Новости

17 апреля в читальном зале библиотеки ОрГМУ главным научным сотрудником ИКВС академиком РАН О.В.Бухариным была прочитана лекция для студентов «Путь в Науку».

17 апреля в читальном зале библиотеки Оренбургского государственного медицинского университета главным научным сотрудником Института академиком РАН О.В.Бухариным была прочитана популярная лекция для студентов «Путь в Науку».

В лекции Олег Валерьевич Бухарин рассказал студентам об этапах и малоизвестных фактах становления медицинской и микробиологической науки в Оренбурге.

Заключительная часть лекции была посвящена презентации книг и монографий авторства коллектива ИКВС УрО РАН и недавно изданной биографии О.В. Бухарина:

Лекция проведена при содействии сотрудников кафедры иностранных языков ОрГМУ и молодых сотрудников Института:

 

С 23 по 26 апреля д.м.н., член-корр. РАН С.В. Черкасов будет выступать с открытыми лекциями по курсу «Актуальные проблемы биологии и биоинженерии» в ОГУ

Уважаемые коллеги!

С  23 по 26 апреля д.м.н., член-корр. РАН С.В. Черкасов будет выступать с открытыми лекциями по курсу «Актуальные проблемы биологии и биоинженерии» в Оренбургском государственном университете. Лекции будут проходить в библиотеке ОГУ на 7 этаже в аудитории 170704 с 15.00 до 18.10.

Приглашаются все желающие!

Тема Часы Дата и время проведения
1. Система CRISPR-Cas и её значение в биологии и медицине
 
2 23.04.2018
15.00-16.30
ауд. 170704
2 Система секреции бактерий
 
2 23.04.2018
16.40-18.10
ауд. 170704
3 Quorum sensing микроорганизмов и биопленкообразование 2 24.04.2018
15.00-16.30
ауд. 170704
4 Малые молекулы РНК и их регуляторная роль 2 24.04.2018
16.40-18.10
ауд. 170704
5 Система токсин-антитоксин бактерий 2 25.04.2018
15.00-16.30
ауд. 170704
6 Бактериоцины 2 25.04.2018
16.40-18.10
ауд. 170704
7 Стресс у бактерий 2 26.04.2018
15.00-16.30
ауд. 170704

 

ИКВС УрО РАН Объявляет о начале приемной кампании в аспирантуру в 2018 году

Федеральное государственное учреждение науки Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза Уральского отделения Российской академии наук (ИКВС УрО РАН)

Объявляет о начале приемной кампании в аспирантуру в 2018 году

ПРИЕМ В АСПИРАНТУРУ ОСУЩЕСТВЛЯЕТСЯ ПО НАПРАВЛЕНИЮ, ОТКРЫТОМУ В СООТВЕТСТВИИ С ДЕЙСТВУЮЩЕЙ ЛИЦЕНЗИЕЙ:

Лицензия на право ведения образовательной деятельности Федерального государственного учреждения науки Института клеточного и внутриклеточного симбиоза Уральского отделения Российской академии наук (ИКВС УрО РАН)

Серия 90Л01 № 0000116 от 29 мая 2012 г.

В аспирантуру на конкурсной основе принимаются лица, имеющие высшее образование (специалитет или магистратура).

Поступающие в аспирантуру сдают следующие вступительные испытания в соответствии с федеральными государственными образовательными стандартами высшего профессионального образования (уровень специалиста или магистра):

  • — специальную дисциплину (микробиологию)
  • — иностранный язык.

Прием заявлений и документов начинается с 1 июля 2018 г. и заканчивается 15 августа 2018 г.

Подробная информация доступна в разделе «Аспирантура».

В марте 2018 ИКВС УрО РАН был получен патент на изобретение «Средство для селективного влияния на биопленкообразование микрорганизмами»

В марте 2018 ИКВС УрО РАН был получен патент на изобретение «Средство для селективного влияния на биопленкообразование микрорганизмами». В качестве средства, снижающего биопленкообразование патогенными микроорганизмами: Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella pneumoniae, Staphylococcus aureus и др. предложено применение тритерпеноида растительного происхождения милиацина. Средство может найти применение для эффективной профилактики и лечения инфекционных заболеваний.

