Лаборатория инфекционной симбиологии

Важнейшие результаты

Важнейшие фундаментальные результаты:

Изучение регуляции персистенции микроорганизмов при инфекции выявило биокоммуникативную функцию бактерий в условиях микросимбиоценоза, позволяющую обосновать как симбиотический подход, так и создание нового направления – «инфекционная симбиология» (2016, 2021).

Способность бифидобактерий распознавать чужеродность микроорганизмов через их метаболическую активность в условиях пары «доминант-ассоциант» — ключевое звено в регуляции гомеостаза кишечного биотопа хозяина (2017, 2019).

С позиции инфекционной симбиологии сформированы представления о взаимодействии в треугольнике «ГГНС (гипоталамо-гипофизарная нейросекреторная система) – окситоцин – микробиота». С одной стороны, окситоцин снижает антибиотикорезистентность и оказывает антиперсистентное действие в отношении патогенов, с другой – нормобиота (бифидо- и лактобактерии) способна стимулировать продукцию окситоцина через ГГНС, реализуя свои биоэффекты в организме хозяина (регуляция иммунитета, репродуктивное здоровье, метаболические изменения при ожирении, поведенческие реакции и др.) (2018, 2020).

Важнейшие прикладные результаты:

Разработан комплекс мазевых композиций для лечения гнойно-воспалительных заболеваний кожи и мягких тканей (патенты РФ № 2306947; 2466720, 2764574). Совместные исследования с Институтом органического синтеза им. И.Я. Постовского (Екатеринбург). Получены опытные образцы продукта. Золотая медаль XVII Московского международного салона изобретений и инновационных технологий «Архимед -2014» (Москва, 2014), дипломы на «Inventions de Geneve 2014» и «MEDICA 2014».

Создан биосовместимый комплекс пробиотических бактерий мишень-направленного действия (антимикробная, противовоспалительная и регенераторная активность). (пат. РФ № 2670054, 2676910, 2678123, свидетельство о государственной регистрации программы для ЭВМ № 2018660685). Получен опытный образец продукта. Золотая медаль на XII Ярмарке стартовых инновационных проектов и компаний «Российским инновациям — российский капитал» (Нижний Новгород, 2014), золотая медаль на Международной выставке-конференции «Биоиндустрия 2017» (Санкт-Петербург, 2017).

Разработана экспресс-система множественного ПЦР-мониторинга патогенного потенциала энтеробактерий «PERSISTEST» (пат. РФ № 2662930). Совместные исследования с ООО «Люмэкс» (Санкт-Петербург). ПЦР-микрочип для амплификатора реального времени «AriaDNA». Золотая медаль на Международной выставке-конференции «Биоиндустрия 2017» (Санкт-Петербург, 2017).

Основные публикации:

1. Бухарин О. В., Андрющенко С. В., Перунова Н. Б., Иванова Е. В. Экологическая детерминация индигенных бифидобактерий кишечника человека // Вестник РАН, 2022, T. 92, № 9, стр. 869-876. doi: 10.31857/S0869587322090055.
2. Bukharin O.V., Perunova N.B., Ivanova E.V., Chaynikova I.N., Bekpergenova A.V., Bondarenko T.A., Kuzmin M.D. Semen microbiota and cytokines of healthy and infertile men. Asian Journal of Andrology. 2022, 23:1-6. doi:10.4103/aja202169
3. Bukharin O.V. Natural Mechanisms that Underlie the Defense of Host Organisms against Infections// Herald of the Russian Academy of Sciences, 2019, Vol. 89, No. 4, pp. 426–431. doi: 10.1134/S1019331619040014
4. Бухарин О.В., Перунова Н.Б. Симбиотические взаимоотношения человека и микроорганизмов // Физиология человека, 2012. Т. 38. № 1. С. 128 — 138.
5. Бухарин О.В., Стадников А.А., Перунова Н.Б. Роль окситоцина и микробиоты в регуляции взаимодействий про- и эукариот при инфекции: [монография]. Екатеринбург: УрО РАН, 2018. 247 с.
6. Бухарин О. В., Перунова Н. Б., Иванова Е. В. Бифидофлора при ассоциативном симбиозе человека: [монография]. Екатеринбург: УрО РАН, 2014. 212 с.
7. Бухарин О. В., Перунова Н. Б. Микросимбиоценоз: [монография]. Екатеринбург: УрО РАН, 2014. 260 с.
8. Бухарин О. В., Лобакова Е. С., Перунова Н. Б., Усвяцов Б. Я., Черкасов С. В. Симбиоз и его роль в инфекции: [монография]. Екатеринбург: УрО РАН, 2011. 301 с.
9. Бухарин О.В., Гинцбург А.Л., Романова Ю.М., Эль-Регистан Г.И. Механизмы выживания бактерий: [монография]. М.: Медицина, 2005. 364 с.
10. Бухарин О.В. Персистенция патогенных бактерий: [монография]. М.: Медицина, 1999. 367 с.

Оборудование

• Система гель-документирования Vilber Lourmat с камерой горизонтального электрофореза BIO-RAD SubCell GT (Vilber Lourmat, Италия; Bio-Rad, США).
• Спектрофотометр Thermo NanoDrop 8000 (Thermo Fisher Scientific, США)
• Электропоратор BIO-RAD GenePulser Xcell  (Bio-Rad, США)
• Твердотельный термостат Eppendorf ThermoStat plus (EPPENDORF AG, Германия)
• Газовый хроматограф Shimadzu GC-2010 (Shimadzu, Япония)
• Роторный испаритель Heidolph Hei-VAP Precision (Heidolph GmbH, Германия)
• Деионизатор воды II кл. Millipore Elix 3 (Merck Millipore, Франция)
• СO2-инкубатор Binder (Binder, Германия)
• Инвертирован. микроскоп Zeiss AXIO Observer.A1 с CO2-модулем  S1 для AXIO Observer.A1 и температурным модулем  S1 для AXIO Observer.A1 (комплекс) (Carl Zeiss, Германия).