова – Ярославль: Канцлер, 2024. С. 77. ISBN 978-5-907773-79-0
7. Селиванова Е.А. Тынников О.А. Морфологические, физиологические и генетические особенности новых штаммов микроводорослей Asteromonas gracilis из гипергалинных водоемов России // Водоросли: проблемы таксономии и экологии, использование в мониторинге и биотехнологии. Материалы VII Всероссийской научной конференции с международным участием (г. Владивосток, Россия, 16—20 сентября 2024 г.) [Электронный ресурс]. — Владивосток: 2024. – С. 107.
8. Селиванова Е.А. Тынников О.А., Насырова М.А., Плотников А.О. Генетическое разнообразие галофильных микроводорослей рода Dunaliella, выделенных из различных географических источников // Водоросли: проблемы таксономии и экологии, использование в мониторинге и биотехнологии. Материалы VII Всероссийской научной конференции с международным участием (г. Владивосток, Россия, 16—20 сентября 2024 г.) [Электронный ресурс]. — Владивосток: 2024. – С. 108.
9. Тынников О.А., Насырова М.А. Сравнительная характеристика штаммов микроводорослей Asteromonas gracilis, выделенных из различных гипергалинных водоемов // Материалы Международного молодежного научного форума «ЛОМОНОСОВ-2024» / Отв. ред. И.А. Алешковский, А.В. Андриянов, Е.А. Антипов, Е.И. Зимакова. [Электронный ресурс] – М.: МОО СИПНН Н.Д. Кондратьева, 2024. ISBN 978-5-901-64042-5. – 2 с.

Статьи в зарубежных сборниках

1. Plotnikov A.O., Selivanova E.A., Kataev V.Y., Khlopko Y.A., Balkin A.S. Microbiomes of Halophilic Algae Under Laboratory Cultivation // 15th International Conference on Salt Lake Research (ICSLR’24). Book of Abstract. – 2024. – P. 29.
2. Mindolina Y., Balkin A., Kataev V., Krasnova E., Voronov D., Plotnikov A. Structure of Protist Communities in Two Stratified Water Bodies Separated from the White Sea Revealed with Metabarcoding // 15th International Conference on Salt Lake Research (ICSLR’24). Book of Abstract. – 2024. – P. 78.
3. Selivanova E., Yakimov M., Tynnikov O., Khlopko Y., Plotnikov A. Genetic diversity and phylogeny of new halophilic microalga strains from remote saline sites // Rapp. Comm. int. Mer Médit. (43rd CIESM Congress Proceedings). – 2024. – V. 43. – P. 177.
4. Potekhin A., Balkin A., Lebedeva N., Flemming F., Castelli M., Plotnikov A. Dynamic microbiomes and ephemeral bacterial symbionts of Paramecium // Comparative genomics of unicellular eukaryotes: Interactions and symbioses. Abstract book. – 2024. – P. 127.

Статьи в научно-популярных журналах и периодических изданиях

1. Шеметова Л. Назад к природе. Как родная микробиота организма меняет подходы к лечению // Аргументы и факты в Оренбуржье. 2024. № 6 от 7 февраля.
2. Соколова В. Оренбургские ученые обнаружили ранее неизвестные науке микроорганизмы // Южный Урал. 2024. №5 от 7 февраля.
3. Кузьмин М.Д. Фитотерапия – новый подход к лечению хронического первичного пиелонефрита // Вестник российского общества урологов. 2024 № 3, с. 13
4. Кузьмин М.Д. Фитопрепараты при хроническом простатите // Вестник российского общества урологов. 2024 № 2, с. 11
5. Чернова Е. Наука начинается с увлечения. Аргументы и факты в Оренбуржье. Специальный выпуск. 2024. № 7 (235), с. 7.
6. Шеметова Л. Назад к природе. Как родная микробиота организма меняет подходы к лечению. «Аргументы и факты». «Технологический суверенитет, информационный проект о научных и технологических разработках для следующих поколений», в разделе Медицина. Ссылка: https://nauka.aif.ru/

Статьи в отечественных научных журналах, входящих в перечень ВАК

1. Пашинина О.А., Карташова О.Л., Пашкова Т.М., Гриценко В.А. sIgA-протеазная активность микроорганизмов, выделенных из секрета предстательной железы. // Российский иммунологический журнал. 2023. Т. 26. № 4. С. 471-476. doi: 10.46235/1028-7221-13776-SPA.
2. Пашинина О.А., Карташова О.Л., Пашкова Т.М., Гриценко В.А.  Влияние синтетического аналога активного центра ГМ-КСФ – пептида ZP2 на антилизоцимную активность грибов рода Candida. // Российский иммунологический журнал. 2023. Т. 26. № 3. С. 373-376. doi: 10.46235/1028-7221-9645-EOS.
3. Пашкова Т.М., Пашинина О.А., Кузьмин М.Д., Карташова О.Л. Влияние препарата Фитофрон® на персистентные свойства условно-патогенных микроорганизмов, выделенных из мочи пациентов с инфекциями мочевыделительной системы. // Урология. 2023. № 4. С. 53-57.  DOI:  10.18565/urology.2023.4.53-57.
4. Пашинина О.А., Карташова О.Л., Пашкова Т.М., Кузьмин  М.Д. Влияние препарата ПростаНорм® на персистентный потенциал микроорганизмов, выделенных при хроническом бактериальном простатите. // Урология. 2023. № 4. С. 69-74. DOI: 10.18565/urology.2023.4.69-74.
5. Карташова О.Л., Пашкова Т.М., Пашинина О.А., Коваленко А.Л. Влияние циклоферона in vitro  на рост и образование биопленок клиническими изолятами микроорганизмов.  // Экспериментальная и клиническая фармакология. 2023. Т. 86. № 4. С. 29-33. DOI: 10.30906/0869-2092-2023-86-4-29-33.
6. Пашинина О.А., Сычева М.В., Марисова Е.В. Эффект влияния бактериоцинсодержащей культуральной жидкости  Enterococcus faecium EF 79OSAU  на способность  к биопленкообразованию Candida albicans // Проблемы медицинской микологии. 2023. Т. 25. № 2. С. 158.
7. Карташова О.Л., Пашинина О.Л., Сычева М.В., Кочкина Е.Е., Пашкова Т.М., Дымова В.В. Характеристика патогенного потенциала E. coli, выделенных от кошек с заболеваниями мочевыделительной системы. //Вестник КрасГАУ. 2023. № 3. С. 140-146. DOI: 10.36718/1819-4036-2023-3-140-146.
8. Карташова О.Л., Пашинина О.А., Пашкова Т.М., Гриценко В.А., Михайленко С.В. Биопрофили стафилококков разных видов, выделенных из секрета предстательной железы у мужчин с хроническим бактериальным простатитом. // Тихоокеанский медицинский журнал. 2023. № 1. С. 70-74. doi: 10.34215/1609-1175-2023-1-70-74.
9. Пашинина О.А., Пашкова Т.М., Карташова О.Л., Морозова Н.В. Антицитокиновая активность грибов рода Candida и их способность к продукции цитокиноподобных веществ. // Российский иммунологический журнал. 2023. Т. 26. № 1. С. 57-62.  doi: 10.46235/1028-7221-1150-AAO.
10. Черкасов С.В., Плотников А.О., Селиванова Е.А., Щуплова Е.А. Итоги X Российской научной конференции с международным участием «Персистенция и симбиоз микроорганизмов» // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2023. Т. 100. №6. С. 511-512.
11. Игнатенко М.Е., Яценко-Степанова Т.Н. Стоматоцисты золотистых водорослей (Сhrysophyta) водоемов национального парка “Бузулукский бор” (юго-восток Европейской части России) // Ботанический журнал. 2023. Т. 108(7). С. 617-627. https://doi.org/10.31857/S0006813623070025
12. Коткова В. М., Чернядьева И. В., Давыдов Е. А., Дорошина Г. Я., Ефимов Д. Ю., Ефимова Л. А., Фролов И. В., Габигер Я. И., Глущенко М. Ю., Горбунова И. А., Гимельбрант Д. Е., Игнатенко М. Е., Калинина Л. Б., Курбатова Л. Е., Кушневская Е. В., Лащинский Н. Н., Лотиев К. Ю., Мороз Е. Л., Нотов А. А., Новожилов Ю. К., Отмахов Ю. С., Пликина Н. В., Попова Н. Н., Потемкин А. Д., Путилина В. А., Рыжкова П. Ю., Самбыла Ч. Н., Смирнова Е. В., Степанчикова И. С., Стороженко Ю. В., Троева Е. И., Цуриков А. Г., Вишняков В. С., Власенко А. В., Власенко В. А., Волкова Е. А., Волоснова Л. Ф., Яковченко Л. С., Яценко-Степанова Т. Н., Жуйков К. А., Зуева А. С. Новые находки водорослей, грибов, лишайников и мохообразных // Новости систематики низших растений. 2023. Т. 57(1). С. 155–204. https://doi.org/10.31111/nsnr/2023.57.1.155
13. Иванова Е.В., Чайникова И.Н., Бекпергенова А.В., Бондаренко Т.А., Челпаченко О.Е., Здвижкова И.А., Перунова Н.Б., Бухарин О.В. Эффект совместного влияния метотрексата и метаболитов бифидобактерий на продукцию TNFα и IFN-γ мононуклеарами периферической крови человека // Российский иммунологический журнал. 2023. Т. 26 (3). С. 279-284. https://doi.org/10.46235/1028-7221-9839-CEO
14. Матчин А.А., Сетко Н.П., Дорошина Н.Б., Нефедова Е.С., Чайникова И.Н. Особенности распространенности кариеса и микробиоценоза ротовой полости у лиц, проживающих на территориях с различным уровнем антропогенной нагрузки // Оренбургский медицинский вестник. 2023. Т. ХI. № 2(42). С.  61–66.
15. Бухарин О.В., Андрющенко С.В., Иванова Е.В., Перунова Н.Б., Чайникова И.Н., Челпаченко О.Е., Здвижкова И.А., Бекпергенова А.В., Бондаренко Т.А. Практические рекомендации по экспресс-выявлению ДНК бифидобактерий, кутибактерий и бактероидов в фекалия //Лабораторная служба. 2023. Т. 12 (1). С. 21-26. https://doi.org/10.17116/labs20231201121
16. Данилова Е.И., ФисенкоА.П., Стадников А.А., Перунова Н.Б., Иванова Е.В., Чайникова И.Н., Челпаченко О.Е. Модель клебсиеллёзно — кандидозного артрита  на крысах линии Wistar //   Морфология. 2022. Т. 160 (1). С. 5-10.  https://doi.org/10.17816/morph.110871
17. Челпаченко О.Е., ФисенкоА.П., Данилова Е.И., Стадников А.А., Иванова Е.В., Перунова Н.Б. Экспериментальное обоснование эффективности препарата для местного лечения воспалительных заболеваний суставов на модели клебсиеллёзно-кандидозного артрита // Медицинский вестник Северного Кавказа. 2022. Т. 17(4). С. 402-407. https://doi.org/10.14300/mnnc.2022.17096
18. Бухарин О.В., Иванова Е.В., Перунова Н.Б., Здвижкова И.А. Анализ антибиотикорезистентности клинических изолятов Esсherichia coli с генетическими детерминантами clbBN и iucBC  //  Клиническая лабораторная диагностика. 2023. Т. 67 (9). С. 525-529. https://doi.org/10.51620/0869-2084-2023-68-8-489-45)
19. Иванова Е.В., Данилова Е.И., , Чайникова И.Н., Челпаченко О.Е., Фадеев С.Б., Бондаренко Т.А., Бекпергенова А.В. Микробиологическое обоснование целесообразности применения эфирных масел лекарственных растений в лечении воспалительных заболеваний верхних дыхательных путей // Медицинский Совет. 2023. №12. С.55-61. https://doi.org/10.21518/ms2023-184
20. Хавкин А.И., Бухарин О.В., Перунова Н.Б., Иванова Е.В., Ситкин С.И. Биологические свойства и симбиотические взаимоотношения бифидобактерий человека // Вопросы практической педиатрии. 2023. Т. 18(2). С. 54–64.  https://doi.org/10.20953/1817-7646-2023-2-54-64
21. Бухарин О.В, Иванова Е.В., Чайникова И.Н., Перунова Н.Б., Никифоров И.А., Челпаченко О.Е., Бондаренко Т.А., Бекпергенова А.В. Влияние кишечных микросимбионтов на продукцию цитокинов в системе in vitro //Медицинская иммунология. 2023. Т. 25(6). С. 1359-1376. https://doi.org/10.15789/1563-0625-IVE-2622
22. Bukharin O.V., Perunova N.B., Nikolaev Yu.A., Ivanova E.V., Oleskin A.V., and El’-Registan G.I. Secondary Metabolites of Bifido- and Lactobacteria Fulfilling Signal Functions. Microbiology. 2023. V. 92(6). P. 875–880. https://doi.org/10.1134/S0026261723601549
23. Lavrentyeva E., Banzaraktsaeva T., Dambaev V., Buyantueva L., Valova E., Ivanov V., Plotnikov A. Taxonomic diversity and functional potential of microbial communities in salt lakes Gudzhirganskoe and Nukhe-Nur (Barguzin depression, Baikal rift zone) // Biological Communications. 2023. Т. 68. № 2. С. 86-96. https://doi.org/10.21638/spbu03.2023.203
24. Бухарин О.В, Иванова Е.В. Особенности персистенции индигенных штаммов бифидобактерий кишечника человека // Вестник РАН. 2023. Т. 93. № 6. C. 548-555. (https://doi.org/10.31857/S0869587323060051 )
25. O.V. Bukharin, E.V. Ivanova. Persistence Features of Indigenous Strains of the Human Intestine Bifidobacteria. Herald of the Russian Academy of Sciences. 2023. V. 93(6). P. 548–555. https://doi.org/10.1134/S1019331623030073
26. Борисов С.Д., Каримов И.Ф., Плотников А.О., Инчагова К.С., Паньков А.С., Даньшин Д.П. Клинический случай посттравматического остеомиелита, вызванного ассоциацией Kytococcus schroeteri и Enterococcus faecalis // Инфекция и иммунитет. 2023. Т. 13. №5. C. 985-994. https://doi.org/10.15789/2220-7619-ACC-15623
27. Инчагова К.С., Русакова Е.А. Исследование регуляторных эффектов малых молекул растительного происхождения в отношении бактериальных биосенсоров с различными системами «quorum sensing» LuxI/LuxR-типа // Вопросы биологической, медицинской и фармацевтической химии. 2023. Т. 11. С. 40-46. https://doi.org/10.29296/25877313-2023-11-07
28. Рыжманова Я.В., Трубицын В.Э., Ривкина Е.М., Сузина Н.Е., Плотников А.О., Катаев В.Я., Молчанов М.В., Молочков Н.В., Щербакова B.А. Новые психроактивные бактерии криопэгов полуострова Ямал // Криосфера Земли. 2023. T. XXVII. № 6. C. 51–58.
29. Карташова О.Л., Пашинина О.А, Пашкова Т.М., Пономарёва И.С. Антицитокиновая активность микроорганизмов, выделенных при заболеваниях мочевыделительной системы кошек // Известия Оренбургского государственного аграрного университета. 2023. № 6 (104). С. 268–271. https:// doi.org/10.37670/2073-0853-2023-104-6-268-271.
30. Бухарин О.В, Иванова Е.В., Перунова Н.Б. Коренные штаммы бифидобактерий кишечника человека: индигенность через призму персистенции. // Вестник РАН. 2023. Т. 93(11): 1071-1080. (https://doi.org/10.31857/S0869587323110026)