Формируется 1 выпуск электронного журнала «Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН» за 2018 год

Принимаются статьи на публикацию в электронном журнале «Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН». В стадии формирования 1 выпуск за 2018 год. Статьи для публикации принимаются на электронный адрес vag59@mail.ru. Сайт журнала «Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН» — http://elmag.uran.ru/

Лекция-экскурсия «Введение в биотехнологию»

15 февраля 2018 г. состоялась лекция-экскурсия «Введение в биотехнологию» для группы студентов факультета биотехнологий и природопользования ОГАУ (руководитель группы – О.Н. Михина): в лаборатории биомониторинга и молекулярно-генетических исследований слушатели  узнали об особенностях и практических возможностях создания условий культивирования микроорганизмов и увидели непосредственно в работе предназначенное для этого оборудование: орбитальные шейкер, совмещённый с термостатом (BIOSAN ES-20) как пример простейшего «биореактора», CO2-инкубатор (Binder), применяемый для серийного культирования некоторых облигатно-анаэробных и микроаэрофильных микроорганизмов.

Затем гости узнали о способах консервации биопрепаратов и проблемах «реанимирования» законсервированных микроорганизмов, увидели установку для лиофилизации (Heto Drywinner), вакуумный роторный испаритель (Heidolph) и готовые лиофилизованные препараты  бифидобактерий в ампулах. В заключительной части экскурсии слушателям также было рассказано и о современных методах создания рекомбинантных штаммов, применяемых в биотехнологии, также с демонстрацией соответствующего оборудования: электропоратора (BIO-RAD GenePulser XCell), простейшего ДНК-амплификатора (МС-2), установки для агарозного гель-электрофореза нуклеиновых кислот (BIO-RAD SubCell GT) и её результатов – фореграмм, полученных в установке гель-документирования (Vilber Lourmat).

На 2 квартал 2018 года СМУ ИКВС УрО РАН также запланирована очередная научно-просветительская лекция в Областной универсальной научной библиотеке им. Н.К.Крупской.

 

Торжественное вручение дипломов победителям конкурсов Правительства Оренбургской Области 2017-2018 г.

8 февраля 2018 года в День Российской Науки состоялось очередное торжественное вручение дипломов победителям конкурсов Правительства Оренбургской Области 2017-2018 г.

В числе лауреатов – 12 сотрудников ИКВС УрО РАН. Среди них – 2 коллектива авторов получили премии в сфере науки и техники:

Виктор Александрович Гриценко и Ольга Львовна Карташова – за работу «Характеристика биопрофилей возбудителей инфекционно-воспалительной патологии и регуляция их патогенных свойств»:

Ольга Ефимовна Челпаченко и Елена Ивановна Данилова – за работу «Факторы риска и профилактика воспалительных заболеваний суставов у детей»:

Персональные дипломы получили лауреаты стипендий и премий для молодых ученых – кандидатов и докторов наук: сотрудники Института

д.б.н. Сгибнев Андрей Викторович за работу «Потенцирование активности антимикробных соединений метаболитами нормальной микрофлоры тела человека»:

д.т.н. Хлопко Юрий Александрович за работу «Технико-технологическое обоснование процесса механической обработки кожного покрова животных»:

д.м.н. Перунова Наталья Борисовна за работу «Механизмы образования и функционирование микросимбиоценозов как основа формирования здоровья человека и развития его патологии»:

к.м.н. Селиванова Елена Александровна за работу «Структура микробных сообществ водоемов с высокой минерализацией»:

и к.м.н. Андрющенко Сергей Валерьевич за работу «Гены периплазматических ингибиторов лизоцима в антилизоцимной активности энтеробактерий»:

Всего в 2017 году лауреатами стипендий и премий Правительства Оренбургской Области для молодых кандидатов и докторов наук стали более половины сотрудников ИКВС УрО РАН, подавших заявку на участие в конкурсе.

Приглашаем принять участие в работе IX Российской научной конференции с международным участием «Персистенция и симбиоз микроорганизмов» (г. Оренбург, 25-27 сентября 2018 г.)