Публикации в зарубежных изданиях, включенных в систему цитирования Web of Science, иных системах цитирования

1. Golin A., Tinkov A.A., Ascher M., Farina M., Da Rocha J.B.T. Relashionship between selenium status, selenoproteins and COVID-19 and other inflammatory diseases: A critical review. Journal of Trace  Elements in Medicine and Biology. 2023. V. 75. P. 127099. DOI: 10.1016/j.jtemb.2022.127099.
2. Aschner M., Skalny A.V., Gritsenko V.A., Kartashova O.L., Santamaria A., Rocha J. B.T., Spandidos D.A., Zaitseva I. P., Tsatsakis A.  Tinkov A. A. Role of gut microbiota in the modulation of the health effects of advanced glycation end‑products (Review). International Journal of Molecular Medicine. 2023. V. 51:44. DOI: 10.3892/ijmm.2023.5247
3. Ke T., Rajoo A., Tinkov A.A., Skalny A.V., Tizabi Y.,  Rocha J.B.T.,  Bowman A.B., Aschner M. Intestinal microbiota protects against methylmercury-induced neurotoxicity. // Biometals. 2023. V. 16 November: 00554-1.  https://doi.org/10.1007/s10534-023-00554-1
4. Mindolina Yu.V., Selivanova E.A., Ignatenko M.E., Krasnova E.D., Voronov D.A., Plotnikov A.O. Taxonomic Composition of Protist Communities in the Coastal Stratified Lake Kislo-Sladkoe (Kandalaksha Bay, White Sea) Revealed by Microscopy // Diversity. 2023. V.15: 44. https://doi.org/10.3390/d15010044
5. Gerasimova, E.A., Mindolina, Y.V., Tikhonenkov, D.V., Kataev, V.Y., Balkin, A.S., Mikhailov, K.V. et al. Unexpected ubiquity of heart-shaped scale morphotype in Centroplasthelida (Haptista): Ancestral trait or multiple acquisitions. // Journal of Eukaryotic Microbiology. 2023. V. 00: e12992. https://doi.org/10.1111/jeu.12992
6. Gerasimova E.A., Balkin A.S., Filonchikova E.S., Mindolina Y.V., Zagumyonnyi D.G., Tikhonenkov D.V. Taxonomic Structure of Planktonic Protist Communities in Saline and Hypersaline Continental Waters Revealed by Metabarcoding. // Water. 2023. V.15: 2008. https://doi.org/10.3390/w15112008
7. Gladysheva I.V., Cherkasov S.V. Antibiofilm activity of cell-free supernatants of vaginal isolates of Corynebacterium amycolatum against Pseudomonas aeruginosa and Klebsiella pneumoniae // Archives of Microbiology. 2023. V. 205. P. 158. https://doi.org/10.1007/s00203-023-03498-9.
8. Malygina A., Balkin A., Polyakova E., Stefanov S., Potekhin A., Gogoleva N. Taxonomic Diversity of the Microbial Biofilms Collected along the Thermal Streams on Kunashir Island // Ecologies. 2023. V. 4. P. 106-123. https://doi.org/10.3390/ecologies4010009
9. Gogoleva, N., Chervyatsova, O., Balkin, A. et al. Microbial tapestry of the Shulgan-Tash cave (Southern Ural, Russia): influences of environmental factors on the taxonomic composition of the cave biofilms // Environmental Microbiome. 2023. V.18:82. https://doi.org/10.1186/s40793-023-00538-1
10. Kapustin D., Ignatenko M., Yatsenko-Stepanova T. On stomatocysts of Paraphysomonas caelifrica (Stramenopiles, Paraphysomonadida) // Journal of Eukaryotic Microbiology. 2023. V. 70(5): e12979. https://doi.org/10.1111/jeu.12979
11. Ignatenko M., Yatsenko-Stepanova T. Coccolithophores in the algal flora from South Urals (Russia) with the description of a new Hymenomonas species // Phytotaxa. 2023. V. 609(1). P. 055–064. https://doi.org/10.11646/phytotaxa.609.1.5
12. Ignatenko M., Gusev E., Yatsenko-Stepanova T. Diversity of Silica-Scaled Chrysophytes in the Steppe Zone of the Southern Urals with a Description of a New Species from the Genus Mallomonas // Life. 2023. V.13: 2214. https://doi.org/10.3390/life13112214
13. Dubashynskaya NV, Petrova VA, Sgibnev AV, Elokhovskiy VY, Cherkasova YI, Skorik YA. Carrageenan/Chitin Nanowhiskers Cryogels for Vaginal Delivery of Metronidazole. Polymers. 2023. V. 15(10): 2362. https://doi.org/10.3390/polym15102362
14. La Cono, V., Messina, E., Reva, O., Smedile, F., La Spada, G., Crisafi, F. et al. (2023) Nanohaloarchaea as beneficiaries of xylan degradation by haloarchaea. // Microbial Biotechnology. 2023. V.16. P. 1803–822.  https://doi.org/10.1111/1751-7915.14272
15. Reva O., Messina E., La Cono V., Crisafi F., Smedile F., La Spada G., Marturano L., Selivanova E.A., Rohde M., Krupovic M., Yakimov M.M. (2023) Functional diversity of nanohaloarchaea within xylan-degrading consortia. // Frontiers in Microbiology. 2023. V.14:1182464. DOI: 10.3389/fmicb.2023.1182464
16. Valyshev A.V. Virulence Factors of Plant Growth-Promoting Bacteria: Analysis of Pseudomonas protegens Genomes // E3S Web of Conferences. 2023. V.411: 02037. https://doi.org/10.1051/e3sconf/202341102037
17. Titova V., Zhurlov O. Interaction of bacteria with graphene oxide particles reduces their ability to biofilm formation on PVC Microplates. E3S Web of Conferences. 2023. V.389: 07007.
    https://doi.org/10.1051/e3sconf/202338907007
18. Zhurlov O. Succession of the Microbial Communities in the Surface Soil Layer Under the Manure Cake of Large Phytophages.
    Lecture Notes in Networks and Systems. 2023. V. 575 LNNS. P. 2409-2415. https://doi.org/10.1007/978-3-031-21219-2_270
19. Zhurlov O. Characteristics of bacterial communities in the rhizosphere of plants collected on marginal lands. E3S Web of Conferences. 2023. V. 420:09008. https://doi.org/10.1051/e3sconf/202342009008