Информация о мероприятии

В конференции планируется участие сотрудников ведущих учреждений РАН, вузов, отраслевых НИИ. Конференция предполагает несколько форм работы ученых: секционные заседания с устными докладами ученых, стендовая сессия, круглый стол. Будут представлены работы ученых из разных регионов России, изучающих вопросы персистенции и симбиотических взаимодействий микроорганизмов.

 Организаторами конференции выступают:

  • Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН,
  • Оренбургский научный центр УрО РАН,
  • Федеральное агентство научных организаций (ФАНО России),
  • Уральское территориальное управление ФАНО России,
  • Уральское отделение Российской академии наук,
  • Отделение физиологических наук РАН,
  • Всероссийское научно-практическое общество эпидемиологов, микробиологов и паразитологов,
  • Оренбургское отделение Межрегионального микробиологического общества,
  • Оренбургская региональная общественная организация «Профессиональная ассоциация микробиологов и паразитологов»,
  • Правительство Оренбургской области

 Председатели оргкомитета конференции:

Бухарин Олег Валерьевич – акад. РАН,  главный научный сотрудник ИКВС УрО РАН, (председатель)

Гинцбург Александр Леонидович – акад. РАН, директор Научно-исследовательского института эпидемиологии и микробиологии им. Н.Ф. Гамалеи, (сопредседатель)

 Тематика конференции

В рамках конференции будут рассмотрены вопросы выживания и длительного сохранения микроорганизмов в биологических объектах и во внешней среде, а также проблемы формирования симбиотических систем и различные формы симбиоза. Предполагается обсудить вопросы инфектологии в рамках ассоциативного симбиоза, позволяющие провести параллельную оценку изменений микроорганизмов (их персистентного потенциала) и организма хозяина (его иммунитета) при инфекции. Будут обсуждены вопросы симбиотических взаимодействий доминантных бактерий, ассоциативных микроорганизмов и макроорганизма в реализации колонизационной резистентности. Будет уделено внимание прикладным вопросам диагностики инфекционно-воспалительных заболеваний и коррекции микроэкологических нарушений организма хозяина с учетом выявления нарушений ассоциативного симбиоза. Также будут обсуждаться вопросы формирования ассоциативного симбиоза и его нарушений в природных экосистемах, а также разработке подходов к экологическому мониторингу объектов окружающей среды.

 Основные направления конференции:

  1. Генетические и фенотипические особенности персистирующих микроорганизмов.
  2. Ассоциативный симбиоз как биологическая основа инфекции
  3. Иммунологические и клинические аспекты персистенции и симбиозов микроорганизмов.
  4. Персистенция и симбиоз микроорганизмов в природных сообществах.

 Вы можете зарегистрироваться, заполнив регистрационную форму:

Анкета участника конференции:

  1. Фамилия, Имя, Отчество участника конференции
  2. Ученая степень, ученое звание,
  3. Место работы, должность,
  4. Адрес, контактные телефоны, адрес эл. почты,
  5. Название доклада и авторы
  6. Доклад устный/стендовый
  7. Сообщить о необходимости бронирования номера в гостинице
  8. Пожелания для оргкомитета (организационные и тематические).

Информация о требованиях к материалам конференции будет представлена во втором информационном письме по завершению приема заявок на участие.

Сроки представления регистрационных форм

Заявки на участие принимаются до 1 апреля 2018 г. по адресу 460000, г. Оренбург, ул. Пионерская, д. 11, ком. 321, ИКВС УрО РАН, Селивановой Елене Александровне или по электронному адресу: persist_conf@mail.ru.  

АДРЕС И КОНТАКТНЫЕ ТЕЛЕФОНЫ

  • Адрес Института клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН:
  • 460000, г. Оренбург, ул. Пионерская, 11.
  • Тел.: (3532) 77-54-17; 77-05-12
  • Факс: (3532) 77-44-63
  • E-mail: ikvs@esoo.ru

Контактные данные оргкомитета:

  • тел. (3532) 77-54-17
  • Факс: (3532) 77-44-63
  • E-mail: persist_conf@mail.ru.
  • секретарь оргкомитета — Селиванова Елена Александровна

Информационное письмо доступно по ссылке.