Статьи в прочих отечественных научных журналах

1. Рищук С.В., Загарских Е.Ю., Гриценко В.А., Федорец В.Н. Овариальная дисфункция у женщин с воспалительными заболеваниями репродуктивной системы. Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. 2023. 1: 32 c. [Электр. ресурс] (URL: http:// elmag.uran.ru:9673/magazine/Numbers/2023-1/Articles/SVR-2023-1.pdf) DOI: 10.24411/2304-9081-2023-11005
2. Курлаев П.П., Гриценко В.А., Белозерцева Ю.П. Прогнозирование инфекционных осложнений у больных с синдромом диабетической стопы. Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. 2023. 2. 10 с. [Электр. ресурс] (URL: http://elmag.uran.ru:9673/magazine/ Numbers/2023-2/Articles/KPP-2023-2.pdf). DOI: 10.24411/2304-9081-2023-12013
3. Пашкова Т.М., Карташова О.Л. Влияние фитопрепаратов на факторы персистенции микроорганизмов, выделенных при заболеваниях мочеполовой системы человека. Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. 2023. 3. [Электр. ресурс] (URL: http://elmag.uran.ru:9673/magazine/Numbers/2023-3/Articles/TMP-2023-3.pdf). DOI: 10.24411/2304-9081-2023-13011
4. Пашинина О.А., Карташова О.Л., Пашкова Т.М., Гриценко В.А. Антицитокиновая активность микроорганизмов и их способность продуцировать цитокиноподобные вещества. Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. 2023. 3. [Электр. ресурс] (URL: http://elmag.uran.ru:9673/magazine/Numbers/2023-3/Articles/PAO-2023-3.pdf). DOI: 10.24411/2304-9081-2023-13010
5. Щуплова Е.А. Изменения конформации фосфолипидов мембраны эритроцитов под действием микроорганизмов. Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. 2023. 1: 8 c. [Электр. ресурс] (URL: http://elmag.uran.ru:9673/magazine/Numbers/2023-1/Articles/SEA-2023-1.pdf) DOI: 10.24411/2304-9081-2023-11006
6. Немцева Н.В. Микробные сообщества и проблема качества природных и питьевых вод// Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. 2023. №3.  [Электр.ресурс] (URL:http://elmag.uran.ru:9673/magazine/Numbers/2023-3/Articles/NVN-2023-3.pdf) DOI:10.24411/2304-9081-2023-13005
7. Игнатенко М.Е., Яценко-Степанова Т.Н. Стоматоцисты Сhrysococcus furcatus в водоемах Оренбургской области (Южный Урал, Россия). Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. 2023. 2. 6с. [Электр. ресурс] (URL: http://elmag.uran.ru:9673/magazine/ Numbers/2023-2/Articles/IME-2023-2.pdf). DOI: 10.24411/2304-9081-2023-12003
8. Перунова Н.Б., Иванова Е.В., Бекпергенова А.В., Бондаренко Т.А., Здвижкова И.А., Тимохина Т.Х., Марков А.А. Видовой состав и антибиотикорезистентность энтеробактерий, изолированных из различных биотопов организма человека. Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. 2023. 1: 1-10. [Электр. ресурс] (https://doi.org/10.24411/2304-9081-2023-11007)
9. Селиванова Е.А., Тынников О.А. Характеристика бактерий-ассоциантов из лабораторных культур галофильных микроводорослей. Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. 2023. 4. 10 с. [Электр. ресурс] (URL: http://elmag.uran.ru:9673/magazine/ Numbers/2023-4/Articles/SEA-2023-4.pdf). DOI: 10.24411/2304-9081-2023-14001
10. Игнатенко М.Е., Яценко-Степанова Т.Н. Диатомовые водоросли озера Журманколь (государственный природный заповедник «Оренбургский») // Вопросы современной альгологии. Бюллетень. Спец. вып., 2023, С. 39-41.
11. Селиванова Е.А., Тынников О.А. Характеристика нового штамма галотолерантной микроводоросли Asteromonas gracilis ICIS8, выделенного из гипергалинной реки Малая Саморода. Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. 2023. 3: 9 с. [Электр. ресурс] (URL: http://elmag.uran.ru:9673/magazine/Numbers/2023-3/Articles/EAS-2023-3.pdf). DOI: 10.24411/2304-9081-2023-13009
12. Игнатенко М.Е., Яценко-Степанова Т.Н. Новые находки Gyromitus disomatus Skuja в водоемах Оренбургской области (Южный Урал, Россия). Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. 2022. 4. 8 с. [Электр. ресурс] (URL: http://elmag.uran.ru:9673/ magazine/Numbers/2023-4/Articles/IME-2023-4.pdf). DOI: 10.24411/2304-9081-2023-14006
13. Насырова М.А. Анализ морфологии и ультраструктуры раковин амеб семейства Cyphoderiidae с помощью сканирующей электронной микроскопии. Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. 2023. 4. 7 с. [Электр. ресурс] (URL: http://elmag.uran.ru:9673/magazine/Numbers/2023-4/Articles/MAN-2023-4.pdf). DOI: 10.24411/2304-9081-2023-14004

Публикации в прочих зарубежных журналах

1. Koptyug A.V., Sukhovei Yu.G., Gritsenko V.A. Possible Existence of the Relict Mechanism of Cell Protection During Division // Biomedical Journal of Scientific & Technical Research. 2023. V. 51(3). P. 42768-42772.  DOI: 10.26717/BJSTR.2023.51.008112
2. Shchuplova E.A., Gogoleva O.A. The effect of cell-free nontuberculous Mycobacterium supernatants on antibiotic resistance and biofilm formation of opportunistic pathogens // Bacteria. 2023. V.2. P. 174–184. https://doi.org/10.3390/bacteria2040013
3. Zhurlov O.S. Methods of microbial decontamination of insect surface. European Science Review. 2023. V. 5-6:3-7. https://doi.org/10.29013/ESR-23-5.6-3-7

Статьи в отечественных сборниках

1. Кочкина Е.Е., Морозова Н.В. Антибиотикорезистентность штаммов Escherichia coli, выделенных при заболеваниях мочевыделительной системы у кошек // Сборник материалов III международной научно-практической конференции студентов, аспирантов и молодых ученых  «Молодежная наука – развитию агропромышленному комплексу» (Курск 15 ноября, 2022 г., ч. I). 2023. С. 381-386.  ISBN 978-5-7369-0883-7.
2. Миндолина Ю.В., Краснова Е.Д., Воронов Д.А., Плотников А.О. Таксономический состав сообществ протистов в стратифицированной прибрежной лагуне на Зеленом мысе (Кандалакшский залив, Белое море) // В сборнике: LXXVI Герценовские чтения. География: развитие науки и образования. Материалы Международной научно-практической конференции. 19-21 апреля 2023 г., Санкт-Петербург, Россия. В 2-х томах. Отв. редакторы Д. А. Субетто, А. Н. Паранина. Санкт-Петербург, 2023. С. 264-268.
3. Селиванова Е.А., Хлопко Ю.А., Краснова Е.Д., Воронов Д.А., Плотников А.О., Миндолина Ю.В. Вертикальная структура сообществ прокариот меромиктического озера Кисло-Сладкое (Кандалакшский залив, Белое море) // В сборнике: LXXVI Герценовские чтения. География: развитие науки и образования. Материалы Международной научно-практической конференции. 19-21 апреля 2023 г., Санкт-Петербург, Россия. В 2-х томах. Отв. редакторы Д. А. Субетто, А. Н. Паранина. Санкт-Петербург, 2023. С. 289-293.
4. Миндолина Ю.В., Краснова Е.Д., Воронов Д.А., Плотников А.О. Структура сообществ протистов стратифицированных водоемов побережья Белого моря // В книге: Экология и геохимическая деятельность микроорганизмов экстремальных местообитаний. Материалы III Всероссийской конференции с международным участием, посвященной 80-летию д.б.н., проф. Б.Б. Намсараева, 100-летию Республики Бурятия, 300-летию Российской академии наук. 3-7 июля 2023 г., Улан-Удэ – Байкальск, Россия. Новосибирск, 2023. С. 76-77.
5. Насырова М.А., Балкин А.С., Гоголева Н.Е., Плотников А.О. Разнообразие сообществ протистов в водоемах карстовой пещеры Шульган-Таш (Республика Башкортостан, Россия) // В книге: Экология и геохимическая деятельность микроорганизмов экстремальных местообитаний. Материалы III Всероссийской конференции с международным участием, посвященной 80-летию д.б.н., проф. Б.Б. Намсараева, 100-летию Республики Бурятия, 300-летию Российской академии наук. Новосибирск, 2023. С. 80-81.
6. Балкин А.С., Малыгина А.В., Полякова Е.Ю., Стефанов С.Ю., Потехин А.А., Гоголева Н.Е. Таксономическая структура и состав сообществ микробных биопленок термальных источников острова Кунашир // В книге: Экология и геохимическая деятельность микроорганизмов экстремальных местообитаний. Материалы III Всероссийской конференции с международным участием, посвященной 80-летию д.б.н., проф. Б.Б. Намсараева, 100-летию Республики Бурятия, 300-летию Российской академии наук. Новосибирск, 2023. С. 14-15.
7. Плотников А.О., Селиванова Е.А., Хлопко Ю.А., Катаев В.Я., Балкин А.С. Разнообразие эукариотических микроорганизмов в соленых водоемах Крыма по данным ДНК-метабаркодинга // В книге: Экология и геохимическая деятельность микроорганизмов экстремальных местообитаний. Материалы III Всероссийской конференции с международным участием, посвященной 80-летию д.б.н., проф. Б.Б. Намсараева, 100-летию Республики Бурятия, 300-летию Российской академии наук. 3-7 июля 2023 г., Улан-Удэ – Байкальск, Россия. Новосибирск, 2023. С. 86-87.
8. Катаев В.Я., Плотников А.О., Балкин А.С., Гоголев Ю.В., Черкасов С.В., Гоголева Н.Е. Молекулярные и клеточные механизмы ответа сальмонелл на олиготрофные условия // В книге: Экология и геохимическая деятельность микроорганизмов экстремальных местообитаний. Материалы III Всероссийской конференции с международным участием, посвященной 80-летию д.б.н., проф. Б.Б. Намсараева, 100-летию Республики Бурятия, 300-летию Российской академии наук. 3-7 июля 2023 г., Улан-Удэ – Байкальск, Россия. Новосибирск, 2023. С. 57-58.
9. Селиванова Е.А., Катаев В.Я., Хлопко Ю.А., Плотников А.О. Изменения сообществ прокариот, ассоциированных с галофильными протистами, при переходе к лабораторному культивированию // В книге: Экология и геохимическая деятельность микроорганизмов экстремальных местообитаний. Материалы III Всероссийской конференции с международным участием, посвященной 80-летию д.б.н., проф. Б.Б. Намсараева, 100-летию Республики Бурятия, 300-летию Российской академии наук. 3-7 июля 2023 г., Улан-Удэ – Байкальск, Россия. Новосибирск, 2023. С. 96-97.
10. Селиванова Е.А., Тынников О.А., Насырова М.А., Плотников А.О. Сравнительная характеристика новых штаммов галофильных микроводорослей рода Asteromonas // В книге: Экология и геохимическая деятельность микроорганизмов экстремальных местообитаний. Материалы III Всероссийской конференции с международным участием, посвященной 80-летию д.б.н., проф. Б.Б. Намсараева, 100-летию Республики Бурятия, 300-летию Российской академии наук. 3-7 июля 2023 г., Улан-Удэ – Байкальск, Россия. Новосибирск, 2023. С. 97-98.
11. Селиванова Е.А., Катаев В.Я., Хлопко Ю.А., Плотников А.О. Сравнительная характеристика сообществ прокариот в ассоциациях с галофильными микроводорослями при переходе к лабораторному культивированию // Тезисы 4-го Российского Микробиологического Конгресса (г. Томск, 24-29 сентября 2023 г.). С.34.
12. Игнатенко М.Е., Яценко-Степанова Т.Н. Альгофлора водоемов особо охраняемых природных территорий Оренбургской области. Актуальные проблемы особо охраняемых природных территорий-5: Труды Всероссийской научной конференции / Под ред. Г.С. Розенберга, Е.В. Быкова, А.Г. Бакиева, С.С. Саксонова. Тольятти: ИБЦ ИЭВБ РАН, 2023, 103-105. https://doi.org/10.24412/cl-34866-2023-29

Статьи в зарубежных сборниках

Gogoleva N., Balkin A., Nasyrova M., Malygina A., Polyakova E., Gogolev Yu., Shagimardanova E., Potekhin A., Plotnikov A. Diversity of protist communities in the extreme environments revealed by metabarcoding // IX European Congress of Protistology & Annual Congress of the International Society of Protistologists «The Century of Protists». Abstract booklet. 2023. P. 290. https://ecopisop2023.univie.ac.at/fileadmin/user_upload/k_ecop_isop2023/Abstract_Bookl_FINAL.pdf

Статьи в научно-популярных журналах и периодических изданиях

1. Понизовкина Е. Здоровье мужское и женское: плодотворные подходы // Наука Урала. Январь 2023. № 1–2 (1263). С. 4-5.
2. Соколова В. Сберечь здоровье в социальной сети // Южный Урал. 25 января 2023. №3 (25453). С. 19.
3. Оренбургские ученые изучают возможности и свойства микроорганизмов // Репортаж на телеканале Оренбургского регионального телевидения. 7 февраля 2023. https://youtu.be/eg95t2l8lcA?si=QX2YvE3KN3gPIfBy
4. Шилинцева О. Единственные в целом мире. Сегодня отмечается День российской науки // Аргументы и факты в Оренбуржье. 8 февраля 2023. №6 (225). С. 11.
5. Сидельников А. Симбиоз из микромира // Южный Урал. 8 февраля 2023. № 5 (25455). С. 6.
6. Алексеева В. Пробиотик попадает точно в цель// Южный Урал. 8 февраля 2023. № 5 (25455). С. 13.
7. Сальников Н. Полезные – вредные сожители: микробиологи из Оренбурга обнаружили уникальные бактерии, способные защитить от коронавируса и стафилококка // Публикация на сайте издания «Комсомольская правда. Оренбург.» 28 апреля 2023 г. (https://www.orenburg.kp.ru/daily/27495/4755379/)
8. Бактерии, несущие здоровье, принесли награды. Достижения наших земляков // Публикация на сайте издания «Аргументы и факты в Оренбуржье». 3 апреля 2023. (https://oren.aif.ru/society/bakterii_nesushchie_zdorove_prinesli_nagrady_dostizheniya_nashih_zemlyakov)
9. Соколова В. Микробы против рака и постковида // Южный Урал. 4 октября 2023. № 39 (25489). С. 11.
10. Мурзина А. Разрабатывая лекарства будущего. В Оренбурге прошла научная конференция // Аргументы и факты в Оренбуржье. 4 октября 2023. Специальный выпуск, № 5 (224). С. 2.
11. Кузьмин М.Д. Хронический абактериальный простатит. Новый подход к пониманию патогенеза и лечения // Московский уролог. 2023. №1. С. 6.
12. Гладышева И.В. Со знаком «плюс» // Наука Урала. Сентябрь 2023. № 18. С. 3
13. Оренбургские ученые и химики создали образец мази, способную восстанавливать поврежденные ткани // Репортаж на телеканале Россия 1 (Оренбург). 26 октября 2023. https://vestirama.ru/vesti-orenburzhya/syuzhetyi/20231026-15.17.50.html
14. Телепередача «Телевышка» с участием Плотникова А.О. на телеканале Россия 1 (Оренбург) (https://vestirama.ru/televizionnyie-peredachi/rossiya-24/televyshka/188629-televyshka-ot-29-noyabrya-2.html)
15. Понизовкина Е. В центре внимания — микробиом // Наука Урала. Октябрь 2023. № 20. С. 5.