 

В ноябрьском номере газеты «Наука Урала» опубликована статья о Центре коллективного пользования научным оборудованием «Персистенция микроорганизмов» ИКВС УрО РАН»

Одноклеточные животные, относящиеся к подцарству простейших (их латинское название Protozoa произошло от греческих слов, означающих «первый» и «живое существо»), нечасто становятся «героями» научно-популярных публикаций. А между тем простейшие, открытые в конце XVII века изобретателем микроскопа Антони ван Левенгуком, обладают огромным видовым разнообразием. Хотя тело их состоит из одной клетки, у них, как и у сложноорганизованных организмов, есть полноценный обмен веществ, они чутко реагируют на колебания параметров среды, способны к половому и бесполому размножению. В природе простейшие выполняют важные экологические функции: регулируют биомассу бактериальных популяций, служат пищей для микроскопических беспозвоночных, мальков рыб, в качестве симбионтов многоклеточных животных участвуют в круговороте органики. Некоторые их представители (плазмодии, трипаносомы и другие паразиты) являются возбудителями опасных заболеваний человека и животных. В силу всего этого простейшие — объект пристального внимания микробиологов.
В Институте клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН (г. Оренбург) биоразнообразие простейших в природных водоемах и симбиоз простейших с бактериями исследует группа кандидата медицинских наук А.О. Плотникова, который одновременно возглавляет институтский центр коллективного пользования, появившийся в ИКВС в 2014 г. Благодаря основному прибору центра — автоматизированной системе высокопроизводительного секвенирования — оренбургские микробиологи расширили методологию своих исследований и перешли на новый уровень анализа данных.