Статьи в отечественных научных журналах, входящих в перечень ВАК

1. Пашинина О.А., Карташова О.Л., Пашкова Т.М., Гриценко В.А. Влияние синтетического аналога активного центра ГМ-КСФ – пептида ZP2 на антицитокиновую активность бактерий рода Enterococcus spp. и их способность к продукции цитокиноподобных веществ. Российский иммунологический журнал. 2022. Т. 25. № 4. С. 477-484.
   DOI: 46235/1028-7221-1162-IOZ
2. Фомина Л.О., Гриценко В.А., Файзуллина А.И. Сравнительный анализ определения цитокинов в супернатантах нейтрофилов, стимулированных супернатантами S. aureus, имеющими и не имеющими ген SPA. Вестник Уральской медицинской академической науки. 2022. Т. 19. № 3. С. 273-281. DOI: 22138/2500-0918-2022-19-3-273-281
3. Бондаренко Т.А., Иванова Е.В., Бекпергенова А.В., Чайникова И.Н., Челпаченко О.Е., Никифоров И.А., Здвижкова И.А. Связь цитокинов и численности микросимбионтов при микроэкологических нарушениях кишечника человека. Российский иммунологический журнал. 2022. т. 25. № 2. с. 125-130. DOI: 46235/1028-7221-1112-RBC
4. Костоломова Е.Г., Тимохина Т.Х., Перунова Н.Б., Полянских Е.Д., Сахаров Р.А., Комарова А.В. Оценка иммуномодулирующей активности Bifidobacterium bifidum 791 на модели клеток врожденного и адаптивного иммунитета в эксперименте in vitro. Российский иммунологический журнал. 2022. т. 25. № 2. С. 213-218. DOI: 46235/1028-7221-1133-IVE
5. Фомина Л.О., Гриценко В.А., Файзуллина А.И. Сравнительная характеристика содержания цитокинов в супернатантах нейтрофилов после инкубации их с суточными культурами S. aureus, имеющих и не имеющих ген SPA. Российский иммунологический журнал. 2022. т. 25. № 3. С. 339-344.DOI: 46235/1028-7221-1140-CCO
6. Сычева М.В., Пашкова Т.М., Пашинина О.А., Сорокин В.И., Морозова Н.В., Карташова О.Л. Таксономическая структура и биопрофиль микроорганизмов, выделенных из мочи кошек с заболеваниями мочевыделительной системы. Известия Оренбургского государственного аграрного университета. 2022, Т.6, №98, С.219-223. DOI: 10.37670/2073-0853-2022-98-6-219-223
7. Никифоров И.А., Иванова Е.В. Метод картирования равнодействующих при решении задач медицинской микробиологии. Врач и информационные технологии. 2022, № 3, С. 14-23. doi: 10.25881/18110193_2022_3_1
8. Пашинина О.А., Карташова О.Л., Пашкова Т.М., Гриценко В.А., Зурочка А.В. Влияние синтетического аналога активного центра ГМ-КСФ – пептида ZP2 на антицитокиновую активность грибов рода Candida и их способность к продукции цитокиноподобных веществ. Вестник уральской медицинской академической науки. 2022, Т. 19, №3, С.263-272. DOI: 10.22138/2500-0918-2022-19-3-263-272.
9. Пашинина О.А., Кочкина Е.Е., Сычева М.В., Пашкова Т.М., Морозова Н.В., Карташова О.Л. Антибиотикорезистентность штаммов стафилококков, выделенных при заболеваниях мочевыделительной системы у кошек. Вестник Омского ГАУ. 2022, Т. 4, №48, С. 156-163. DOI: 10.48136/2222-0364_2022_4_156.
10. Сизова Е.А., Яушева Е.В., Хлопко Ю.А., Лебедев С.В., Маршинская О.В., Казакова Т.В. Оценка влияния биоаккумуляции микроэлементов в шерсти и молоке коров на кишечный микробиом // Российская сельскохозяйственная наука, 2022, №4, с. 66-72 DOI: 10.31857/S2500262722040123 / Sizova, E.A., Yausheva, E.V., Khlopko, Y.A. et al. Assessing the Effect of Bioaccumulation of Trace Elements in the Hair and Milk of Cows on the Intestinal Microbiome. Russian Agricultural Sciences. 2022, № 48, Р. 413–421. DOI: 3103/S1068367422050093
11. Бухарин О.В., Андрющенко С.В., Перунова Н.Б., Иванова Е.В. Экологическая детерминация индигенных бифидобактерий кишечника человека. Вестник Российской академии наук. 2022. Т.92. № 9. С. 869-876. DOI: 31857/S0869587322090055/ Bukharin O. V., Andryushchenko S. V., Perunova N. B., Ivanova E. V. Environmental Determination of Indigenous Bifidobacteria of the Human Intestine. Herald of the Russian Academy of Sciences, 2022, V. 92, N. 5, pp. 629–635 DOI: 10.1134/S1019331622050033

 Статьи в отечественных научных журналах, включенные в систему цитирования Webof Science/ Scopus

1. Бухарин О.В., Андрющенко С.В., Перунова Н.Б., Иванова Е.В. Экологическая детерминация индигенных бифидобактерий кишечника человека. Вестник Российской академии наук. 2022. Т.92. № 9. С. 869-876. DOI: 10.31857/S0869587322090055/ Bukharin O. V., Andryushchenko S. V., Perunova N. B., Ivanova E. V. Environmental Determination of Indigenous Bifidobacteria of the Human Intestine.  Herald of the Russian Academy of Sciences, 2022, V. 92, N. 5, pp. 629–635 DOI: 10.1134/S1019331622050033
2. Игнатенко М.Е., Яценко-Степанова Т.Н. Разнообразие стоматоцист хризофитовых водорослей (CHRYSOPHYCEAE) степной зоны Южного Урала. Ботанический журнал. 2022. Т.107. № 2. С. 149-158. DOI: 10.31857/S0006813622020053 / Ignatenko M.E., Yatsenko-Stepanova T.N. Diversity of Chrysophycean stomatocysts in the Steppe Zone of the South Urals // Doklady Biological Sciences. 2022, V.506, P. 184–190.  DOI: 10.1134/S0012496622050040
3. Бухарин О.В., Кузьмин М.Д., Перунова Н.Б., Никифоров И.А., Чайникова И.Н., Иванова Е.В. Диагностический цитокиновый маркер бесплодия мужчин — интерлейкин 4. Клиническая лабораторная диагностика. 2022. Т.67. № 3. С.151-157. DOI: 10.51620/0869-2084-2022-67-3-151-157
4. Челпаченко О.Е., Данилова Е.И., Перунова Н.Б., Иванова Е.В., Никифоров И.А., Чайникова И.Н., Бекпергенова А.В., Бондаренко Т.А. Количественный метод определения антибиотикорезистентных копроштаммов для ранней диагностики хронического артрита. Клиническая лабораторная диагностика. 2022. Т. 67. № 9. С. 525-529. DOI: 10.51620/0869-2084-2022-67-9-525-529
5. Черкасова Ю.И., Кремлева Е.А., Щетинина Ю.С., Сгибнев А.В. Влияние местного применения раствора, содержащего ионы железа двухвалентного, на эффективность терапии рецидивирующего урогенитального трихомониаза у женщин. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2022. Т. 24, № 1. С. 77-82. DOI: 10.36488/cmac.2022.1.77-82
6. Горбунов М.Ю., Хлопко Ю.А., Катаев В.Я., Уманская М.В. Разнообразие бактерий прикрепленных сообществ холодного высокосульфидного водоема европейской части России. Микробиология. 2022. Т 91. № 1. С. 86-101. DOI: 10.31857/S0026365622010049/ Gorbunov, M.Y., Khlopko, Y.A., Kataev, V.Y. et al. Bacterial Diversity in Attached Communities of a Cold High-Sulfide Water Body in European Russia. Microbiology. 2022, V. 91, 77–90.  DOI: 10.1134/S0026261722010040
7. Коткова В.М., Афонина О.М., Андросова В.И., Арсланов С.Н., Беляков Е.А., Чернова А.М., Чернядьева И.В., Давыдов Е.А., Дорошина Г.Я., Ерохина О.В., Гарин Э.В., Горбунова И.А., Гришуткин О.Г., Гузиев Х.Ю., Игнатенко М.Е., Игнатов М.С., Ивченко Т.Г., Капитонов В.И., Харпухаева Т.М., Комарова А.С. Кузьмина Е.Ю., Ликсакова Н.С., Макарова М.А., Мелехин А.В., Филиппов Д.А., Потемкин А.Д., Романов Р. Е., Рыжкова П.Ю., Ширяева О.С., Сонина А.В., Стороженко Ю.В., Тарасова В. Н., Тимдал Е., Вишняков В.С., Яковченко Л.С., Яценко-Степанова Т.Н. Новые находки водорослей, грибов, лишайников и мохообразных. Новости систематики низших растений. 2022. Т. 56, №2, С. 479-517. DOI: 10.31111/nsnr/2022.56.2.477
8. Челпаченко О.Е., Данилова Е.И., Чайникова И.Н., Суменко В.В., Иванова Е.В. Lactobacillus rhamnosus GG для предупреждения рецидивов реактивного артрита у детей. Медицинский совет. 2022, Т. 16, № 1, С. 196-204. DOI: 10.21518/2079-701X-2022-16-1-196-204
9. Челпаченко О.Е., Данилова Е.И., Чайникова И.Н., Бекпергенова А.В., Бондаренко Т.А., Суменко В.В. Клинико-микробиологическое обоснование использования растительного препарата у детей с ринофарингитом. Медицинский совет. 2022, Т. 16, № 1, С. 65-75. DOI: 10.21518/2079-701X-2022-16-1-65-75
10. Карташова О.Л., Пашинина О.А., Морозова Н.В., Пашкова Т.М., Кузьмин М.Д. Антибиотикорезистентность штаммов грамположительных кокков, выделенных из секрета предстательной железы у мужчин с хроническим бакте-риальным простатитом. Урология, 2022, № 6, С. 16-20. DOI: 10.18565/urology.2022.6.16-20.
11. Кремлева Е.А., Джуламанова А.Б., Щетинина Ю.С., Сгибнев А.В. Влияние комбинации пробиотика и прогестерона на эффективность топической терапии генитоуринарного менопаузального синдрома эстриолом // Вопросы гинекологии, акушерства и перинатологии, 2022, Т. 21, №6, С. 65–72 DOI: 10.20953/1726-1678-2022-6-65-72
12. Плотников А. О., Селиванова Е.А., Хлопко Ю.А., Воронов Д.А., Маторин Д.Н., Тодоренко Д.А., Краснова Е.Д. Структура и функционирование планктонных сообществ фототрофных и миксотрофных протистов в прибрежной лагуне “Озеро Кисло-Сладкое” (Белое море, Карельский берег) // Известия Российской академии наук. Серия географическая. 2022, Т. 86, №6, С. 985-1001. DOI: 10.31857/S2587556622060127
13. Челпаченко О.Е., Данилова Е.И., Чайникова И.Н., Иванова Е.В., Перунова Н.Б. Эфирные масла лекарственных растений в коррекции микробиоценоза верхних дыхательных путей у детей с риносинуситом. Вопросы практической педиатрии. 2021, Т.16, №6, С.112–121. DOI: 10.20953/1817-7646-2021-6-112-121.  (Не учтена в 2021 году)
14. Gerasimova E.A. Two new brackish-water species of centrohelid heliozoans (Haptista: Centroplasthelida), Choanocystis mylnikovi sp.n. and C. punctata sp.n., from Russia. Protistology. 2022, 16(1), pp.10-20 DOI: 10.21685/1680-0826-2022-16-1-2

Публикации в зарубежных изданиях, включенных в систему цитирования Web of Science