— Наш секвенатор позволяет выявлять ДНК не известных ранее микроорганизмов, — говорит Андрей Плотников. — Если раньше мы работали с отдельными культурами выделенных микроорганизмов, то теперь у нас есть возможность определять генетический состав микробных сообществ в образцах, взятых из природной среды, и отслеживать их динамику без трудоемкого культивирования. Ведь только 1% микроорганизмов можно вырастить в чистой культуре, т.е. в чашке Петри, а остальные 99% культивировать пока не научились. Это исследования в области метагеномики — нового раздела молекулярной генетики, изучающего набор генов всех микроорганизмов, находящихся в образце окружающей среды, — метагеном. Если же удается получить чистую культуру, то с помощью секвенатора мы можем охарактеризовать ее свойства по расшифрованному геному.
Сейчас мы завершаем анализ сообществ микроорганизмов из водоемов Уральского региона с различной минерализацией:  от солоноватых до суперсоленых рассолов. Мы можем сравнить состав микробных сообществ из уральских водоемов с «микробным населением» водоемов других континентов — Америки, Австралии. Нам удается выделять и описывать новые виды, поскольку соленые озера содержат большое количество неизвестных микроорганизмов. Так, в прошлом году вместе с сотрудницей нашего института Еленой Герасимовой и коллегой из Санкт-Петербургского университета кандидатом биологических наук Василием Златогурским мы описали три новых вида солнечников. Эти простейшие — хищники, они питаются другими мелкими организмами, улавливая их с помощью аксоподий — лучевидных цитоплазматических выростов. Название они получили потому, что клетка солнечника напоминает солнечный диск с лучами.
В соленых реках Приэльтонья — в окрестностях озера Эльтон — сотрудники ИКВС совместно с учеными Института микробиологии РАН (Москва) исследуют цианобактериальные маты. Так называются высокоинтегрированные сообщества микроорганизмов, которые продуцируют огромное количество органического вещества. В результате на дне водоемов формируются толстые слои органики. Нижние слои минерализуются, образуя строматолиты — доломитовые или известковые постройки. Эти окаменевшие структуры часто обнаруживают археологи. Согласно палеонтологическим данным цианобактериальные маты — самая древняя микробная ассоциация, которая появилась на Земле еще в архее.
В наше время цианобактериальные маты занимают экологические ниши, в которых отсутствует или слаба конкуренция со стороны более развитых форм жизни. Они способны выдерживать и экстремально низкие (в Антарктике), и очень высокие температуры (гидротермальные источники), широко распространены в соленых реках и озерах.
— В соленых водоемах эти микробные сообщества гораздо богаче, чем в пресноводных, — поясняет Андрей Плотников. — Здесь в минимальном объеме собраны тысячи видов бактерий, архей, цианобактерий, простейших и водорослей, образующих сложный симбиоз. В озере Эльтон и соленых реках Приэльтонья цианобактериальные маты достаточно тонкие, хотя по остальным характеристикам сопоставимы с аналогичными сообществами в других соленых водоемах. Маты, которые мы изучаем, однолетние, они растут на протяжении теплых летних месяцев, а осенью и зимой их поедают бактерии-деструкторы, так что весной дно озера снова чистое. Многолетние цианобактериальные маты формируются, например, в Сиваше, в содовых озерах Сибири и Средней Азии, но там другой микробный состав и метаболизм.
Мы получили уникальные штаммы простейших и бактерий, которые способны выживать в условиях высокой солености и экстремальных температур, а также в отсутствие кислорода. Их можно использовать в биотехнологических целях.
В нашем ЦКП развивается важнейшее направление геномики, связанное с расшифровкой геномов различных микроорганизмов и имеющее не только фундаментальное значение, но и прикладное — для биотехнологии и медицины. Например, мы расшифровали геномы пробиотических штаммов бифидобактерий и лактобактерий, с которыми работают сотрудники лаборатории биомониторинга и молекулярно-генетических исследований во главе с доктором медицинских наук, профессором РАН Н.Б. Перуновой. Эта информация позволит коллегам предсказывать, какие свойства будут проявлять эти микроорганизмы в тех или иных условиях: насколько они устойчивы к антибиотикам, способны адаптироваться к неблагоприятным факторам среды, каков их метаболический потенциал. 
Сотрудники группы А.О. Плотникова проанализировали также геномы ряда патогенных микроорганизмов, в частности возбудителей дизентерии, выделенных при вспышке этой инфекции в Оренбурге в прошлом году.  Оказалось, что геномы штаммов, полученных от разных больных, идентичны. Это означает, что существовал только один источник инфекции, который и нашли сотрудники Роспотребнадзора. Таким образом, данные геномики подтвердили правильность тактики эпидемиологов.
Большую работу по анализу микробных сообществ в теле человека ученые ИКВС под руководством директора института члена-корреспондента С.В. Черкасова ведут с коллегами из Оренбургского медицинского университета. Например, совместно с сотрудниками кафедры детских болезней, которой руководит доктор медицинских наук, профессор Л.Ю. Попова, они изучили микробный состав зубного налета у детей с бронхиальной астмой, и обнаружили там большое количество условно-патогенных штаммов: численность некоторых видов оказалась  гораздо выше, чем у здоровых детей. Этот фактор теперь будет учитываться в клинической практике.
Один из новых проектов связан с изучением бактериальных сообществ в экссудате поджелудочной железы (жидкости, выделяющейся в ткани или полости организма при воспалении), взятом при оперативном лечении больных, страдающих острым панкреатитом. Оренбургские микробиологи выполняют эти исследования совместно с сотрудниками кафедры факультетской хирургии ОМУ во главе с доктором медицинских наук, профессором  Д.Б. Деминым. В хирургии острый панкреатит до последнего времени считался асептическим процессом, т.е. таким, в котором бактерии участия не принимают. Однако ученым удалось показать, что у подавляющего большинства больных экссудат содержит ДНК нескольких видов микроорганизмов. Это абсолютно новые данные, полученные специалистами ИКВС благодаря секвенатору.
Руководитель институтского ЦКП Андрей Плотников рассказал еще об одном новом проекте:
— При поддержке совместного с коллегами из Санкт-Петербургского университета гранта РНФ мы начали изучать бактерии, которые сохраняются внутри клеток инфузорий — простейших, живущих в водоемах. Первые результаты свидетельствуют, что некоторые из этих бактерий — симбионтов инфузорий являются патогенными для человека. Появилось даже такое понятие, как резервуарный потенциал инфузорий, который поддерживает циркуляцию в природе патогенных и условно патогенных микроорганизмов. Мы планируем получить данные, которые позволят сравнить разные виды инфузорий и выявить наиболее опасные с точки зрения персистенции патогенов.
Вообще проведение совместных исследований с коллегами из других научных учреждений, не только академических, но также вузовских и отраслевых, часто дает синергидный эффект. У нас есть договоры с Оренбургским филиалом МНТК «Микрохирургия глаза» им. академика С.Н. Федорова, Оренбургским государственным университетом, Научным центром проблем здоровья семьи и репродукции человека (г. Иркутск). А недавно нам прислали образцы хемолитотрофных бактерий (микроорганизмов, получающих энергию за счет окисления неорганических соединений) с Камчатки из Научно-исследовательского геотехнологического центра Дальневосточного отделения РАН. Так что география наших научных партнеров постоянно расширяется.
Подготовила
Е. ПОНИЗОВКИНА
Фото на с. 3: верхний снимок — измерение рН
в процессе отбора проб на солоноватых эфемерных водоемах в урочище Тузлукколь (Оренбургская область);
в центре — солнечник;
внизу —сотрудники ЦКП ИКВС «Персистенция микроорганизмов», слева направо: зав. ЦКП, кандидат медицинских наук А.О. Плотников, аспирант А.С. Балкин, ведущий научный сотрудник, кандидат медицинских наук Е.А. Селиванова, научный сотрудник, кандидат биологических наук Д.В. Пошвина;
на этой странице — посев бактерий из оз. Эльтон
и рек Приэльтонья на питательные среды в полевых условиях
 