1. Andryuschenko S.V., Ivanova E.V., Perunova N.B., Bukharin O.V., Zdvizhkova I.A. Genome sequence data and properties of Bifidobacterium bifidum strain ICIS-504 isolated from multispecies bifidobacterial community. Data in Brief. 2022, V.14, №45, Р.108672. DOI: 10.1016/j.dib.2022.108672.
2. Ignatenko M., Yatsenko-Stepanova T.N., Kapustin D. Morphological variability of stomatocyst 131 Pang & Wang (Chrysophyceae) from a freshwater shallow lake in South Urals, Russia. Phytotaxa. 2022. V.542, №1, P.100-104. DOI: 10.11646/phytotaxa.542.1.10
3. Ignatenko M., Yatsenko-Stepanova T.N., Kapustin D. Additions to chrysophycean  stomatocyst flora from South Urals shallow lake including descriptions of three new morphotypes. Phytotaxa 2022. V.561, №1, P.014-026. DOI: 10.11646/phytotaxa.561.1.2
4. Bukharin O.V., Perunova N.B., Ivanova E.V., Chaynikova I.N., Bekpergenova A.V., Bondarenko T.A., Kuzmin M.D. Semen microbiota and cytokines of healthy and infertile men. Asian Journal of Andrology. 2022, V.24, №4, Р. 353-358. DOI: 10.4103/aja202169
5. Gladysheva I.V., Chertkov K.L., Cherkasov S.V., Khlopko Y.A., Kataev V.Y., Valyshev A.V. Probiotic Potential, Safety Properties, and Antifungal Activities of Corynebacterium amycolatum ICIS 9 and Corynebacterium amycolatum ICIS 53 Strains. Probiotics Antimicrob. Proteins. 2021. Nov 22. DOI:  10.1007/s12602-021-09876-3. (Не учтена в 2021 году)
6. Parfenova L.V., Galimshina Z.R., Gil’fanova G.U., Alibaeva E.I., Danilko K.V., Pashkova T.M., Kartashova O.L., Farrakhov R.G., Mukaeva V.R., Parfenov E.V., Valiev R.Z., Nagumothu B. Hyaluronic acid bisphosphonates as antifouling antimicrobial coatings for peo-modified titanium implants. Surfaces and Interfaces. 2022, V. 28. P. 101678. DOI: 10.1016/j.surfin.2021.101678
7. Galimshina Z.R., Gil’Fanova G.U., Parfenova L.V., Alibaeva E.I., Pashkova T.M., Kartashova O.L. Synthesis of conjugates of  hyaluronic acid with amino acid bisphosphonates as antimicrobial organic coatings for peo-modified titanium implants. AIP Conrefence Proceeding. 2022. P. 020018. DOI: 10.1063/5.0069154
8. Poshvina D.V., Efimenko T.A., Demiankova M.V., Glukhova A.A., Ivankova T.D., Efremenkova O.V., Sadykova V.S., Balkin A.S., Vasilchenko A.S. Complete Genome Sequences of Streptomyces albus Strain INA 01303. Microbiology Resource Announcements. 2022, e0099122. DOI: 10.1128/mra.00991-22
9. Gladysheva I.V., Cherkasov S.V., Khlopko Y.A., Plotnikov A.O.  Genome Characterization and Probiotic Potential of Corynebacterium amycolatum Human Vaginal Isolates. Microorganisms. 2022, V.10, №2, Р.249. DOI: 10.3390/microorganisms10020249
10. Gladysheva I.V., Khlopko Y.A, Cherkasov S.V, Kataev V.Ya. Genome sequence of Corynebacterium amycolatum ICIS 99 isolated from human vagina reveals safety and beneficial properties. Archives of Microbiology. 2022, V.204, №4, P.226. DOI: 10.1007/s00203-022-02852-7
11. Kovaleva O.V., Podlesnaya P., Sorokin M., Mochalnikova V., Kataev V., Khlopko Y.A., Plotnikov A.O., Stilidi I.S., Kushlinskii N.E., Gratchev A. Macrophage Phenotype in Combination with Tumor Microbiome Composition Predicts RCC Patients’ Survival: A Pilot Study. Biomedicines. 2022, № 10, Р. 1516. DOI: 10.3390/biomedicines10071516
12. Sizova E., Yausheva E., Marshinskaia O., Kazakova T., Khlopko Y., Lebedev S. Elemental composition of the hair and milk of black-spotted cows and its relationship with intestinal microbiome reorganization. Veterinary World. 2022. V.15, №11, P.2565–2574 DOI: 10.14202/vetworld.2022.2565-2574
13. Gerasimova E.A., Radaykina L.V., Zagumyonnyi D.G., Tikhonenkov D.V., Drachko D., Zlatogursky V.V. Morphology and spicules elemental composition of Marophrys nikolaevi spec. nov. (Haptista: Centroplasthelida). European Journal of Protistology. 2022, V.84: 125888 DOI: 10.1016/j.ejop.2022.125888

Публикации в прочих журналах

1. Немцева Н.В. Паразитизм как форма симбиотических отношений. Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. 2022, №4, 24с. [Электр. ресурс] (URL: http://elmag.uran.ru:9673/magazine/Numbers/2022-4/Articles/NVN-2022-4.pdf). DOI: 10.24411/2304-9081-2022-14001
2. А.В. Валышев Антагонистические взаимоотношения Pseudomonas aeruginosa с другими микроорганизмами. Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. 2022. 4: 9с.[Электр. ресурс] DOI: 10.24411/2304-9081-2022-14002
3. Миндолина Ю.В. Применение сканирующей электронной микроскопии для исследования протистов меромиктических водоемов Арктики. Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. 2022. 4: 9с. [Электр. ресурс] (URL: http://elmag.uran.ru:9673/ magazine/Numbers/2022-4/Articles/MYV-2022-4.pdf). DOI: 10.24411/2304-9081-2022-14003
4. Катаев В.Я. Оптимальный метод пробоподготовки клеток грамотрицательных бактерий для сканирующей электронной микроскопии. Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. 2022. 3: 9 с. [Электр. ресурс] (URL: http://elmag.uran.ru:9673/magazine/Numbers/ 2022-3/Articles/VYK-2022-3.pdf). DOI: 10.24411/2304-9081-2022-13003
5. Черкасова Ю.И., Мячина Ю.Л., Крайникова Д.А. Современные представления о возбудителе урогенитального трихомониаза. Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. 2022. 3: 22с. [Электр. ресурс] (URL: http://elmag.uran.ru:9673/magazine/Numbers/2022-3/ Articles/CYI-2022-3.pdf). DOI: 10.24411/2304-9081-2022-13004
6. Игнатенко М.Е. Методы подготовки водорослей к исследованию с использованием сканирующей электронной микроскопии. . Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. 2022. 4. 8с. [Электр. ресурс] (URL: http://elmag.uran.ru:9673/magazine/Numbers/ 2022-2/Articles/IME-2022-2.pdf). DOI: 10.24411/2304-9081-2022-12003
7. Инчагова К.С. Комбинирование малых молекул растительного происхождения приводит к усилению QS-ингибирующего действия в отношении системы «quorum sensing» Chromobacterium substsugae. Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН 2022. 1: 6c. [Электр. ресурс] (URL: http://elmag.uran.ru:9673/magazine/Numbers/2022-1/Articles/ IKS-2022-1.pdf) DOI: 10.24411/2304-9081-2022-11003.

Статьи в отечественных научных журналах, входящих в перечень ВАК

1. Карташова О.Л., Пашкова Т.М., Пашинина О.А., Морозова Н.В. Антицитокиновая активность и способность к продукции цитокиноподобных веществ стафилококков, выделенных из секрета предстательной железы у мужчин с симптомами урогенитальной инфекции. Российский иммунологический журнал. 2021. Т. 24. 2: 257-260. (https://doi.org/10.46235/1028-7221-995-AAA)
2. Гриценко В.А., Тяпаева Я.В., Зурочка А.В., Добрынина М.А. Сравнительный анализ бактерицидных свойств синтетического пептида активного центра ГМ-КСФ – ZP2 в отношении грамотрицательных бактерий разной таксономической принадлежности. Российский иммунологический журнал. 2021. Т. 24, №2: 221-228. DOI: 46235/1028-7221-1016-CAO
3. Кочкина Е.Е., Карташова О.Л., Сычева М.В. Антииммуноглобулиновая активность бактерий рода Enterococcus, выделенных от животных. Достижения науки и техники АПК. 2021. 35. 1: 43-47. (DOI: 24411/0235-2451-2021-10108).
4. Бекпергенова А.В., Бондаренко Т.А., Перунова Н.Б., Челпаченко О.Е., Никифоров И.А. Связь показателей спермограммы мужчин с хроническим бактериальным простатитом с уровнем локальных антимикробных факторов. Российский иммунологический журнал. 2021, 24(2). С. 291-296. https://doi.org/10.46235/1028-7221-1029-RBS

Статьи в отечественных научных журналах, включенные в систему цитирования Web of Science/ Scopus.

1. Семенов А.В. Пептидогликан клеточных стенок бактерий влияет на конкурентные свойства микроорганизмов //Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. – 2021. – Т. 172. – №. 8. – С. 193-197. DOI: 10.47056/0365-9615-2021-172-8-193-197
2. Олейник В.В., Кремлева Е.А., Семёнов А.В., Сгибнев А.В. Интравагинальная пробиотическая терапия как способ управления ВПЧ-инфекцией женских гениталий. Вопросы гинекологии, акушерства и перинатологии. – 2021. Т. 20. — №3.  С.37–41. DOI: 10.20953/1726-1678-2021-3-37-41
3. Пашкова Т.М., Морозова Н.В., Кузьмин М.Д., Карташова О.Л., Попова Л.П. Характеристика патогенного потенциала Escherichia coli, выделенных у пациентов с калькулезным пиелонефритом. Урология.2021.4:19-24.DOI: https://dx.doi.org/10.18565/urology.2021.4.19-24
4. Зурочка А.В., Зурочка В.А., Добрынина М.А., Гриценко В.А.  Иммунобиологические свойства гранулоцитарно-макрофагального колониестимулирующего фактора и синтетических пептидов его активного центра. Медицинская иммунология. 2021. Т. 23. 5: 1033-1056. (DOI: 10.15789/1563-0625-IPO-2216)
5. Челпаченко О.Е., Фисенко А.П., Данилова Е.И., Никифоров И.А., Перунова Н.Б., Иванова Е.В., Чайникова И.Н. Прогнозирование развития реактивного артрита у детей с дисплазией соединительной ткани. Вопросы практической педиатрии. 2021. 16 (4): 54-61. DOI: 10.20953/1817-7646-2021-4-54-61
6. Deryabin, DG , Galadzhieva, AA , Kosyan, DB, Duskaev, GK. Plant-Derived Inhibitors of Density-Dependent Communication in Bacteria: Diversity of Structures, Bioactivity Mechanisms, and Sources of Origin. MICROBIOLOGY 90. 6: 702-720 DOI 10.1134/S0026261721060059
7. Игнатенко М.Е., Яценко-Степанова Т.Н., Уржумов А.А. Новые находки видов рода Mallomonas (Chrysophyceae, Synurales) для Оренбургской области (Южный Урал, Россия) // Новости систематики низших растений. 2021. 55(2): 315–323. https://doi.org/10.31111/nsnr/2021.55.2.315.
8. Gerasimova E.A. Morphology and species composition of centrohelid heliozoans (Centroplasthelida) from the continental lowland river with salinity gradient // Inland Water Biology. 2021. Vol. 14. P. 652-661. https://doi.org/10.1134/S1995082921060043
9. Щуплова Е.А., Кузьмин М.Д. Оценка антибиотикочувствительности микроорганизмов, выделенных от больных с острым пиелонефритом в стадии гнойного воспаления, при их  внутриэритроцитарной локализации (эксперимент in vitro) // Урология, 2021, 6, стр. 25-29.
10. Челпаченко О.Е., Данилова Е.И., Чайникова И.Н. Элиминационно-ирригационная терапия для поддержания гомеостаза носовой полости у детей раннего возраста. Медицинский совет. 2021;(1):50–58. doi: 10.21518/2079-701X-2021-1-50-58.
11. Олейник В.В. , Кремлева Е.А., Сгибнев А.В. Влияние интравагинальной пробиотической терапии на течение папилломавирусной инфекции // Бюллетень сибирской медицины. 2021; 20 (4): 11–17; https://doi.org/10.20538/1682-0363-2021-4-11-17
12. Бухарин О.В., Андрющенко С.В., Перунова Н.Б., Иванова Е.В. Механизмы персистенции индигенных бифидобактерий под действием ацетата в кишечном биотопе человека. Журнал микробиологии, эпидемиологи и иммунобиологии. 2021, 98(3). С. 276 – 282. DOI: https://doi.org/10.36233/0372-9311-86

Публикации в зарубежных изданиях, включенных в систему цитирования Web of Science, иных системах цитирования

1. Sycheva M.V., Popova E.V., Khlopko Y.A., Pashkova T.M., Kartashova O.L., Kataev V.Y., Gerasimenko V.V., Vasilchenko A.V. Genome analysis of the probiotic strain Enterococcus faecium Ef79OSAU. Microbiology Resource Announcements. 2021. 10: e00691-21. https://doi.org/ 10.1128/MRA.00691-21.
2. Tinkov A.A., Martins A.C., Avila D.S., Gritsenko V.A., Skalny A.V., Santamaria A., Lee E., Bowman A.B., Aschner M. Gut microbiota as a potential player in Mn-induced neurotoxicity. Biomolecules. 2021. 11: 1292. (https://doi.org/10.3390/biom11091292).
3. Alekseenko S.I., Skalny A.V., Karpischenko S.A., Tinkov A.A. Serum, Whole Blood, Hair, and Mucosal Essential Trace Element and Mineral Levels in Children with Verified Chronic Rhinosinusitis Undergoing Functional Endoscopic Sinus Surgery. Biological Trace Element Research. 2021. 199(6): P.2112-2120. DOI: 10.1007/s12011-020-02333-2
4. Skalny A.V., Aschner M., Lei X.G., Gritsenko V.A., Santamaria A., Alekseenko S.I., Prakash N.T., Chang J.-S., Sizova E.A., Chao J.C.J., Aaseth J., Tinkov A.A. Gut Microbiota as a Mediator of Essential and Toxic Effects of Zinc in the Intestines and Other Tissues. International Journal of Molecular Sciences. 2021. 22: 13074. https:// doi.org/10.3390/ijms222313074.
5. Balkin A.S., Plotnikov A.O., Gogoleva N.E., Gogolev Y.V., Demchenko K.N., Cherkasov S.V. Cappable-Seq Reveals Specific Patterns of Metabolism and Virulence for Salmonella Typhimurium Intracellular Survival within Acanthamoeba castellanii. Int. J. Mol. Sci. 2021. V. 22. №16. P. 9077. https://doi.org/10.3390/ijms22169077
6. Kovaleva, O., Podlesnaya, P., Rashidova, M., Samoilova, D., Petrenko, A., Mochalnikova, V., Kataev, V., Khlopko, Y., Plotnikov, A., & Gratchev, A. (2021). Prognostic significance of the microbiome and stromal cells phenotype in esophagus squamous cell carcinoma. Biomedicines, 9(7). https://doi.org/10.3390/biomedicines9070743
7. Ferrer B, Prince, LM, Tinkov, AA., Santamaria A, Bowman AB, Aschner M (3) Chronic exposure to methylmercury disrupts ghrelin actions in C57BL/6J mice. FOOD AND CHEMICAL TOXICOLOGY, 2021 (JAN), 147, Номер статьи 111918 DOI 10.1016/j.fct.2020.111918
8. Ignatenko M. E., Selivanova E. A., Khlopko Y. A.,  Yatsenko-Stepanova T. N. Algal and cyanobacterial diversity in saline rivers of the Elton Lake Basin (Russia) studied via light microscopy and next-generation sequencing // Biosystems Diversity. 2021. 29(1): 59–66. doi:10.15421/012108
9. Ignatenko M.E., Yatsenko-Stepanova T.N., Kalmykova O.G. 2021. The first evidence about the algae flora of the reservoirs of the «Aschisayskaya Steppe» plot (State Nature Reserve «Orenburgsky») // В сборнике BIO Web of Conferences «Northern Asia plant diversity: current trends in research and conservation»: 38, 00042. DOI: https://doi.org/10.1051/bioconf/20213800042
10. Filatov A.V., Perepelov A.V., Shashkov A.S., Burygin G.L., Gogoleva N.E., Khlopko Y.A., Grinev V.S. Structure and genetics of the O-antigen of Enterobacter cloacae K7 containing di-N-acetylpseudaminic acid. Carbohydrate Research. 2021. Vol. 508. P. 108392. https://doi.org/10.1016/j.carres.2021.108392.
11. Orlova E.A., Ogarkov O.B., Suzdalnitskiy A.E., Khromova P.A., Sinkov V.V., Plotnikov A.O., Belkova N.L., Zhdanova S.N. Analysis of microbial diversity in the caseous necrosis of the tuberculosis foci. Molecular Genetics, Microbiology and Virology. 2021. Vol. 39(3). P. 18–24. https://doi.org/10.17116/molgen20213903118
12. Zhurlov O.S. Monitoring of Microbial Communities of Surface Soil // “Fundamental and Applied Scientific Research in the Development of Agriculture in the Far East (AFE 2021)” Earth and Environmental Science (EES IOP).
13. Zakharyuk, A, Valyshev, A, Plotnikov, A, Kopitsyn, D, Suzina, N, Shcherbakova, V. Trichococcus shcherbakoviae subsp. psychrophilus subsp. nov., a psychrotolerant facultative anaerobe isolated from a cold spring.  INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY, 2021, 71, 10, DOI 10.1099/ijsem.0.005068
14. Aschner, M, Nguyen, TT, Sinitskii, AI, Santamaria, A, Bornhorst, J, Ajsuvakova, OP, Skalny, AV, Tinkov, AA (2). Isolevuglandins (isoLGs) as toxic lipid peroxidation byproducts and their pathogenetic role in human diseases. FREE  RADICAL BIOLOGY AND MEDICINE, 2021 (JAN), 162, P.266-273. DOI 10.1016/j.freeradbiomed.2020.10.024
15. Ferrer B., Prince, LM, Tinkov, AA (3), Santamaria A, Farina, M, Rocha, JB, Bowman, AB, Aschner, M (2). Chronic exposure to methylmercury enhances the anorexigenic effects of leptin in C57BL/6J male mice. FOOD AND CHEMICAL TOXICOLOGY. 2021 (JAN), 147, 111924, DOI 10.1016/j.fct.2020.111924
16. Amelia Faradina,  Sung-Hui Tseng, Te-Hsuan Tung,  Shih-Yi Huang, Yu-Chieh Lee,  Anatoly V. Skalny, Alexey A. Tinkov , Seu-Hwa Chen, Yung-Kun Chuang^j  and  Jung-Su Chang. High-dose ferric citrate supplementation attenuates omega-3 polyunsaturated fatty acid biosynthesis via downregulating delta 5 and 6 desaturases in rats with high-fat diet-induced obesity // Food & Function, 2021,12, 11819-11828 DOI https://doi.org/10.1039/D1FO02680A 

Публикации в прочих журналах

1. Валышев А.В., Валышева Н.А. Встречаемость Exophiala dermatitidis в образцах фекалий человека и животных. Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. 2021. 2: 6с. [Электронный ресурс]
2. Bukharin O.V., Perunova N.B., Deep P.-T., Ivanova E.V. Covid And Oxytocin: Looking For Microbial Symbiosis. Morecambe Bay Medical Journal. 2021, 8 (10). p. 279 – 283. https://doi.org/10.48037/mbmj.v8i10.1312