Оригинал новости: http://www.uran.ru/node/5110

Разработки лабораторий ИКВС УрО РАН второй раз представлены на региональной выставке

ИКВС УрО РАН вновь принял участие в прошедшей 15-17 ноября 2017 г. второй выставке «Медицина, красота и здоровье».

На выставке широкой аудитории потребителей и посетившим выставку специалистам наглядно демонстрировались проекты и продукты разработок Института:

Коллективом лаборатории по изучению механизмов и регуляции персистенции бактерий представлен проект «Дифференциация  микроорганизмов по факторам персистенции»; программы для ЭВМ «Дифференциация Candida albicans по факторам персистенции» и «Дифференциация бактерий рода Enterococcus по способности инактивировать факторы специфического иммунитета»; а также штаммы бактерий Enterococcus faecium, обладающий способностью снижать образование биопленок грибами рода Candida и Staphylococcus aureus, используемый в качестве тест-культуры для отбора антибактериальных средств.

Лабораторией клеточного симбиоза представлена Экспертно-аналитическая программа прогнозирования риска развития инфекционно-воспалительных осложнений у женщин с миомой матки после оперативных вмешательств – «Prognosis v.3.00».

 Лабораторией водной микробиологии представлен штамм одноклеточных водорослей Dunaliella salina IPPAS D 295 — продуцент биологически активных веществ, обладающих антиоксидантной активностью.

От лаборатории  по изучению механизмов формирования микробиоценозов человека представлен проект «Способ усиления адгезии бактерий к вагинальным эпителиоцитам».

И аспиранты лаборатории биомониторинга и молекулярно-генетических исследований представили три проекта: «Экспресс-система множественного ПЦР-мониторинга патогенных микроорганизмов» с образцом диагностического ДНК-микрочипа; «Питательная среда для рекультивации анаэробных микроорганизмов после низкотемпературного хранения» с образцом среды; и «Применение штамма бактерий Bacillus cereus  №279  в качестве продуцента ингибитора цитокина ФНО-α» с лиофилизированной культурой штамма.

Все представленные проекты имеют соответствующие свидетельства либо поданные заявки о регистрации интеллектуальной собственности.

По итогу мероприятия представителям Института был вручен Диплом за активное участие в Выставке:

Дополнительная информация о прошедшем мероприятии доступна по ссылке:

http://1743.ru/news/11123