Публикации в отечественных научных изданиях, включенных в систему цитирования  Web of Science / Scopus

1. Сгибнев А. В., Кремлева Е. А. Медиаторы воспаления как регуляторы устойчивости микробиоты к действию повреждающих факторов //Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. 2020. Т. 170. №. 7. С. 61-65.
2. Олейник В.В., Кремлева Е.А., Сгибнев А.В. Влияние нормальной микрофлоры влагалища на течение папилломавирусной инфекции // Вопросы гинекологии, акушерства и перинатологии. 2020. Т. 19, №4, С. 63–69. DOI: 10.20953/1726-1678-2020-4-63-69.
3. Бухарин О.В., Перунова Н.Б., Чайникова И.Н., Иванова Е.В., Андрющенко С.В. Ускоренный метод определения «свой-чужой» микроорганизмов в реакции агглютинации // Инфекция и иммунитет. 2020; Т. 10, № 4. С. 792–796. https://doi: 10.15789/2220-7619-AAM-1482.
4. Бухарин О.В., Кузьмин М.Д., Перунова Н.Б., Иванова Е.В., Бекпергенова А.В., Бондаренко Т.А. Характеристика микробиоты и цитокинового профиля спермоплазмы у больных хроническим бактериальным простатитом. Урология. 2020;5:67-72 https://doi: 10.18565/urology.2020.5.67-72.
5. Shayhutdinova A.A., Krivosheina M.G. 2020. Invertebrate animals of hyperhaline reservoirs of the Orenburg Region (Russia) // Russian Entomol. J. Vol.29. No.3. P.337–342. doi: 10.15298/rusentj.29.3.15.
6. Дерябин Д.Г., Галаджиева А.А., Дускаев Г.К. Скринин гпроизводныхn-гексанамида и 2h-1,3-бензодиаксола как модуляторов «кворум сенсинга» у Сhomobacterium violaceum // Микробиология. – 2020. – т. 89. – № 6.  с. 728-736
7. Зурочка В.А., Забков О.И., Добрынина М.А., Гриценко В.А., Давыдова Е.В., Чукичев А.В., Забокрицкий Н.А., Сарапульцев А.П., Зурочка А.В. Иммунологические критерии эффективности комплексной этиопатогенетической терапии у больных хронической вирусной инфекцией, ассоциированной с вирусом Эпштейна–Барр. Инфекция и иммунитет. 2020. Т.10. № 2. С. 338-346. (https://doi.org/10.15789/2220-7619-CDC-1141)

Публикации в зарубежных научных изданиях, включенных в систему цитирования Web of Science / Scopus

1. Sgibnev A., Kremleva E. Probiotics in addition to metronidazole for treatment Trichomonas vaginalis in the presence of BV: a randomized, placebo-controlled, double-blind study // European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases. Vol. 39. №2. Р. 345-351. DOI: 10.1007/s10096-019-03731-8.
2. Timokhina T.H, Perunova N.B., Malyugina O.A. Khamitova I., Maslova Important Aspects of Staging of Biofilm’s Formation and Justification of Time Intervals of Conduction of Prophylactics of Infectious Complications. Journal of Biomimetics, Biomaterials and Biomedical Engineering. 2020, 46. 17-24. 10.4028/www.scientific.net/JBBBE.46.17.
3. Kashkak E.S., KataevV.Ya.,Khlopko Y.A., Budagaeva V.G., Danilova E.V., Oorzhak U.S., Dagurova O.P., Plotnikov A.O. Data on draft genome sequence of Stenotrophomonas sp. SAM-B isolated from a mineral cold spring located in Tyva, Southern Siberia // Data in Brief, 2020, DOI: 10.1016/j.dib.2020.106278.
4. Kovaleva O., Podlesnaya P., Rashidova M., Samoilova D., Petrenko A., Zborovskaya I., Mochalnikova V., Kataev V., Khlopko Y., Plotnikov A., Gratchev A. Lung Microbiome Differentially Impacts Survival of Patients with Non-Small Cell Lung Cancer Depending on Tumor Stroma Phenotype // Biomedicines 2020, 8(9), 349. DOI:10.3390/biomedicines8090349.
5. Ivanova E.V., Bekpergenova A.V., Perunova N.B., Andryuschenko S.V., Bondarenko T.A., Bukharin O.V. Genome sequence data of Lactobacillus ruminis ICIS-540, isolated from the intestine of a healthy woman. // Microbiology Resource Announcements 2020. 9:e00900-20. https://doi.org/10.1128/MRA.00900-20.
6. Natalia E. Gogoleva, Tatiana A. Konnova, Timur T. Ismailov, Alexander S. Balkin, Andrey A. Belimov, Yuri V. Gogolev. Dataset for transcriptome analysis of abscisic acid degrading bacterium Novosphingobium sp. P6W // Data in Brief (2020). 28: 105001. https://doi.org/10.1016/j.dib.2019.105001.
7. Natalia E. Gogoleva, Tatiana A. Konnova, Alexander S. Balkin, Andrey O. Plotnikov, Yuri V. Gogolev. Transcriptomic data of Salmonella enterica enterica serovar Typhimurium str. 14028S treated with novobiocin // Data in Brief (2020). 29: 105297. https://doi.org/10.1016/j.dib.2020.105297.
8. Natalia E. Gogoleva, VladimirYa. Kataev, Alexander S. Balkin, Andrey O. Plotnikov, Elena I. Shagimardanova, Anastasia M. Subbot, Sergey V. Cherkasov, Yuri V. Gogolev. Dataset for transcriptome analysis of Salmonella enterica enterica serovar Typhimurium strain 14028S response to starvation // Data in Brief (2020) 31:106008. https://doi.org/10.1016/j.dib.2020.106008.
9. Sinkov V.V., Ogarkov O.B., Plotnikov A.O., Gogoleva N.E.,Zhdanova S.N., Pervanchuk V.L., Belkova N.L., Koshcheev M.E., Thomas T.A., Liu J., Zorkaltseva E.Y., Heysell S.K. Metagenomic analysis of mycobacterial transrenal DNA in patients with HIV and tuberculosis coinfection // Infection, Genetics and Evolution. Vol. 77, Jan. 2020, 104057.
10. Gogoleva O.A., Shchuplova E.A. The influence of non-tuberculous mycobacteria on the interaction of opportunistic microorganisms with erythrocytes // Folia Microbiologica Т.65, V.2, P 417-421, 2020, https://doi.org/10.1007/s12223-019-00748-6.
11. Kataev V.Y.,Sleptsov I.I., Martynov A.A., Aduchiev B.K., Khlopko Y.A., Miroshnikov S.A., Cherkasov S.V., Plotnikov A.O. Data on rumen and feces microbiota profiles of Yakutian and Kalmyk cattle revealed with high-throughput sequencing of 16S rDNA amplicons and data analysis // Data in Brief, 2020
12. Skalny A.V., Rink L., Ajsuvakova O.P., Aschner M., Gritsenko V.A., Alekseenko S.I., Svistunov A.A., Petrakis D., Spandidos D.A., Aaseth J., Tsatsakis A., Tinkov A.A. Zinc and respiratory infections: Perspectives for COVID-19 (Reveiw). //International Journal of Molecular Medicine. 2020. 46: 17-26. (https://doi.org/10.3892/ijmm.2020.4575).
13. Ke T., Santamaria A., Tinkov A.A., Bornhorst J., Aschner M. Generating Bacterial Foods in Toxicology Studies with Caenorhabditis elegans. // Current Protocols in Toxicology. 2020. 84(1), e94. https://doi.org/10.1002/cptx.94.
14. Noor Rohmah Mayasari, Dang Khanh Ngan Ho, David J. Lundy, Anatoly V. Skalny, Alexey A. Tinkov, I-Chun Teng, Meng-Chien Wu, Amelia Faradina, Afrah Zaki Mahdi Mohammed, Ji Min Park, Yi Jing Ngu, Sabrina Aline, Naila Maya Shofia, Jung-Su Chang. Impacts of the COVID-19 Pandemic on Food Security and Diet-Related Lifestyle Behaviors: An Analytical Study of Google Trends-Based Query Volumes. // Nutrient. 2020. 12; 3103 (https://doi.org/10.3390/nu12103103).
15. Sycheva M.V., Popova L.P., Pashkova T.M., Khlopko Y.A., Kartashova O.L., Andreeva A.V., Poshvina D.V. Genomic seguence of the strain Enterococcus faecium ICIS 18. //Microbiology Resource Announcements. 2020. T.9. № 2. e 01349-19.
16. Markov A.A, Timokhina T.H, Perunova N.B., Malyugina O.A. Production Technique of Bifidobacterium’s Exo-metabolites with High Antimicrobial Activity towards Staphylococcus aureus. //Systematic Review Pharmacy, 2020, 11(2): 273-277. doi:10.5530/srp.2020.2.42.
17. Gerasimova E.A., Plotnikov A.O., Khlopko Y.A., Zlatogursky V.V. Multiple Euryhaline Lineages of Centrohelids (Haptista: Centroplasthelida) in Inland Saline Waters Revealed with Metabarcoding // Journal of Eukaryotic Microbiology (2020) 67: 223-231. https://doi.org/10.1111/jeu.12776.
18. Ignatenko M.E., Yatsenko-Stepanova  T.N.,  Kalmykova O.G. Structural and functional characteristics of algae flora in water bodies of the natural monuments in Orenburg forest steppe Trans Volga region (Russia) // BIO Web of Conferences «Plant Diversity: Status, Trends, Conservation Concept», E.V. Banaev, M.A. Tomoshevich and Y.G. Zaytseva (Eds.). Vol. 24, 2020. C. 00027.DOI: https://org/10.1051/bioconf/20202400027.
19. KochkinaЕ., TorshkovА., Kislinskaya L., Kartashova O., Sycheva M. The change in the energy metabolism of broiler chickens under the influence of Enterococcus faecium ICIS 96, Issue E3S Web Conf. Volume 210, 2020. Р.11. https://doi.org/10.1051/e3sconf/202021006008